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酵母 RNA 的提取. 1 、实验目的. 1 、掌握稀碱法提取 RNA 的原理和方法 2 、学习和了解其它提取 RNA 的方法和原理. 2 、实验重点和难点. 离心机的使用 提取 RNA 的实验原理. 3 、实验原理.
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1、实验目的 • 1、掌握稀碱法提取RNA的原理和方法 • 2、学习和了解其它提取RNA的方法和原理
2、实验重点和难点 • 离心机的使用 • 提取RNA的实验原理
3、实验原理 • 一般的生物细胞中同时含有DNA和RNA,在酵母中RNA比DNA的含量高得多, RNA(2.67~10.0%),DNA则少于2%(O.03%~O.516%),在实验室常用酵母作为RNA提取的材料。若要制备具有生物活性的RNA,可采用苯酚法、去污剂法和盐酸胍法等,最常用的是苯酚法提取RNA;若对生物活性没有要求,则可使用浓盐法,稀碱法等。工业中用稀碱法或浓盐法,主要用于制备核苷酸的原料.
苯酚法:组织匀浆用苯酚处理并离心后,RNA即溶于上层被酚饱和的水相中,DNA和蛋白质则留在酚层中,向水层加入乙醇后,RNA即以白色絮状沉淀析出,此法能较好地除去DNA和蛋白质。苯酚法:组织匀浆用苯酚处理并离心后,RNA即溶于上层被酚饱和的水相中,DNA和蛋白质则留在酚层中,向水层加入乙醇后,RNA即以白色絮状沉淀析出,此法能较好地除去DNA和蛋白质。 • 浓盐法:在加热的条件下,利用高浓度的盐改变细胞膜的透性,使RNA 释放出来,再利用等电点(pH为2.0~2.5)沉淀。此法易掌握,产品颜色较好。盐浓度需要控制,太低,RNA不易从细胞中释放出来,太高,细胞急剧收缩不利于抽提。一般80~120g/L为宜。
稀碱法:利用细胞壁在稀碱条件下溶解,使RNA释放出来,这种方法提取时间短,但RNA 在稀碱条件下不稳定,容易被碱分解; • 本实验采用的稀碱,既可加速细胞的破裂,又可增大 RNA的溶解度。当碱被中和后,可用乙醇(或者异丙醇)将RNA沉淀,或用等电点沉淀RNA(应严格控制pH,缓慢调),此为 RNA的粗品。
核糖核酸含有核糖、嘌呤碱、嘧啶碱和磷酸各组分。加硫酸煮沸可使其水解,从水解液中可以测出上述组分的存在。核糖核酸含有核糖、嘌呤碱、嘧啶碱和磷酸各组分。加硫酸煮沸可使其水解,从水解液中可以测出上述组分的存在。
核酸 水 解 核苷酸 磷酸 核苷 戊糖 碱基
(1)嘌呤碱与硝酸银作用产生白色的嘌呤银化合物沉淀。(1)嘌呤碱与硝酸银作用产生白色的嘌呤银化合物沉淀。 • (2)磷酸与钼酸铵试剂作用产生黄色的磷钼酸铵沉淀[(NH4)3PO4·12MoO3↓],有还原剂存在时,形成蓝色钼蓝。
Vit • C • (NH4)MoO4+H2SO4 H2MoO4+(NH4) 2SO4 • H3PO4+12H2MoO4 H3P(Mo3O10) 4+12H2O • H3P(Mo3O10) 4 Mo2O3 •MoO3(钼蓝) • 还原产物钼蓝在波长660nm测定吸光值,当无机磷含量在1—25μg 范围内,光吸收和含磷量成正比。 • RNA的含磷量为9.5%,即1μg RNA磷相当于10.5 μg RNA。DNA的含磷量平均为9.9%。
(3)地衣酚(苔黑酚)显色法:RNA与酸共热时降解,形成戊糖,继而形成糠醛(α-呋喃甲醛),糠醛与地衣酚(3,5-二羟基甲苯)反应,形成鲜绿色复合物,可用比色法测定。当 核糖核酸浓度在 10~100μg/ml 范围内,其浓度与吸光度成线性关系需要FeCl3或Cu2+作催化剂。
4、实验操作 (一)RNA的提取 (1)称5g干酵母粉于150 ml三角烧瓶中,加25ml O.2%的 NaOH,沸水浴中搅拌提取20 min。冷却后滴加乙酸使其略偏酸性,pH约5-6,目的是去除蛋白质。 (2)离心(4000 r/min,13 min),去除沉淀。上清液冰浴。 (3)向上清液中加入20 ml(约上清液的两倍体积)95%乙醇,稍搅拌后静置(冰浴约10min)。待完全沉淀后离心(4000 r/min,15 min) ,去上清液。 (4)沉淀用95%乙醇洗两次(如沉淀浮起需再次离心),每次约10mL;用乙醚洗两次,每次10mL。目的是去除脂溶性物质和水,乙醚的沸点比乙醇的低,所以最后加乙醚有利于沉淀的干燥。
(二)RNA的鉴定 取沉淀约1g,加10 ml 10%H2SO4→沸水浴中加热30 min。 • (5).嘌呤碱 取水解液2mL加入2mL浓氨水,然后加入约1mL 5%硝酸银溶液,观察有无嘌呤碱的银化合物沉淀。(慢慢加入嘌呤碱时,沉淀上浮,摇匀,沉淀下沉) • (6).核糖 取1支试管加入水解液0.5mL、1mL苔黑酚三氯化铁浓盐酸溶液。放沸水浴中2分钟。注意溶液是否变成绿色,说明核糖的存在。时间久了会有黑色沉淀,是浓度高,产物结晶出来了。
5、注意事项 • 避开磷酸二酯酶和磷酸单酯酶作用的温度范围20~70℃,防止RNA 降解。在90~100℃条件下加热可使蛋白质变性,破坏磷酸二酯酶和磷酸单酯酶,有利于RNA 的提取。 • 在调pH 值时,一定要缓慢小心,且要在低温下进行。 • 在洗涤时,要用乙醇洗涤,且不可用水洗,否则将导致RNA 部分溶解而造成损失,降低RNA 提取率。
提取 RNA 时必须用沸水浴,并经常搅拌,NaOH 必须实现预热。 • 用乙酸调 pH5~6 必须有,目的可以除去一些杂质。 • 最后过滤前必须将乙醇沥干,不能带水,否则 RNA 会粘在滤纸上, 无法取下。也可以采用离心的方法。 • 所得 RNA 粗品应是浅黄色粉末状。
6、原始数据 • 记录实验过程中的现象
7、讨论 • 7.1、用稀碱法提取酵母RNA的过程中需注意什么? • 7.2、鉴定RNA的原理?