1 / 31

Identificación de nuevos  biomarcadores mediante proteómica

Módulo Genómica y Proteómica. Identificación de nuevos  biomarcadores mediante proteómica. Maria Erta Cañabate. Concepto de Biomarcador. Cualquier medida que pueda predecir el estado de una enfermedad o la respuesta a un fármaco en un paciente Predecir el futuro !! Muchos tipos distintos.

shea
Download Presentation

Identificación de nuevos  biomarcadores mediante proteómica

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Módulo Genómica y Proteómica Identificación de nuevos biomarcadores mediante proteómica Maria Erta Cañabate

  2. Concepto de Biomarcador • Cualquier medida que pueda predecir el estado de una enfermedad o la respuesta a un fármaco en un paciente • Predecir el futuro!! • Muchos tipos distintos

  3. ¿Pueden proporcionar realmente información relevante de la enfermedad o fármaco lo suficientemente pronto para tomar decisiones sobre proyecto? Entender Caracterizar Validar Caminar sobre hielo fino

  4. Replantearse el concepto de validación de BM por el de cualificación. • Múltiples BM con predictibilidad complementaria • Combinarlos : sensibles-específicos “Solamente cuando el término BM pierda su boom podremos confiar en él”

  5. Dianas terapéuticas • Druggable: capaz de ser modulado por pequeñas moléculas para producir un cambio fenotípico deseado en la célula objetivo • Diana terapéutica: Molécula localizada en cualquier parte de la célula, capaz de reconocer a un fármaco y producir una respuesta celular que modifique el curso de una enfermedad. • Validación diana terap: Proceso que tiene por objeto demostrar que una determinada diana molecular está implicada en la aparición y progresión de una enfermedad. Permite establecer una relación entre la alteración de la diana y su potencial terapéutico.

  6. Una diana es fcmente accesible si una molecula orgánica puede modular su función • 4 tipos de macromolec. con las que pueden interaccionar pequeñas molec. terapéuticas • La regla de los cinco (Lipinski): propiedades fisico-químicas necesarias para que estas molec. terap. sean biodisponibles oralmente • Identificadas 483 dianas y entre 5000 i 10.000 mas estimando el número de genes relacionados con enfermedades

  7. Familia génica: secuencia y funcionalidad similar  conservación sitios de unión  otros miembros de la familia podrían unirse al fármaco. • Número de dianas proteicas potenciales es mayor que el número de genes! • Druggable ≠ diana terap: puedes modular la función pero no obtener una respuesta terapéutica

  8. Genes de enfermedades humanas • Proponen que la clasificación funcional de estos genes y sus productos dará información de la enfermedad • Determinan la categoría funcional de 923 genes de enfermedades • 97% genes que causan enfermedad monogénica • Se excluyen genes asociados solo con enfermedad genética somática y los de genoma mitocondrial

  9. Ensayos de toxicidad • Test actuales: In vivo (problemas)  Cambio: eficiencia industrial, bienestar animal y salud humana. Método integrado • Posibilidades: • Sistemas in vitro • Tecnologías “omics”  BM para variaciones indiv. en la susceptibilidad a tóxicos y como indicadores tempranos de exposición tóxica y efecto • Limitaciones: subfraccionar tejido o muestras celulares, contaminación; patrones de expresión proteica varian mucho en respuesta a ciclos circadiarios, edat, sexo...

  10. Identificación de dianas • Se requieren nuevas aproximaciones para sacar provecho de la revolución genómica • 6000 enfermedades monogénicas pero muchas mas poligénicas • Efectos secundarios • Descubrimiento de nuevos fc es un proceso lento y complicado

  11. Menos de 1/10 proyectos sobreviven las fases clínicas • Menos de 1/50 proyectos llegan al mercado Causas ppales: problemas biológicos asociados con la elección de la diana (poco validada...) y problemas químicos con la molec terap. (toxicidad, poca optimiza...)

  12. Pathways Mapping

  13. TAP + Espectofotometria de mases

  14. Genes asociados a la enfermedad • Expresión génica diferencial en controles vs enfermos. Permite interpretación a un nivel funcional • Mapear las rutas nos permite elegir las dianas mas prometedoras

  15. Conclusiones • Hace falta una estrategia conjunta para explotar el conocimiento de genoma y de las nuevas tecnologías proteómicas para centrarse en las partes relevantes. • Aprovechar todo aquello que nos permita acelerar la producción de nuevos farmacos pero sin olvidar que el objetivo debe ser producir fármacos seguros • Importante papel de los biomarcadores para conseguir dichos objetivos.

  16. Muchas gracias

  17. Propuesta de definición global • Cualquier medida cuantificable (bioquímica, molecular, histológica, fisiológica, genómica, celular, comportamental, etc) de un sistema biológico (gen, proteína, orgánulo, célula, tejido, compartimento, órgano, sistema o incluso individuo) que nos informe, dándonos la magnitud, de la interacción o no de este sistema biológico con una amenaza potencial o real, tanto extrínseca (ej. intoxicación) como intrínseca (predisposición genética a una enfermedad), de cualquier tipo (químico, físico o biológico)

  18. Proteinas !!!! • polisacáridos • lípidos • ácidos nucleídos • Toxicidad • Especificidad • Incapacidad de obtener compuestos potentes

  19. ! ! ! !

More Related