1 / 29

Les mycobactéries

Les mycobactéries. Dr N. Fortineau. Bactériologie-Virologie-Hygiène. CHU de Bicêtre (94). Les mycobactéries. > 70 espèces identifiées. Pathogènes obligatoires. Opportunistes. M. avium complex. M. tuberculosis complex. M. kansasii. M. leprae. M. xenopi. M. chelonae. M. fortuitum.

caradoc-clayton
Download Presentation

Les mycobactéries

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Les mycobactéries Dr N. Fortineau Bactériologie-Virologie-Hygiène CHU de Bicêtre (94)

  2. Les mycobactéries > 70 espèces identifiées Pathogènes obligatoires Opportunistes M. avium complex M. tuberculosis complex M. kansasii M. leprae M. xenopi ... M. chelonae M. fortuitum M. marinum ...

  3. La tuberculose - Mycobacterium tuberculosis - M. tuberculosis complex - Mycobacterium bovis - Mycobacterium africanum (- Mycobacterium microti) - Multiplication très lente (temps de génération 20h) - Persiste dans l'organisme (macrophage) - Réservoir essentiellement humain - Transmission quasi interhumaine par voie aérienne

  4. La tuberculose dans le Monde - 2000 M de personnes ont eu un contact infectant BK - Maladie persistante : 9 M de nouveaux cas T / an • Asie : 55% • 15% patients HIV + • Afrique : 31% • Europe : 5% - 2 M de décès / an (dont 25% HIV+, surtout en Afrique) - Prévalence mondiale en 2007 : 13,7 M de cas - 500.000 cas de tuberculose multi-Résistante - incidence/ 100.000 hbts en baisse de 1% / an

  5. Facteurs aggravant l'épidémie - Absence d'accès au traitement complet - Absence ou retard de diagnostic - Émergence de la résistance aux anti-tuberculeux - Infection par le VIH (Afrique sub-saharienne) - Mouvements de populations - Populations défavorisées des pays industrialisés

  6. La tuberculose en France (2006) - Europe occidentale : incidence 17 / 105 ( Ex URSS : 110 / 105 ) - France : 8,5 / 105 en régression constante depuis 1993 (- 40%) 2006 SDF (5336 cas) (181 / 105) RégionIDF Age > 75 ans Origine étrangère (17,3 / 105 ) 37% (23 / 105) (39 / 105)

  7. Résistance aux AntiTuberculeux : définitions Résistance primaire : nouveaux cas (= jamais traités par antituberculeux) Résistance secondaire : cas déjà été traités 1 mois par antituberculeux Multirésistance : Résistance INH+RMP Ultrarésistance Multirésistance + R à Fluoroquinolones + R à 1 aminoside autre que streptomycine (amikacine/capréomycine)

  8. Résistance aux AntiTuberculeux en France (2005) - Ethambutol : 0,6 % Résistance "primaire" - Isoniazide : 4,2 % - Rifampicine : 0,9% 8,8 % R à 1 AT - Streptomycine : 6,3 % Multi-résistance primaire (INH + RIF) : 0,7% - Ethambutol : 3,5 % Résistance "secondaire" - Isoniazide : 14 % - Rifampicine : 8,9 % 21% R à 1 AT - Streptomycine : 11,7 % Multi-résistance secondaire (INH + RIF) : 6,9 %

  9. Résistance aux Anti-Tuberculeux en France - Cas de tuberculose multi-R environ 70 / an - 1,3% de tuberculose multi-R (taux faible) - 2/3 des multi-R sont primaires - Naissance dans un pays étranger : R primaire et secondaire + élevées - Infection par le VIH : R secondaire plus élevée - 42% de guérison après 2 ans de traitement - Excrétion de BAAR multi-R est prolongée

  10. Diagnostic bactériologique de la tuberculose Différentes étapes - Prélèvement + / - Amplification génique (PCR) - Examen direct - Culture - Identification - Antibiogramme

  11. Diagnostic bactériologique de la tuberculose pulmonaire - Choix des prélèvements : - Expectoration spontanée (à jeun au réveil) x 3 jours - Expectoration provoquée (séance de kiné) x 3 jours - Tubage gastrique (à jeun au réveil) x 3 jours - Fibroscopie bronchique avec aspiration +/- biopsies si lésions - Lavage bronchoalvéolaire (petit volume 20 ml de H2O) - Liquide pleural, biopsie de plèvre, biopsie ganglionnaire... - Hémocultures dans miliaire et formes disséminées (milieux spéciaux)

  12. Diagnostic bactériologique de la tuberculose pulmonaire Examen microscopique direct : JO - Colorations de Ziehl et fluorescence (auramine) après concentration/ fluidification - Sensibilité : 104 - 105 BAAR/ml = + dans 60% des tuberculoses pulmonaires - Positivité souvent synonyme de tuberculose chez l'immunocompétent Mais ne permet pas d'identifier directement l'espèce de mycobactérie - Très souvent négatif dans la miliaire tuberculeuse

  13. Diagnostic bactériologique de la tuberculose pulmonaire Examen microscopique direct : JO Coloration auramine x 400 Coloration de Ziehl x 1000

