Supplementary Fig. A

AFLP 100 20 30 40 50 60 70 10 80 90 0 CCBAU23115 CCBAU43229 1 CCBAU33191 CCBAU43241 CCBAU23116 CCBAU65311 CCBAU65310 CCBAU53093-1 CCBAU53093-2 CCBAU43230 USDA 2370T 2 CCBAU23122 CCBAU23127 CCBAU33201 CCBAU23132 CCBAU23123 CCBAU33202 162×68 CCBAU73112 CCBAU73113 CCBAU01253 CCBAU01010 CCBAU33196 CCBAU23121 CCBAU33193 CCBAU43238 CCBAU11117 CCBAU11115 CCBAU11080 CCBAU05068 CCBAU43235 3 CCBAU23125 CCBAU33203 CCBAU11112 CCBAU23131 CCBAU33190 CCBAU53072-5 CCBAU33198 CCBAU33199 CCBAU23126-1 CCBAU23130 CCBAU33195 CCBAU43231 CCBAU43233 CCBAU23126-2 CCBAU43236 CCBAU33204 CCBAU43240 CCBAU33192 CCBAU43237 CCBAU65313 4 CCBAU65314 CCBAU65315 CCBAU65264 CCBAU65263 CCBAU03058 CCBAU75042 CCBAU03100 Supplementary Fig. A

100 66 68 70 72 74 76 78 80 82 84 86 88 90 92 94 96 98 CCBAU 03316 CCBAU 03317 CCBAU 03318 CCBAU 81100 CCBAU 81102 CCBAU 03319 CCBAU 03320 CCBAU 81103 CCBAU 81104 CCBAU 81106 CCBAU 81107 CCBAU 03321 CCBAU 85004 CCBAU 03322 CCBAU 83268 CCBAU 83267 CCBAU 83266 CCBAU 23125 . CCBAU 53072-5 . CCBAU 33198 . CCBAU 43236 . CCBAU 33199 . CCBAU 33203 . CCBAU 65311 . CCBAU 23126-2 . CCBAU 23116 . CCBAU 65310 . CCBAU 23131 . CCBAU 11112 . CCBAU 03058 . CCBAU 73112 . CCBAU 73113 . CCBAU 65264 . CCBAU 75042 . CCBAU 43231 . CCBAU 33192 . CCBAU 43240 . CCBAU 53093-2 . CCBAU 65315 . CCBAU 33196 . CCBAU 33193 . CCBAU 11117 . CCBAU 43238 . CCBAU 23121 . CCBAU 23130 . CCBAU 01253 . . CCBAU 43230 . . CCBAU 11080 . CCBAU 33195 . CCBAU 23115 . . CCBAU 05068 . CCBAU 65263 . . CCBAU 03100 . CCBAU 01010 . CCBAU 11115 . CCBAU 53093-1 CCBAU 43237 CCBAU 65313 CCBAU 65314 CCBAU 33204 CCBAU 43241 CCBAU 33190 CCBAU 33191 CCBAU 43235 CCBAU 43229 CCBAU 43233 CCBAU 23126-1 USDA 2370T R.leguminosarum 162×68 R.leguminosarum CCBAU 85003 CIAT 899 R.tropici:typeB IAM 13570T A.rhizogense CCBAU 23123 CCBAU 23122 . CCBAU 33201 CCBAU 23127 CCBAU 23132 CCBAU 33202 CFN 299T R.tropici:typeA USDA 205T S.fredii USDA 1002T S.meliloti HAMBI 1489T S.kostiense CCBAU 71623T R.yanglingense S 02T R.huantiense CFN 42T R.etli LMG 11892T M.plurifarium ACCC 19665T M.amorphae CCBAU 3306T M.tianshanense NZP 2213T M.loti USDA 6T B.japonicum B15 B.japonicum IAM 13129T A.tumefaciense IAM 14140T A.vitis Supplementary Fig. B

A 100 55 60 65 70 75 80 85 90 95 CCBAU 83268 CCBAU 83267 CCBAU 81100 CCBAU 11112 CCBAU 03058 B CCBAU 65264 CCBAU 65315 CCBAU 11117 CCBAU 11080 CCBAU 65263 CCBAU 11115 C CCBAU 65313 CCBAU 65314 CCBAU 83266 CCBAU 03317 CCBAU 03318 CCBAU 81102 CCBAU 03319 CCBAU 03320 CCBAU 81103 D CCBAU 81104 CCBAU 85004 CCBAU 03322 CCBAU 85003 CCBAU 73112 CCBAU 73113 CCBAU 01253 CCBAU 05068 CCBAU 01010 CCBAU 43235 CCBAU 03316 CCBAU 81106 CCBAU 81107 CCBAU 03321 CCBAU 43226 CCBAU 23125 CCBAU 53072-5 CCBAU 33198 CCBAU 43236 CCBAU 33199 CCBAU 23123 CCBAU 33203 CCBAU 65311 CCBAU 23126-2 CCBAU 23116 CCBAU 65310 CCBAU 23131 CCBAU 23122 CCBAU 75042 CCBAU 33201 E CCBAU 43231 CCBAU 33192 CCBAU 43240 CCBAU 53093-2 CCBAU 33196 CCBAU 33193 CCBAU 43238 CCBAU 23127 CCBAU 23121 CCBAU 23130 CCBAU 43230 CCBAU 33195 CCBAU 23115 CCBAU 03100 CCBAU 23132 CCBAU 43237 CCBAU 33204 CCBAU 43241 CCBAU 33202 CCBAU 33190 CCBAU 33191 CCBAU 43229 F CCBAU 43233 G CCBAU 23126-1 USDA 2370T 162×68 Supplementary Fig. C

Supplementary Fig. A

Supplementary Fig. A

Presentation Transcript

Supplementary Fig . 1

Supplementary Fig.1

Supplementary Fig 1

Supplementary Fig. 1

Supplementary Fig. 4

Supplementary fig. 1

Supplementary Fig. 2.

Supplementary Fig S11

Supplementary Fig. S1

Supplementary Fig. S2

Supplementary Fig. 5

Supplementary Fig 1.

Supplementary Fig 2

Supplementary Fig. 1

Supplementary Fig. 1

Supplementary Fig. S2

Supplementary Fig . 3A

Supplementary Fig

Supplementary Fig. 1

Supplementary Fig 1