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La iniciativa internacional del GBIF y La criptogamia en España: retos y oportunidades. Francisco Pando GBIF.ES, Unidad de Coordinación [email protected] www.gbif.es. Sumario. Que es GBIF ¿por qué GBIF? Programa de GBIF Implementación de GBIF en España Participación y resultados

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La iniciativa internacional del gbif y la criptogamia en espa a retos y oportunidades

La iniciativa internacional del GBIF y La criptogamia en España: retos y oportunidades

Francisco Pando

GBIF.ES, Unidad de Coordinación

[email protected]

www.gbif.es


Sumario España: retos y oportunidades

  • Que es GBIF

  • ¿por qué GBIF?

  • Programa de GBIF

  • Implementación de GBIF en España

  • Participación y resultados

  • Criptogamia en España y GBIF

  • Los portales de datos de GBIF

  • Oportunidades de financiación

  • Retos

  • Reflexiones finales


Iniciativa GBIF España: retos y oportunidades

  • Es una iniciativa internacional, a 10 años vista, para hacer accesible por Internet toda la información disponible sobre los organismos vivos conocidos a nivel mundial (se ha hablado de GBIF como el “proyecto genoma humano” de la biodiversidad)

  • A instancias de la OCDE (1996, MegaScience Forum)

  • Los miembros ordinarios de GBIF son estados

  • Los estados miembros se comprometen a establecer un nodo nacional de GBIF que –entre otras cosas-- será portal de esta información, además contribuyen económicamente a la inciativa


Cronología de GBIF España: retos y oportunidades

  • Junio de 1999: el Consejo de Ministros de la OCDE acuerda crear GBIF

  • Marzo del 2001: GBIF nace oficialmente

  • 2002: La Secretaría Mundial del GBIF se instala en Copenague

  • 2003: Primer plan de trabajo anual de GBIF y primeras convocatorias de proyectos y contratos


Por qu gbif
¿Por qué GBIF? España: retos y oportunidades

  • "Saber que sabemos" resulta complicado --cuando no imposible-- porque:

  • La información se generar y almacena de modo disperso en proyectos, colecciones y centros, de manera que no hay un punto donde podamos obtener toda la información que existe sobre una especie --o conjunto de especies-- para un ámbito determinado (geográfico, de hábitat, temporal,…). Proporcionar acceso unificado a todos esos recursos existentes, accesibles pero dispersos es objetivo de GBIF.

  • Las estilización propia de los trabajos científicos --derivada de las limitaciones impuestas por la publicación en papel-- hace que sólo se publique los resultados, omitiendo toda la información generada y recopilada para llegar a los mismos. Esto obliga a los botánicos a repetir los mismos trabajos una y otra vez, con toda la ineficiencia que conlleva. Esto no es algo nuevo como ya lo dijo HEYWOOD (1974). Contribuir y promocionar que todos esos datos científicos sean accesible y reutilizables también es objetivo de GBIF.


Iniciativa GBIF España: retos y oportunidades

Programas temáticos

  • Contenido

    • Informatización de las colecciones de Historia Natural

    • Catálogo electrónico de nombres científicos

    • “Species bank”: bases de datos con información sobre especies (descripciones, claves, imágenes, …)

    • Biblioteca Virtual de la Biodiversidad

  • Informática

    • Tecnología e interoperabilidad de bases de datos (estándares, infraestructura informática)

  • Formación y cooperación

    • Nuevos miembros

    • Convenios Internacionales

    • Formación


Iniciativa GBIF España: retos y oportunidades

Contenidos y relaciones

El catálogo electrónico de nombres de organismos conocidos para la ciencia posibilitará el enlace entre muchos tipos de bases de datos biológicas y no biológicas


GBIF en España España: retos y oportunidades

Impleméntación

Resolución

del MCYT

Real Jardín Botánico

Consejo Superior de

Investigaciones Científicas

Nodo Nacional de GBIF

Unidad de Coordinación

Museo Nacional de Ciencias Naturales


GBIF en España España: retos y oportunidades

De la voluntad política a la realidad

España firma el MoU

Febrero 2001

Plan de actuación

Abril 2001

Julio 2002

Resolución del MCYT

Otoño 2002

Sesiones informativas

Trabajos iniciales

Invierno 2002

GBIF.ES UC, arranca

Julio 2003


GBIF en España España: retos y oportunidades

ANEP

Propuesta de implementación

  • Estructura en red (U. coordinación + centros y proyectos)

