1 / 26

DISTRIBUSI GENOTIP CYP2E1 PADA PENDERITA KANKER NASOFARING DARI SUKU SUNDA DAN NON SUNDA

DISTRIBUSI GENOTIP CYP2E1 PADA PENDERITA KANKER NASOFARING DARI SUKU SUNDA DAN NON SUNDA. DWI ANITA SURYANDARI Departemen Biologi Kedokteran FKUI. KARSINOMA NASOFARING.  tumor ganas pada sel epitel nasofaring. Etiologi : infeksi EBV, kekerapan konsumsi makanan mengandung nitrosamin.

karim
Download Presentation

DISTRIBUSI GENOTIP CYP2E1 PADA PENDERITA KANKER NASOFARING DARI SUKU SUNDA DAN NON SUNDA

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript


  1. DISTRIBUSI GENOTIP CYP2E1PADA PENDERITA KANKER NASOFARINGDARI SUKU SUNDA DAN NON SUNDA DWI ANITA SURYANDARI Departemen Biologi Kedokteran FKUI

  2. KARSINOMA NASOFARING  tumor ganas pada sel epitel nasofaring. Etiologi : infeksi EBV, kekerapan konsumsi makanan mengandung nitrosamin. Diagnosis : berdasar uji serologi,biopsi, PCR. Terapi : radiokemoterapi (efektif).

  3. INFEKSI EBV • Hampir 90% populasimanusia di dunia terinfeksi EBV. • EBV : (hospes spesifik). • Infeksi pada anak-anak asimptomatik Imunitas • Infeksi pada dewasa muda mononukleosis (L)

  4. Amerika Utara 1/100rb Cina Selatan 30-50/100rb Eropa 1/100rb Thailand 3/100rb Indonesia 4,7/100rb PETA DISTRIBUSI KNF

  5. MULTIFAKTORIAL KNF INFEKSI EBV & KARSINOGEN FAKTOR LINGKUNGAN K N F NITROSAMIN GEN VIRUS FAKTOR GENETIK POLIMORFISME GEN CYP2E1 GEN PEJAMU

  6. Studi pendahuluan : penderita KNF di Indonesia (RSCM) pada suku sunda lebih banyak daripada suku non Sunda. Masalah : Bagaimana distribusi genotip CYP2E1 pada penderita KNF suku Sunda dan non Sunda? Apakah genotip dan alotip CYP2E1 berasosiasi dengan suseptibilitas individu terhadap KNF?

  7. GEN CYP2E1 Lokasi : 10q24.3-q terminal, 9 exon dan 8 intron (11,8 kb) Polimorfik = Substitusi 7668T-A pada intron 6

  8. PETA RESTRIKSI CYP2E1 Dra I C 874 pb 121 pb Dra I Dra I D 302 pb 572 pb 121 pb

  9. PCR Mix: (Sampel DNA; PCR green Go Taq buffer 1X; 1,5 mM MgCl2; 0,2 mM dNTP; 0,4 pmol/µlprimer F, primer R ; 0,25 unit enzim DNA polimerase Taq; dan ddH2O steril sampai volume total 25 µl). ISOLASI DNA AMPLIFIKASI GEN CYP2E1 ELEKTROFORESIS Gel agarosa 2% (b/v) Kontrol negatif (campuran pereaksi PCR tanpa sampel DNA) • - Produk PCR/RFLP • Kontrol negatif • Penanda berat DNA • X174RF/HaeIII • Kontrol positif Denaturasi awal Ekstensi akhir Denaturasi Ekstensi 94o C 1’ 95o C 5’ 72o C 7’ 72o C 2’ 60o C 2’ Elektroforesis dengan tegangan 90 V selama 50 menit. Annealing 4o C  Divisualisasikan di bawah iluminator UV dan difoto dengan Film Polaroid 667 ISO 3000 8,5 x 10,8 cm Black and White Instant Pack Film menggunakan kamera Polaroid. 30 siklus

  10. Hasil digesti enzim DraI pada sekuen gen CYP2E1 874 pb 500 pb 572 pb 302 pb 200 pb 100 pb 121 pb M M 4 DD 5 DD 6 DC DD 7 8 CC

  11. Sebaran umur kelompok KNF dan Kontrol

  12. Perbandingan distribusi genotip dan alotip gen CYP2E1 pada kelompok KNF dan Kontrol.

  13. tidak ada perbedaan secara bermaknadistribusi genotip dan alotip gen CYP2E1 antara kelompok penderita KNF dengan kelompok kontrol.