  14. Diagnostic par Amplification Génique Principe : amplification et détection d'une cible (ADN ou ARN spécifique) Contre Pour Bonne sensibilité théorique (si direct + 95%) Sensibilité controverservée (inhibiteurs) (si direct négatif : sensibilité < 60% / culture) Bonne spécificité (98%) Mauvaise valeur prédictive négative Rapidité du résultat (< 24h) Coût élevé (B250) / culture (B60) Ne permet pas de s'affranchir de la culture Tests disponibles : PCR "maison" IS6110 SDA (Test Probetec, BD) PCR (Test Amplicor, Roche Diagnostic System) TMA (Test Gene Probe BioMérieux)

  15. Diagnostic de tuberculose par culture - Seul diagnostic de certitude - Permet l'identification ultérieure et la réalisation de l'antibiogramme - Durée +++ : 15 jours à 3 mois (milieu solide) à 8-20 jours (milieu liquide)

  16. Diagnostic bactériologique de la tuberculose Objectifs de l'American Thoracic Society et du C.D.C. (1995) - Résultats de l'examen direct ≤ 24 h (J0) - Obtenir une culture positive ≤ J10 - Identification de M. tuberculosis à J15-J21 - Antibiogramme de M. tuberculosis à J21-J28

  17. Diagnostic biologique de la tuberculose Timing des différentes étapes J0 - Prélèvement J0-J1 - Examen direct J6-J60 - Culture + - Identification + 4-10 J - Antibiogramme + 10-21 J 20-80 J

  18. Diagnostic bactériologique de la tuberculose Techniques "classiques" de référence : LONG - Culture en milieu solide à base d'oeuf : Löwenstein-Jensen - Identification : Délai de croissance 20-30 jours + Aspect et pigmentation des colonies 20-30 jours Tests biochimiques

  19. Diagnostic bactériologique de la tuberculose Techniques "récentes" : + RAPIDES - Culture en milieu liquide avec système de détection : Production de CO2 ou Consommation d' O2 - Avantages : • Délai de culture < 15 jours pour M. tuberculosis • Sensibilité 94 % Liquide + LJ : 100 % (LJ : 65-75 %) • Antibiogramme directement réalisable en 7-10 jours

  20. Identification rapide des mycobactéries à partir des cultures en milieu liquide - Techniques phénotypiques • H.P.L.C des acides mycoliques, mise en évidence d’antigènes spécifiques - Techniques génotypiques • Hybridation de l ’ADN ou ARN avec sondes spécifiques (AccuProbe) • Amplification génique (P.C.R.) • Restriction de l ’ADN par des endonucléases spécifiques (R.F.L.P) • Séquençage de fragments d ’ADN

  21. PCR-RFLP / Technique PRA (gène rpoB) 1. M. gordonae 10. M. phlei 11. M. pulveris 2. M. szulgai 12. M. fortuitum I 3. M. kansasii I 13. M. austroafricanum 4. M. gallinarum 14. M. smegmatis 5. M. avium 15. M. marinum 6. M. scrofulaceum 7. M. asiaticum 8. M. chelonae 9. M. moriokaese d'après Lee H. et coll.,J. Clin. Microbiol., 2000

  22. PCR-Hybridation inversée / Test LiPA Mycobactéries substrat Mycobacterium sp. M. tuberculosis compl. M. kansasii M. xenopi M. gordonae M.A.I.S M. avium M. intracellulare M. scrofulaceum M. chelonae M MAIS MG MC MK MA MTB NM Cible ADN : région intercistronique codant pour ARN16s

  23. Traitement de la Tuberculose pulmonaire - En l'absence de traitement : Mortalité 50% Guérison spontanée : 30% Chronicité : 20% - Avec antituberculeux : Mortalité 5% - Les Antituberculeux : 4 Majeurs Isoniazide (1952) Streptomycine (1944) PAS (1946) Rifampicine (1965) Kanamycine (1957) Pyrazinamide (1980) Ofloxacine (1987) Ethambutol (1968)

  24. J0 M1 M2 M3 M4 M5 M6 Mois Isoniazide 4-5 mg/kg/j Rifampicine 10 mg/kg/j Pyrazinamide 20-30 mg/kg/j +/- Ethambutol 15-20 mg/kg/j Traitement de la Tuberculose pulmonaire

  25. Traitement de la Tuberculose pulmonaire * M1-M2 M3-M6 M7-M9 Rifater 1cp/12 kg Traitement standard - Rifinah 1cp/30 kg +/- éthambutol 15 mg/kg Rifampicine 10 mg/kg Rifampicine 10 mg/kg Grossesse Isoniazide 4-5 mg/kg Isoniazide 4-5 mg/kg Ethambutol 10 mg/kg en une prise quotienne, à distance d'un repas * à bacilles sensibles

  26. Traitement de la Tuberculose pulmonaire multi-R Associer au moins 3 antituberculeux actifs pendant 18 mois - Ofloxacine - Amikacine - Streptomycine - Ethionamide

  27. Surveillance du traitement de la tuberculose

More Related