  • Unidad de Coordinación dentro de un centro

  • Sin presupuesto para financiar proyectos


GBIF en España España: retos y oportunidades

GBIF.ES = UC +CAR

El sistema de información del nodo español del GBIF está formado por una Unidad de Coordinación (UC) y por una federación de bases de datos integrada por los Centros Asociados a la Red (CAR)

  • Acceso unificado

  • Información distribuída

  • Los proveedores de datos retienen el control sobre los mismos


GBIF en España España: retos y oportunidades

Unidad de Coordinación

Misión: apoyar a las colecciones, centros y proyectos relevantes sobre biodiversidad para que participen en GBIF

Esta misión se plasma en las siguientes tareas:

  • Proporcionar soporte técnico (información, formación, estándares, software y asesoramiento)

  • Asegurar la coherencia entre las iniciativas nacionales y la arquitectura informática de GBIF, para garantizar la interoperabilidad

  • Investigar como maximizar el valor de los datos, al desarrollar herramientas de análisis, validación y visualización de los mismos

  • Recopilar y difundir información relevante para las colecciones y para el conocimiento y gestión de la información sobre biodiversidad


GBIF en España España: retos y oportunidades

Actividades

  • Base de datos de centros y proyectos (http://www.gbif.es/InformeColecciones.php)

  • Apoyo y seguimiento a proyectos y centros participantes

  • Software de informatización y gestión de colecciones y proyectos

  • Informatización de datos

  • Otras herramientas informáticas

  • Portal de comunicación

  • Portal de datos y servicio de alojamiento de datos

  • Talleres de bioinformática

  • Difusión y fomento de la participación

  • Participación a nivel internacional (con TDWG, con el Secretariado de GBIF, con otros Nodos)


GBIF en España España: retos y oportunidades

Participación: centros y proyectos

37 centros

83 bases de datos

1.577.304 registros

http://www.gbif.es/Participantes.php


Que hay de criptogamia
Que hay de criptogamia España: retos y oportunidades

  • Algas y Fitoplancton

    • CeDoc de Biodiversitat Vegetal: BCN-Phycophyta

    • Institut d'Ecologia Litoral: IEL_Algae

    • Institut d'Ecologia Litoral: IEL_Phyto

    • Real Jardín Botánico Madrid: MA-Algae

    • SANT herbarium algae collection

    • Universidad de Málaga: MGC-Algae

  • Hongos y Líquenes

    • Universidad Complutense, Dpto. de Biolog. Veg. II, Fac. Farmacia, , Madrid: MAF-Lich

    • Universidad de Córdoba. Dpto. de Botánica, Ecología y Fisiología Vegetal: Fungi-COFC

    • Flora Mycologica Iberica

    • Real Jardín Botánico, Madrid: MA-Fungi

    • Real Jardín Botánico, Madrid: MA-Funhist

    • Real Jardín Botánico, Madrid: MA-Lichen

  • Musgos y Hepáticas

    • Universidad de Murcia, Dpto. Biología Vegetal (Botánica): MUB-HEPATICAE

    • Real Jardín Botánico, Madrid: MA-Musci

    • Real Jardín Botánico, Madrid: MA-Hepat

  • Los datos consultables son importantes (más de 220.000 registros en total) pero aún tan solo una fracción de lo que existe y debería ser accesible.


Que m s hay
Que más hay España: retos y oportunidades

  • Un aspecto interesante de GBIF y que muestra su dimensión colaborativa es que no solo permite consultar los datos provenientes de España, en este caso, si no también los concerniente a su territorio que están en bases de datos de fuera del país.


Un ejemplo hongos de la pen nsula ib rica
Un ejemplo: hongos de la Península Ibérica España: retos y oportunidades

http://data.gbif.org

46 bases de datos

16 países

45.000 registros con coordenadas


Www gbif es datos
www.gbif.es/datos España: retos y oportunidades


Ejemplo del nuevo portal de gbif
Ejemplo del nuevo portal de GBIF España: retos y oportunidades

demo de data.gbif.org

http://data.gbif.org/


Oportunidades de financiaci n
Oportunidades de financiación España: retos y oportunidades

  • En el Nodo Nacional de GBIF la participación de todas las instituciones depositarias de colecciones, y proyectos con información en biodiversidad es fundamental. La información que contiene cada colección –grande o pequeña- es única. Al participar en GBIF, los centros y colecciones contribuirán con sus datos a la visión de la biodiversidad que, a todas las escalas, proporcionará la red de GBIF; obteniendo y obtendrán además apoyo técnico, visibilidad y reconocimiento.

