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Presentation Transcript

  1. De ADN a proteína

  2. Los genes se expresan con diferente eficiencia

  3. El mecanismo de transcripción

  4. Diferentes clases de ARN´s

  5. Transcripción en bacterias

  6. La cadena codificante tiene la misma secuencia que el transcrito

  7. Initiation • The promoter functions as a recognition site for transcription factors • The transcription factors enable RNA polymerase to bind to the promoter forming a closed promoter complex • Following binding, the DNA is denatured into a bubble known as the open promoter complex, or simply an open complex Elongation • RNA polymerase slides along the DNA in an open complex to synthesize the RNA transcript Termination • A termination signal is reached that causes RNA polymerase to dissociated from the DNA

  8. Promotor: secuencias de ADN que es reconocida por la ARN polimerasa y proteínas asociadas a ella para iniciar la transcripción purina

  9. Carácterísticas del promotor

  10. Los promotores tienen orientación

  11. La dirección de la transcripción de los genes puede variar en el cromosoma

  12. La ARN polimerasa es la encargada de copiar el ADN

  13. Factores sigma (s)

  14. Existen diferentes estados en la iniciación

  15. Elongación de la cadena

  16. NusA Terminación de la transcripción terminadores intrínsecos La RNA polimerasa se detiene URNA-ADNA apareamiento es débil No se necesita una proteína para remover físicamente a la RNA polimerasa del DNA

  17. terminadores dependientes de Rho rho utilization site sitios rut La proteína Rho es una helicasa Note: This is an intrastrand RNA:RNA interaction (folding stabilized by H-bonding of A-U and C-G)

  18. Mensajes policistrónicos

  19. Estructura de los mRNA

  20. Transcripción en eucariontes

  21. ARN polimerasas Structure of a bacterial RNA polymerase Structure of a eukaryotic RNA polymerase II

  22. Diferentes tipos de ARN polimerasas

  23. Los promotores eucariontes también tienen sitios consenso Generalmenteunaadenina • El núcleo del promotor es relativamente corto • consiste de la caja TATA, quién es importante para determinar el sitio preciso del inicio de la transcripción • El núcleo del promotor por sí mismo produce una transcripción de bajo nivel conocida como transcripción basal

  24. Transcripción basal

  25. A close complex • One subunit hydrolyzes ATP and phosphorylates a domain in RNA pol II known as the carboxyl terminal domain (CTD) • This releases the contact between TFIIB and RNA pol II • Other subunits act as helicases • Promote the formation of the open complex • TFIIH plays a major role in the formation of the open complex • It has several subunits that perform different functions RNA pol II can now proceed to the elongation stage Released after the open complex is formed

  26. Factores de transcripción

  27. Proteínas activadoras de la transcripción

  28. Procesamiento del ARN

  29. Adición del CAP • La fosfatasa remueve un • fosfato del 5´ • 2) Una guanil transferasa agrega GMP • 3) Una metil transferasa agrega un • grupo metilo

  30. Identificación experimental de los intrones RNA displacement loop mRNA cannot hybridize to this region because the intron has been spliced out from the mRNA

  31. Vista al microscopio electrónico Hybridization caused the formation of two R loops, separated by a double-stranded DNA region

  32. Se puede deducir el número de intrones

  33. Intrones del grupo I y II (autocatálisis)

  34. En eucariontes la transcripción de genes estructurales produce un transcrito largo conocido como pre-mRNA • También RNA heterogéneo nuclear (hnRNA) • Este RNA es alterado por corte y otras modificaciones antes de salir del núcleo • El corte requiere de la ayuda de un multicomponente estructural conocido como spliceosome

  35. Existen secuencias específicas en los límites exón-intrón

  36. Moléculas de ARN-proteína (snRNP) son las responsables del corte Intron loops out and exons brought closer together

  37. Intron will be degraded and the snRNPs used again

  38. Puede existir corte alternativo en los genes

  39. El corte alternativo puede producir varias isoformas a partir de un gen

  40. Terminación (Poliadenilación)

  41. El ARN es cortado y la enzima Poli-A polimerasa (PAP) agrega A´s

  42. Proteínas de unión al poli-A se unen al extremo 3´ hasta que el mensaje sale del núcleo

  43. Procesamiento del ARNr procariontes

  44. eucariontes

  45. Otros tipos de ARNs pequeños ayudan en la metilación

  46. El nucleolo es el lugar de síntesis de ARNr y ribosomas