  14. Tidak ada perbedaan secara bermakna genotip dan alotip CYP2E1 pada kelompok kontrol suku Sunda dan non-Sunda. Perbandingan genotip dan alotip CYP2E1 pada kelompok kontrol suku Sunda dan nonSunda

  15. Perbandingan genotip dan alotip CYP2E1 pada kelompok KNF suku SUnda dan nonSunda

  16. Chi square ,CI 95% , α = 0,05 diperoleh nilai p = 0.1846 ( p>0,05)  distribusi alotip antara suku Sunda dengan non-Sunda pada kelompok penderita KNF : tidak ada perbedaan secara bermakna. Gambar 20. Grafik perbandingan distribusi alotip gen CYP2E1 antara suku Sunda dan non-Sunda pada kelompok KNF.

  17. KESIMPULAN • Distribusi genotip DD:DC:CCpada kelompok penderita KNF adalah70%:26%:4% dan distribusi alotip D : C adalah 83% :17%. • Frekuensi alel C pada suku Sunda cenderung lebih tinggi daripada non-Sunda dan berbeda bermakna pada p<0,10. • Genotip dan alotipCYP2E1 tidak berhubungan dengan suseptibilitas individu terhadap KNF.

  18. MANFAAT PENELITIAN : • Hasil penelitian ini merupakan data awal tentang pola distribusi alel gen CYP2E1 pada populasi di Indonesia. Diharapkan data ini dapat digunakan sebagai acuan penelitian keganasan lainnya yang dihubungkan dengan aktivitas enzim CYP2E1. • Dapat dimanfaatkan sebagai bahan konseling bagi keluarga penderita KNF agar dapat mengambil tindakan preventif untuk meminimalkan resiko terkena KNF.

  19. KARSINOGEN DALAM MAKANAN – KEGANASAN IKAN ASIN (NITROSAMIN) NELAYAN HONG KONG (Ho,1972) TIKUS (Huang, 1978) KARSINOMA NASOFARING KARSINOMA KAVUM NASALIS

  20. NITROSAMIN Dapat terbentuk pada saat pemanasan protein terdapat dalam makanan yang diawetkan, diasapi, Dan pada asap rokok

  21. Terbentuknya Nitrosamin NITRAT/ NITRIT SENYAWA AMIN NITROSAMIN G.I. NITRIT ALKILAMIN (IKAN ASIN) NITROSAMIN

  22. FAKTOR GENETIK PEJAMU METABOLISME OLEH CYP NITROSAMIN TUBUH POLIMORFISME GEN CYP2E1 Poor metabolizers (PM) Extensive metabolizers (EM)

  23. KARSINOGENESIS ZAT KIMIA PROKARSINOGEN excresi Zat kim yg diexcresi bioaktivasi Metabolit antara Metabolit Reaktif (karsinogen akhir) ZAT KIMIA T’konjugasi Ik.kov dg GSH/fenol P’ikatan thd makromol Makromolekul dlm ∆ (bhn gntk yg b’∆) Makromol yg Telah b’ubah Replikasi perbaikan Inisiasi Sel Tumor Bhn gntk yg pulih (sel Normal) Promosi Neoplasma t’diferensiasi Konversi & pkb KANKER

  24. Hasil sekuensing gen CYP2E1(dari lembaga Biologi molekuler Eijkman)

  25. Hasil sekuensing (dari LBM.Eijkman)

More Related