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Voies de dissémination des E. coli

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Phénotypes et génotypes de la résistance aux antibiotiques chez Escherichia coli d’origine animale en Tunisie : Multirésistance des isolats aviaires, fond génétique riche et hétérogène

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Presentation Transcript
slide1

Phénotypes et génotypes de la résistance aux antibiotiques chez Escherichia coli d’origine animale en Tunisie : Multirésistance des isolats aviaires, fond génétique riche et hétérogène

Dhifalli Rym1, Kilani Hajer1, Yolanda Saénz2, Mansouri Riadh1, Mehri Wahib1, Ben Chehida Noureddine1,

Abbassi Mohamed Salah1

1Laboratoire de recherche de bactériologie, Institut de la Recherche Vétérinaire de Tunisie, Bab Saadoun, Tunis, Tunisie. 2Unidad de Microbiología Molecular, Centro de Investigación Biomédica de La Rioja, Logroño, Spain

slide3

LE TRANSFERT DE LA RESISTANCE

Traitements et prophylaxie

Médecine

vétérinaire

Médecine humaine

Communauté

Additifs dans l’alimentation

des animaux

Hôpital

Agriculture

Protection des plantes

Environnement

Utilisation industrielle

slide4

Etude de la résistance aux antibiotiques chez: Volaille, Bovin, Ovin

Etude des gènes codant la résistance aux sulfamides et à la tétracycline

OBJECTIFS

Prévalence et caractérisation des structures des intégrons

slide5

Matériel & méthodes

Sites de prélèvements

slide6

Matériel & méthodes

148 isolats de E. coli

Antibiogramme

  • Isolement sur milieu MacConkey
  • Identification par Mini Galerie des Entérobactéries et Api20E (Bio-Mérieux)

Extraction de l’ADN

S

R

I

PCR

slide7

3-Détection des gènes de résistance aux antibiotiques:

tétracycline : tet(A), tet(B), tet(C)

sulfonamides : sul1, sul2, et sul3

4- Etude des intégrons:

a- Détection de la présence des integrons de classe 1 et de classe 2 (intI1 + intI2)

b- Structures des régions variables des intégrons

Cassette de gène

Intégrase

Promoteur

attC

qacEΔsul1

amorce anti-sens

amorce sens

slide8

Matériel & méthodes

Relations génétiques des isolats

PFGE

Digestion enzymatique par XbaI

Analyse des pulsotypes selon les

critères de Tenover et al, 1995.

slide9

Résultats

Résistance aux antibiotiques

slide11

Résultats

Une seule souche productrice de BLSE a été détectée à partir de poulet de chair:

Premier cas en Tunisie

slide13

Gènes de résistance détectés en relation avec des phénotypes de résistance

tetC 1

31

6

16

1

6

3

3

1

pr valence des int grons

Résultats

Prévalence des intégrons
  • 60/88 (68%): intégrons+
    • intI1 : 59
    • intI2 : 2
    • intI1 + intI2 : 2
slide15

Résultats

IntI2

dfrA1

sat

aadA1

Différents arrangements de gènes cassettes

des intégrons de classe 1

Intégron de classe 2

: la structure classique des intégrons classe 2

slide16

Résultats

Corrélation entre la résistance aux antibiotiques et la présence des intégrons

slide17

Résultats

Corrélation entre la multirésistance et la présence des intégrons

slide18

Résultats

Phylogénie : PFGE

Grande diversité génétique :

Les souches ne sont pas clonale

slide19

Conclusion

1- Résistance élevé à : La streptomycine (67,5%), la tétracycline (57,4%), le sulphonamide (46,6%), l’amoxicilline (42%), aux triméthoprime-sulfaméthoxazole (40,5%) et l’acide nalidixique (30,8%) ;

2- La résistance aux antibiotiques est plus importante chez les isolats aviaires que les isolats d’origine bovine et ovine, probablement liée aux pratiques d’élevages intensifs avicoles et à la forte utilisation des antibiotiques dans ce secteur;

3- Association entre présence d’intégrons et multirésistance aux antibiotiques

slide20

Perspectives 

  • Etude génétique approfondie d’une collection plus importante ;
  • Recherche des gènes de virulence pour déterminer la relation virulence-résistance aux antibiotiques ;
  • Etablissement d’un système de surveillance de la résistance aux antibiotiques en médecine vétérinaire.
  • Sensibilisation des responsables du secteur avicole par les problèmes de l’antibiorésistance