310 likes | 487 Views
Translation. Translation. หมายถึง กระบวนการสังเคราะห์ protein ในระดับโครงสร้างแรก หรือ primary structure โดยลำดับของ amino acids ถูกกำหนดจาก information/code ของ gene ใน DNA. - Information/code ของ gene จาก DNA ถูก Transcribedให้ไปอยู่ใน mRNA (มี codon)
E N D
Translation หมายถึง กระบวนการสังเคราะห์ protein ในระดับโครงสร้างแรก หรือ primary structure โดยลำดับของ amino acids ถูกกำหนดจาก information/code ของ geneใน DNA
- Information/code ของ gene จาก DNA ถูก Transcribedให้ไปอยู่ใน mRNA (มี codon) - amino acids ถูกนำเข้าไปต่อกันเป็น polypeptide โดย tRNA (มี anticodon) - การต่อกันของ amino acids เกิดขี้นที่ Ribosome ซึ่งก็คือ rRNA + protein
Genetic Codes 1. Codon : Code บน mRNA 1 codon ประกอบด้วย 3 base (triplet code) มี ค่าเท่ากับ 1 amino acid 64 codons สำหรับ 20 amino acids 1 codon เป็น start codon = AUG (เสมอ) 3 codons เป็น stop codons
Stop codons :หยุด translation (1) UAA = Ochre codon (2) UAG = Amber codon (3) UGA = Opal codon Condon ตลอด structural gene ที่ code ให้ polypeptide เรียกว่า Reading frame
2. Anticodon: Code บน tRNA 3 bases & complement กับ codon บน mRNA
tRNA ให้ Wobble effect: base จับกันไม่ปกติโดย 2 bases แรกของ codon complement ปกติกับ anticodon แต่ base ตัวที่ 3 ของ codon อาจจับกับnon-complementary base
Ribosome Prokaryote: 70S ribosome 30S subunit : 16S rRNA 50S subunit : 23S & 5S rRNA Eukaryote: 80S ribosome 40S subunit : 18S rRNA 60S subunit : 28S, 5.8S, & 5S rRNA
Mechanism of Translation 1. Initiation 2. Elongation 3. Trmination
Initiation in Prokaryote 1. Initiation factor, IF3 จับกับ 30S subunit of ribosome 2. 30S ribosome-IF3 จับกับ mRNA 3. First aminoacyl-tRNA เข้ามา join complex 4. 50S ribosome จับ complex 5. IF-2 และ GTP เข้ามาจับ complex 6. GTP--> GDP และ IF2 หลุดออก --> initiation สมบูรณ์
Initiation in Eukaryote 1. eIF2-GDP + GTP ---> eIF2-GTP 2. eIF2-GTP + Met-tRNA --> 2 3. 40S + eIF3 + eIF4 ---> 3 4. 2 +3 --> 4 5. mRNA + eIF4F, 4A & 4B ---> 5 6. 4 + 5 + 60S + eIF5
First amino acid พิเศษใน Initiation Prokaryote : N-formylmethionine (fMet) fMet-tRNA / tRNAfMet binds 30S ribosome Eukaryote : Methionine (Met) Met-tRNA / tRNAiMet binds 40S ribosome [tRNAmMet for the interior of message]
Binding sites บน mRNA สำหรับ Ribosome Prokaryote: Shine-Dalgarno sequence คือ 5’-AGGAGGU-3’ 16S rRNA : 3’-AUUCCUCCAC-5’Initiation site : 5’-AGGAGGU-3’
Binding sites บน mRNA สำหรับ RibosomeEukaryote: มี Capเป็น docking site for 18S rRNA และมีCap-binding protein หรือ eIF4F
Elongation in Prokaryote Ribosome มี binding sites สำหรับ aminoacyl-tRNA 2 sites : P (peptidyl) siteและ A (aminoacyl) site เมื่อ initiate fMet-tRNA นำ aa1 เข้าจับที่ P site ก่อน 1. aa2-tRNA + EF-Tu + GTP เข้าจับที่ A site ที่ว่าง 2. Peptide transferase ต่อ aa1 ให้ aa2 แล้ว fMet-tRNA หลุดออกจาก P site
Aminoacyl site และ Peptidyl site ใน RibosomeMovement ของ mRNA และ Ribosome
3. Translocation : mRNA ที่มี peptidyle-tRNA เคลื่อนที่ไป 1 codon ทาง 3’ ได้ A site ใหม่ 1 site ขณะที่ A site เก่ากลายเป็น P site Translocation ต้องการ EF-G + GTP 4. เหตุการณ์ทำนองเดียวกันเกิดซ้ำ ได้สาย polypeptide
Elongation in Eukaryote mechanism คล้าย prokaryote ยกเว้น EF เป็น Tu eF1 EF-G เป็น eF2
Termination in Prokaryote aan-tRNA เข้ามาที่ nonsense codon(s) หรือ stop codon(s) จะอ่าน codons ไม่ได้ แต่มี protein factor หรือ releasing factor จับได้ releasing factor-1 (RF-1) จับ UAA และ UAG releasing factor-2 (RF-2) จับ UAA และ UGA
Polysome: ภายหลังหลายcycles ของ elongation และไม่มีโมเลกุลที่เกี่ยวกับ initiation จับ กับ mRNA แล้ว translation รอบต่อไปจะเกิดขึ้นได้
Termination in Eukaryote คล้าย prokaryote แต่มี releasing factor เดียวคือ eRF และ ต้องการ GTP
Most Update Central Dogma DNA Self replication Transcription Reverse transcription RNA Self replication Translation Translation w/o transcription Protein