  • Para que esta participación tenga un efecto real, los centros y proyectos implicados pueden financiar la informatizando de sus datos y su publicación en internet -entre otras maneras - mediante las “Acciones Complementarias" específicas de GBIF del Plan Nacional I+D+I

http://www.gbif.es/financiacion.php


http://www.gbif.es/financiacion.php España: retos y oportunidades


Retos
Retos España: retos y oportunidades

  • Criptogamia para todos los públicos

  • Comunicar datos, no solo resultados

  • Nuevas técnicas requiere formación


Retos1
Retos España: retos y oportunidades

  • Los datos hechos públicos exigen mayor rigor en su presentación y una documentación meticulosa ya que datos serán usados en contextos muy diferentes del original.


Ejemplo el helecho macho
Ejemplo: el helecho macho España: retos y oportunidades

Fl. iberica

Dryopteris filix-mas

Dryopteris affinis

ssp. affinis

ssp. borreri

ssp. stilluppensis

Dryopteris oreades

Dryopteris submontana

Dryopteris pallida

ssp. pallida

spp. balearica

Dryopteris carthusana

Dryopteris expansa

Dryopteris dilatata

Fl. Països Catalans

Dryopteris austriaca

ssp. assimilis

ssp. dilatata

ssp. spinulosa

Dryopteris filix-mas

ssp. borreri

ssp. filix-mas

ssp. oreades

Dryopteris villarii

ssp. submontana

ssp. balearica


Conocimiento expl cito e impl cito

nombre España: retos y oportunidades

quien

cuando

Conocimiento explícito e implícito


Donde estamos
Donde estamos España: retos y oportunidades

  • Establecer el significado de una identificación es en el mejor de los casos un ejercicio de exegesis basado en conocimiento implícito y asunciones

  • Esto es un tremendo obstáculo para que la colección sea útil a un mayor número de usuarios y por tanto para su importancia


Explicitar el conocimiento
Explicitar el conocimiento… España: retos y oportunidades

  • Quien hace la identificación

  • Cuando

  • Tipo de identificación (fiabilidad)

  • Calificadores de la identificación

  • (precisión)

  • Exactitud ( sistema de referencia

  •  taxonomia)


Exactitud ref a taxonom a
Exactitud (ref. a taxonomía) España: retos y oportunidades


Retos2
Retos España: retos y oportunidades

  • La publicación de datos debe ser promocionada. Las iniciativas a favor del "Scientific Data Open Access", que distintas instituciones (Comisión Europea, Convenio de la biodiversidad, GBIF) apoyan,

  • pero además ésta debe ser considerada como un mérito científico (para que los investigadores hagan de esta actividad parte de su rutina de trabajo.

  • las publicaciones científicas deben hacer constar el uso en las mismas (citar) de los datos obtenidos por Internet, como se hace en la actualidad con las publicaciones impresas.


Retos3
Retos España: retos y oportunidades

  • Formación. La puesta de datos en Internet es el colofón de una serie de procesos donde los datos se compilan, depuran, almacenan y mantiene. El aprendizaje de las técnicas que estas tareas conllevan debe ser parte de la formación del investigador.


20 talleres en 3 a os

Gestion de datos, modelado de la biodiversidad, calidad de datos, georeferenciación, gestión de colecciones, etc.

20 talleres en 3 años


A modo de conclusion
A modo de conclusion datos, georeferenciación, gestión de colecciones, etc.

La criptogamia ya no es lo que era:

  • La información que producimos es (debe ser) consumida por un público más amplio

  • Los datos (y no solo los resultados) son valiosos y deben ser “publicados”

  • De la fragmentación a la integración: primero las citas, después las especies


GBIF en España datos, georeferenciación, gestión de colecciones, etc.

Unidad de Coordinación

Francisco Pando

Responsable

Alberto G. Talaván

Coordinador de proyectos

Silvia Lusa

Administradora del sistema informático y red de datos

Isabel Ortega

Soporte a usuarios y documentación

Ibon Tamayo

Desarrollos informáticos

GBIF-ES es el Nodo Nacional de Información sobre Biodiversidadpatrocinado por el Ministerio Español de Educación y Ciencia, gestionado por el Consejo Superior de Investigaciones Científicas

W W W . G B I F . ES


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