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Protein. 蛋白質構造: 細胞內巨分子的特性 ( 巨分子有那三種特性 ) Lehninger Biochemistry in 3D 點選 Protein Architecture ( 深入說明蛋白質各級構造,要 Chime ) 蛋白質性質: 蛋白質要有正確的分子 構形,才能有效執行其生理功能;構形 或許是分子演化的基本驅策力,因為即使胺基酸序列不十分相似,同功能的蛋白質也可能有相同的 構形 ( 各種生物的血紅蛋白即為一例 ) 。 變性及復性:
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蛋白質構造: • 細胞內巨分子的特性 (巨分子有那三種特性) • Lehninger Biochemistry in 3D點選 Protein Architecture (深入說明蛋白質各級構造,要 Chime) • 蛋白質性質: • 蛋白質要有正確的分子 構形,才能有效執行其生理功能;構形 或許是分子演化的基本驅策力,因為即使胺基酸序列不十分相似,同功能的蛋白質也可能有相同的 構形 (各種生物的血紅蛋白即為一例)。 • 變性及復性: • 某些條件會破壞蛋白質分子的各級構造,稱之為 變性 (denatuaration),例如 加熱、pH太 高或太低、尿素、界面活性劑、劇烈震盪等。變性的蛋白質大多會失去活性,當變性條件除去後,有些蛋白質會回復原來構形,並具原有活性,稱之為 復性。
蛋白質構形是活動的: • 蛋白質分子上的各部份結構並非固定不動,而是有相當的 彈性與運動。 尤其 domain 與 domain 之間,或者酵素催化區的開閤,都有相當大的活動幅度。 這種活動會隨著溫度升高而上升,對蛋白質或酵素的活性及其調控有很大的影響。 • 蛋白質的專一性結合: • 專一性在酵素的催化及細胞生理功能上,扮演重要角色。蛋白質與蛋白質之間,或與其它分子 (例如 核酸或者細胞膜),經常有專一性的結合,其構成力量如下: • a. • 構形互補 (conformational match):兩分子間的結合表面,其形狀互補,像拼圖積木。 • b. • 二級鍵吸引力 (interaction forces): 兩分子之結合面上,對應胺基酸間的吸引力量,由二級鍵構成。 圖 1 是一假想圖例,說明某酵素與其抑制因子間,如何進行專一性的結合。
Antibody Recognition of Antigen (OMM Exhibits分析抗體與抗原的專一性結合,要 Chime) • Lehninger Biochemistry in 3D請點選 Bacteriorhodopsin (細胞膜上的蛋白質通道);Lac Repressor (蛋白質與核酸間的作用);MHC Molecules (蛋白質與 peptide 間的專一性辨認) • 蛋白質研究技術: • 蛋白質研究通常要先純化得 均質蛋白質,然後檢定其 分子量、次體組成 及 等電點,最終則要定出蛋白質之 胺基酸序列,或其立體三次元 分子構造。 • 酵素純化與分析 (屬於 研究所課程的蛋白質與酵素實驗操作訓練) • 蛋白質分子間的專一性結合力量是如何構成的? • 兩大類鍵結力量構成蛋白質分子間的專一性結合,其一是兩個分子之間,其構形有如積木般的互補,會因為 凡得瓦爾力的關係,產生專一性吸引力; 另一則為兩分子之間,因為某些基團間產生了二級鍵,所造成的吸引力。通常兩個分子間的專一性吸引力的形成,這兩大類力量都會有貢獻。 親和性結合力量的大小,可以用解離常數來表示,一般解離常數至少在 10-6以上才算有足夠的親和力 (也就是說一百萬對結合分子中,只有一對會解離開來)。 • 資料來源:http://juang.bst.ntu.edu.tw/BCbasics/Protein1.htm