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Internet 生物医学信息资源及其检索

Internet 生物医学信息资源及其检索. 主要内容. 概述 类型 特点 指南及引擎 2.Internet 生物医学数据库及其检索. 1.Internet 生物医学信息资源. 概述.

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Internet 生物医学信息资源及其检索

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Presentation Transcript

  1. Internet 生物医学信息资源及其检索

  2. 主要内容 概述 类型 特点 指南及引擎 2.Internet生物医学数据库及其检索 1.Internet生物医学信息资源

  3. 概述 • Internet上的信息资源极其丰富，内容及表现形式多样化；同时也蕴藏着丰富的生物医学信息资源； • Internet上的生物医学信息资源占30％左右； • Internet上的信息资源的分布方式： • E-mail、FTP、Gopher及WWW

  4. 类型 根据以下四种分类标准进行划分： 1．按内容的组织和表现形式分： 2．按提供网络服务的方式分： 3．按生物医学主题（学科或疾病）划分： 4．按信息资源的来源分：

  5. Internet生物医学信息资源的特点 1.信息源丰富； 2.信息内容的组织(表现)形式多样化； 3.更新速度快； 4.信息组织的局部有序性与整体无序性； 5.检索方式灵活； 6.规范化程度不高。

  6. Internet信息资源检索的方法 人们已经考虑到了网络资源的特点，在Internet上建立了各类资源“导航图”(即所谓资源导航或指南)或专门帮助用户查找网上资源的搜索工具—搜索引擎(Search engines)。 搜索引擎：是一种能够通过Internet接受用户的查询指令，并向用户提供符合其查询要求的信息资源网址的系统。

  7. 一般主题指南及引擎 大部分搜索引擎既允许用户按它们对WWW资源的分类一层一层地浏览网上信息，还允许用户输入任意检索词检索网站及文献，所以这些搜索引擎兼备导航和检索的双重功能。 1.Alta Vista(http://www.altavista.com) 2.Yahoo(http://www.yahoo.com) 3.google (http://www.google.com) 4.InfoSeek(http://www.go.com) 5.Excite(http://www.excite.com) 6.Lycos(http://www.lycos.com) 7.Webcrawler(http://webcrawler.com) 8.搜狐(SOHU)(http://www.sohu.com.cn) 9.天网(WebGather)(http://e.pku.edu.cn) 10.网络指南针　　(http://compass.net.edu.cn:8010/)

  8. 医学主题指南及引擎 Internet上除提供大量的一般主题指南和搜索引擎外，还有许多站点专门提供医学主题指南和搜索引擎。当然，一般主题指南和引擎也可用于检索或浏览Internet上的医学信息资源的站点。 1.MedSite(http://www.medsite.com) 2.MEDguide(http://www.medguide.net) 3.HealthWeb(http://healthweb.org) 4.HealthAtoZ(http://www.healthatoz.com) 5.MedExplorer(http://www.medexplorer.com) 6.MedWeb(http://www.medweb.emory.edu) 7.Med Engine(http://www.themedengine.com/) 8.Medical Matrix(http://www.medmatrix.org) 9.Biomednet(http://www.bmn.com/) 10.Cliniweb International(http://www.ohsu.edu/cliniweb) 11.Medwebplus(http://www.medwebplus.com)

  9. Internet 生物医学文献资源

  10. Internet生物医学数据库 • 一次文献数据库：电子期刊全文数据库 • 二次文献数据库：PubMed

  11. PubMed概况 1. 创建机构：美国国立医学图书馆下设的美国生物技术信息中心(NCBI) 2.类型：Web数据库 3.网址：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi 4.特色：具有收录范围广、内容全、检索途径多、检索体系完备等特点，部分文献还可在网上直接免费获得全文。 5.与Medline光盘数据库的区别：检索机制、检索界面、检索方法以及收录文献数量不同。

  12. PubMed数据来源 1.MEDLINE 2.In Process Citations：每天收录，尚未经规范处理的数据。 3.Publisher-Supplied Citations：由出版商提供的电子文献，每条记录标有[PubMed-as supplied by Publisher]。

