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生存分析 survival analysis

生存分析 survival analysis. 生存资料. 一些医学事件所经历的时间：从开始观察到事件发生的时间，不是短期内可以明确判断的 乳腺癌病人术后生存时间 幼儿乳牙萌出的时间 白血病病人化疗后缓解持续的时间 两种方法治疗某慢性病产生疗效的时间 针对这类生存资料的分析方法：生存分析. 生存分析. 生存分析：研究既有事件的发生时间又有事件结局资料的统计学方法；强调所研究问题的结果变量是某一事件发生的时间 基本目的： 描述生存过程 比较不同人群的生存过程 分析生存时间的相关因素. 生存资料的特点. 生存资料的特点 随访资料

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生存分析 survival analysis

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Presentation Transcript

  1. 生存分析survival analysis

  2. 生存资料 • 一些医学事件所经历的时间：从开始观察到事件发生的时间，不是短期内可以明确判断的 • 乳腺癌病人术后生存时间 • 幼儿乳牙萌出的时间 • 白血病病人化疗后缓解持续的时间 • 两种方法治疗某慢性病产生疗效的时间 • 针对这类生存资料的分析方法：生存分析

  3. 生存分析 • 生存分析：研究既有事件的发生时间又有事件结局资料的统计学方法；强调所研究问题的结果变量是某一事件发生的时间 • 基本目的： • 描述生存过程 • 比较不同人群的生存过程 • 分析生存时间的相关因素

  4. 生存资料的特点 • 生存资料的特点 • 随访资料 • 时间和结局(失效、删失) • 有不完全数据 • 通常不服从正态分布

  5. 生存资料survival data 2 3 1 5 4 1992.03.04 2001.12.31

  6. 生存分析的基本概念---终点事件/起始事件 • 终点事件outcome event：失效事件 failure event，指研究者所关心的特定事件，如死亡、复发、出牙； • 起始事件：标志研究对象生存过程开始的特征事件称为起始事件，与终点事件相对应，如确诊、手术、开始采取措施，开始观察

  7. 生存分析的基本概念---生存时间 • 生存时间survival time(失效时间failure time)：终点事件与被观察对象发生终点事件之间所经历的时间间隔，用t表示。 • 要获得准确的生存时间 • 研究目的不同，时间单位不同，使用恰当的时间单位 • 从疾病确诊到死亡 • 从治疗开始到治愈 • 从出生到第一颗乳牙萌出

  8. 生存分析的基本概念---死亡概率/生存概率 • 死亡概率q：在某时间区间内的被观察对象在该时间区间内(无失访)死亡的概率估计 • 生存概率p：在某时间区间内(无失访)的被观察对象在该时间区间内生存的概率估计

  9. 生存分析的基本概念---终检 • 终检censoring：删失值，在终点事件发生前，由于某种原因被观察对象的观测过程终止了。 • 右删失：终点事件发生在最后一次观察的右方 • 特点：不完全信息(不知道确切生存时间)，但可知真实的生存时间不会短于现在观察到的时间 • 发生的原因： • 失访 • 随访结束时仍存活 • 死于其他原因 • 治疗措施改变

  10. 生存分析的基本概念---生存率 • 生存函数 (累计生存概率)：个体生存时间大于t的概率。任一时刻t对应的生存函数就是该时点的生存率 • S(0)=1； • 2年生存率：个体生存时间超过2年的概率S(2) • 生存曲线：所有时点的生存率构成生存曲线

  11. 生存分析的基本概念---生存率 • 生存率计算 • 无删失： • 有删失，需分段计算各时间段的生存概率pi ，然后利用概率乘法将pi相乘得到t时刻的生存率

  12. 乘积极限法(K-M法)估计生存率 • 适用于小样本资料，对删失数据无校正 • 例：研究人员对20名某肿瘤术后病人进行跟踪随访三年，记录他们的生存时间。试估计生存率绘制生存曲线

  13. 乘积极限法(K-M法)估计生存率

  14. 总体生存率的区间估计 • K-M法计算的样本生存率是总体生存率的点估计 • 区间估计： + • SE是标准误

  15. 生存曲线及中位生存期 • 生存曲线 survival curve：以随访时间为横坐标，生存率为纵坐标绘制的曲线

  16. 生存曲线及中位生存期 • 中位生存期median survival time：半数生存时间/平均生存时间，恰好由50%个体存活s(t)=0.5的时间 • 生存时间一般为非正态，故用中位生存期 • 可采用内插法计算： t0.5=20.4(月) • 如果生存期最长的死亡对象的生存率高于50%，则无法估计中位生存期。

  17. 生存寿命表法计算生存率 • 适用于大样本资料 • 数据按时间区间分组 • 利用删失资料信息，按删失资料对进行校正 • 区间中的删失个体折算半个人时 • 例：10.2

  18. 寿命表法计算生存率

  19. 生存率曲线的比较 • Log-rank检验：时序检验，属于非参数方法，比较整个生存时间的分布 • 大样本卡方检验 • 2条或多条生存曲线比较 H0：总体生存率曲线相同 H1：总体生存率曲线不同

  20. 例10.3 现有两组白血病病人的随访研究资料，其缓解时间（周）记录如下，现欲比较治疗组与安慰剂组的病人生存曲线是否一样？ • 资料： • 治疗组(第1组)： 6，6，6，7，10，13，16，22，23，6+，9+，10+，11+，17+，19+，20+，25+，32+，32+，34+，35+ • 安慰剂组（第2组）：1，1，2，2，3，4，4，5，5，8，8，8，8，11，11，12，12，15，17，22，23

  21. 试验组 对照组 两组生存曲线的统计描述

  22. Log-rank test　方法

  23. 计算Log-rank检验统计量 • H0为真时，Log-rank统计量2服从自由度为1的卡方分布。

  24. Log-rank 检验的实例计算 • 本例的检验统计量计算为 • 查卡方界值表，P<0.001，基于两组生存曲线的位置，可以认为试验组的生存率高于对照组，差异有统计学意义。

  25. Stata软件实现 • 一、用Stata软件计算生存率及95％可信区间 1.定义生存分析的时间变量是time,结果变量是status stset time status 2.显示Kaplan-Meier方法的计算生存率结果 sts list

  26. Stata软件实现 • 二、用Stata软件绘制生存曲线 1.定义生存分析的时间变量是time,结果变量是status stset time status 2. 绘制Kaplan-Meier法估计的生存曲线 sts graph

  27. Stata软件实现 • 三、用Stata软件进行Log Rank检验 1.确定生存分析的时间变量是week,结局变量是outcome Stset week outcome 2.对两条曲线进行Log Rank检验 sts test group,logrank 即：Sts test 分组变量，logrank

  28. 谢谢！

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