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Serviços de genotipagem em plataforma iScan / Illumina : colaboração entre a DEOXI & EMBRAPA. Rodrigo Alonso Deoxi Biotecnologia Diretor Executivo. Empresa Privada – Fundada em Araçatuba /SP – Out/2008. “Spin Off”. Campus de Araçatuba. NOSSA MISSÃO
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Serviços de genotipagememplataformaiScan/Illumina: colaboração entre a DEOXI & EMBRAPA Rodrigo Alonso DeoxiBiotecnologia DiretorExecutivo
EmpresaPrivada – FundadaemAraçatuba/SP – Out/2008 “Spin Off” Campus de Araçatuba NOSSA MISSÃO Desenvolverprodutos e processosinovadoresembiotecnologia, atravésdaintegração do conhecimentocientífico, tecnologiasavançadas e gestãoestratégica.
Serviços MiSeq (NGS) Coleta Armazenamento iScan - Illumina Extração de DNA Golden Gate Infinium Rastreabilidade Soluçõesem Genômica Teste de Paternidade por SNP Elaboração e Gerenciamento de Projetos Farmacogenômica AnálisesGenômicas DiagnósticoGenético Pré -Implantacional Bioinformática
Histórico de P&D • Pesquisa Inovativa em Pequenas Empresas – PIPE/FAPESP (Fase I e II) • Diagnóstico genético pré-implantacional em embriões bovinos • produzidos in vitro. • Programa PRIME – Primeira Empresa Inovadora – FINEP • Aplicação da seleção assistida por marcadores moleculares nos programas de • transferência de embriões bovinos. • Pesquisa Inovativa em Pequenas Empresas – PIPE/FAPESP (FASE I) • Desenvolvimento de teste de DNA para seleção de touros de alta fertilidade. • Subvenção Econômica - FINEP • - DNAids: Diagnóstico rápido da predisposição genética aos efeitos adversos em pacientes HIV+ submetidos à terapia anti-retroviral.
Histórico de P&D Histórico de P&D • RHAE – Pesquisador na Empresa – CNPq • Desenvolvimento de “NanoChipsGenômicos” para aplicação em saúde humana, agropecuária e meio ambiente. • Pesquisa Inovativa em Pequenas Empresas – Subvenção 2012 PAPPE/PIPE – FAPESP/FINEP – Desenvolvimento de linhagem congênica de bovinos da raça Nelore com mutação no gene da miostatina. • Pesquisa Inovativa em Pequenas Empresas (PIPE – FAPESP) • - Uso de arraysgenômicos de alta resolução e “NextGenerationSequencing” no diagnóstico de deficiência intelectual e anomalias congênitas – PIPE Fase II.
PlataformasIllumina… Dedicated array instrument. Sequencing-compatible array instrument. Low to mid-plex molecular testing. Two proven technologies. One powerful platform. BeadXpress iScan HiScan HiScanSQ
Tecnologia Bead Array… Bead Arrays
BeadArray Technology iScan GOLDENGATE INFINIUM
Golden Gate X Infinium INFINIUM GOLDENGATE Diversosprodutosprontosparaseremutilizados De 3K – 5 milhões SNPs PainéisCustomizados De 96 – 3072 SNPs • Alta Sensibilidade • Alto limite de detecção • Alta reprodutibilidade • Dados de altaqualidade • Call Rate > 99% • Plataformarobusta
PorcineSNP60 BeadChip - 62,163 informative SNP markers OvineSNP50 BeadChip - 54,241 informative SNP markers CanineHD - 170,000 SNP markers Maize SNP50 BeadChip - 56,110 informative SNP markers
Qual a vantagem de terceirizar serviços de genotipagem? • Alto Custo dos Equipamentos • Alta capacidade de análise • Mão de obraespecializada • Comprometimento com o resultado • Comprometimento com prazos • Poder de negociação • Custo-benefício
Monica Correa Ledur • Ricardo Zanella • Rodrigo Torres (BRF) • Marcos Vinícius Barbosa da Silva • Maria Gabriela Peixoto • Marta Martins • Marco Antônio Machado • JoãoCláudioPanetto • FabianeSiqueira • Andrea do Egito • Fernando Flores Cardoso
“Next-Generation Sequencing” MiSeq/Illumina
rodrigo@deoxi.com.br www.deoxi.com.br