  13. PubMed检索机制 1．自动转换匹配功能(Automatic Term Mapping) 对于输入的检索词，PubMed先按一定的词表顺序进行对照匹配和转换，再进行检索。词表匹配转换顺序是：MeSH表(MeSH Translation Table)、期刊刊名表(Journal Translation Table)、短语表(Phrase list)、作者索引(Author Index)。如果在以上4个表中都找不到相匹配的词，PubMed将把短语分开，以单词为单位，分别重复以上的过程，检索时各个词之间是AND逻辑关系。如果仍找不到相匹配的词，则用单个词在所有字段查找，各个词之间也是AND逻辑关系。 2．短语检索(Phrase Searching) 也可称为强迫词组检索，即，如果要将短语作为一个词组进行检索，可用双引号“”将其引起来。如：“drug therapy”’作为词组进行检索的词，系统不进行自动转换匹配，也不进行MeSH词的扩检。

  14. 检索界面 • 基本检索界面 • 特征栏或按钮栏 • 左侧栏

  15. PubMed的特征栏 特征栏

  16. PubMed左侧栏 期刊浏览 主题词检索入口 文献匹配器 储存室

  17. PubMed检索方法 1.基本检索：在基本检索界面下完成 的检索方法。 2.高级检索：在特征栏和左侧栏中进行的检索方法。

  18. 基本检索 1.关键词、词(词组)或短语： 2.作者：Smith JS 或 Smith JS[au] 3.期刊刊名：GENE THERAPY[TA]，JAMA[TA] 4.截词：CHEMO* 5.复杂表达式：CANCER AND THERAPY

  19. 关键词(组)途径 作者途径 期刊途径

  20. 高级检索 1.限制字段或条件检索：Limit (1)日期：①Date of publication[DP]原始文献出版日期；②Entrez Date[EDAT]文献首次录入PubMed日期；③MeSH Date[MHDA]文献被MeSH词条标引日期。 (2)地址：单个词加标识符[ad] (3)带有摘要文献的检索 ：CANCER AND hasabstract (4)数据库子集的限定：特殊主题的检索 AMERICAN AND history [sb] 2.预检索及浏览索引检索：Preview/Index 3.主题词浏览检索：MeSH Database 4.引文匹配器(Citation Matcher) 5.临床查询(Clinical Queries) 6. PubMed Central

  21. PubMed检索运算符 1.逻辑运算符： 逻辑与：AND，表示两个集合的交集运算。 逻辑或：OR，表示两个集合的并集运算。 逻辑非：NOT，表示从一个集合中排除另一集合的运算。 2.截词符：*，一个词或字拼写出部分字母后面加上一个截词符，chem*表示用词根进行检索。 3.双引号：“ ”，表示对引号中的短语进行检索。 4.检索字段标识符：[tag]，tag为字段名称。 [ti]，[au]，[ta]，[so]，[la]，[pt]。

  22. 常用字段组成 标识符 字段名称 TI Title AU Author AD Affiliation AB Abstract DP Publication Date EDAT Entrez Date SO Source TA Journal Title Abbreviation MH MeSH Terms PT Publication Type

  23. 检索结果 • 显示 • 保存 • 打印

  24. 检索策略的存储和调用 • 使用Cubby • 首先要登记注册 • 保存检索策略 • 定期浏览新的检索结果

  25. 其它功能 • 全文链接 • 相关文献链接 • 相关数据库的链接

  26. 其它生物医学网站 1.免费医学期刊网http://www.freemedicaljournals.com/ 2.斯坦福大学http://highwire.stanford.edu/ 3.生物医学世界http://www.medbioworld.com/ 4.emedicine网 http://www.emedicine.com/ 5.生物医学中心http://www.biomedcentral.com/ 6.新英格兰医学杂志http://content.nejm.org/ 7.英国医学杂志http://bmj.bmjjournals.com 8.医学研究生期刊网http://www.jpgmonline.com 9.剑桥大学期刊网 http://title.cambridge.org/journals 10. 公共科学图书馆 http://www.publiclibraryofscience.org/

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