TP1, Recherche de Parenté chez les Vertébrés Etablissement de Phylogénie

1. TP1, Recherche de Parenté chez les Vertébrés Etablissement de Phylogénie

2. Rappel du cours : 1. Comment appelle-t-on les caractères communs pour plusieurs espèces qui appartiennent aussi à leur ancêtre commun ? Des caractères homologues 2. A quel échelle peut-on comparer les caractères des vertébrés ? Macroscopique (anatomie, morphologie, embryon), cellulaire, moléculaire 3. Qu’est ce qu’une analogie ? Deux caractères qui se ressemblent mais qui ne sont pas hérités d’un ancêtre commun. 4. Pourquoi parle-t-on d’état primitif (ancestral) ou évolué (dérivé)pour un caractère ? Etat primitif : état le plus anciennement apparu Etat évolué : état apparu plus récemment par modification de l’état primitif

3. Schéma d’un arbre phylogénique Espèces actuelles ou fossiles Espèce 1 Espèce 2 Espèce 3 Espèce 4

4. Schéma d’un arbre phylogénique Espèces actuelles ou fossiles Espèce 1 Espèce 2 fossile Espèce 3 Espèce 4

5. Schéma d’un arbre phylogénique Espèces actuelles ou fossiles Espèce 1 Espèce 2 fossile Espèce 3 Espèce 4 Nœud : ancêtre commun Innovation génétique Passage d’un état ancestral à un état dérivé Plus vieil ancêtre commun

6. 4. Quels caractères doit-on choisir pour représenter la phylogénie la plus probable ? Des caractères homologues Identifier les innovations génétiques Repérer pour chaque innovation l’état dérivé et l’état ancestral

7. Lien vers tableau de caractère de l’exo 2 du TP1 • Remplir la matrice des taxons : sardine, aigle, chat, dauphin • et caractères : organes respiratoires, placenta et pièces basales 2. Coder les états de caractères dela matrice. Choisir un taxon extra-groupe (celui avec le plus d’états ancestraux) Colorer les états primitifs suivant l’extra-groupe Choisir une couleur pour les états dérivés Choisir « Colorer de la même manière les états identiques » (plutôt que « colorer case par case ») Cliquer sur les états dérivés à colorer dans le tableau Vérifier Remplir la matrice de la feuille de TP 3. Editer l’arbre Suivre les indications de la fiche de TP Pour indiquer les évolutions génétiques sur l’arbre, vous pouvez vous aider en cliquant sur « exploration de l’arbre » A chaque nœud apparait alors les innovations nouvelles acquises par l’ancêtre commun.

8. Schéma d’un arbre phylogénétique Placenta Pièce basale unique et poumons

9. Choisir un caractère supplémentaire : fenêtre temporale Remplir la matrice ainsi formée Plumes Fen. md. Allaitement 2 fen. temp. et 1 fen.temp. et poils Amnios Doigts Schéma de l’arbre phylogénétique des vertébrés Squelette osseux

10. Oiseaux Mammifères Reptiles Amphibiens Poissons Plumes Fen. md. Allaitement 2 fen. temp. et 1 fen.temp. et poils Amnios Doigts Schéma de l’arbre phylogénétique des vertébrés Squelette osseux

11. Oiseaux Mammifères Reptiles Amphibiens Poissons Plumes Fen. md. Allaitement 2 fen. temp. Peau à mucus et 1 fen.temp. et poils Amnios Doigts Schéma de l’arbre phylogénétique des vertébrés Squelette osseux

12. Tétrapodes Amniotes Sauropsides Oiseaux Amphibiens Mammifères Plumes Fen. md. Allaitement 2 fen. temp. Peau à mucus et 1 fen.temp. et poils Amnios Doigts Schéma de l’arbre phylogénétique des vertébrés Squelette osseux

13. A partir de la page 28 et 29 : Schéma de l’arbre phylogénétique des vertébrés Temps (millions d’année) - 150 Plumes Fen. md. - 220 Allaitement 2 fen. temp. Peau à mucus et 1 fen.temp. et poils Amnios - 300 Doigts - 360 Squelette osseux

14. Tableaux : Poste de travail, Commun srv jules, Biologie cochard

15. Arbre correspondant au tableau de caractère TS1-1 Amniotes Mammifères Sauropsides 2 fen. temp. 1 fen.temp. Amnios Une pièce basale

16. Arbre correspondant au tableau de caractère TS1-2 Tétrapodes Amniotes Amphibiens Mammifères Placenta 3 cavités cardiaques Amnios et 4 cavités cardiaques Présence de pattes

17. Correction du sujet 2A Pondichéry 2004 Matrice des distances : 0 8 0 10 4 0 8 10 8 0 10 4 0 9 0 Arbre phylogénétique de quelques vertébrés Homme Chimpanzé Kangourou Manchot Tortue