1 / 46

AKTIVITAS GEN DAN PENGATURANNYA: SINTESIS PROTEIN

AKTIVITAS GEN DAN PENGATURANNYA: SINTESIS PROTEIN. dr. Arfianti, M.Biomed, M.Sc. Protein. Working molecules of the cells Action and properties of cells Encoded by genes

foster
Download Presentation

AKTIVITAS GEN DAN PENGATURANNYA: SINTESIS PROTEIN

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript


  1. AKTIVITAS GEN DAN PENGATURANNYA: SINTESIS PROTEIN dr. Arfianti, M.Biomed, M.Sc

  2. Protein • Working molecules of the cells • Action and properties of cells • Encoded by genes • Gene: Unit of DNA that contain information to specify synthesis of single polipeptide chain or functional RNA (tRNA and rRNA)

  3. Gene expression • Information encoded in gene is transformed to protein • Gene products: protein and RNA

  4. 4 basic molecular genetic processes

  5. Transkripsi

  6. MODIFIKASI POST TRANSKRIPSI RNA splicing • DNA yang tidak mengkode protein (non-coding region=intron) dan bagian DNA yang mengkode protein (coding region=ekson). • Proses pemotongan intron dan ekson yang ada digabungkan Capping (tudung) penambahan GTP pada 5’-end mRNA  melindungi RNA dari degradasi oleh enzim hidrolitik di dalam sitoplasma dan sebagai tempat awal perlekatan ribosom.

  7. Poli Aujung 3’ ditambahkan ekor poli A yang terdiri dari 30 sampai 200 nukleotida adenin yang fungsinya sama seperti capping.

  8. KODE GENETIKA • Sintesis protein KODE GENETIK yang terdapat pada mRNA • 64 triplet nukleotida  kodon • Setiap kodon menyandi salah satu dari 20 asam amino • Satu asam amino >1 kodon. • AUG: START CODON/Met • UAA, UAG dan UGA : STOP CODON

  9. TRANSLASI • penerjemahan kode genetik pada mRNA  protein • 3 types of RNA: • mRNA: membawa informasi genetik dalam bentuk kodon • tRNA: bertugas menterjemahkan dan mentransfer asam-asam amino yang sesuai dengan kodon • rRNA: bergabung dengan suatu kompleks protein membentuk ribosom, katalisis proses sintesis polipeptida

  10. tRNA

  11. Aminoacyl-tRNA synthetase  menggabungkan asam amino dengan tRNA yang sesuai • 20 macam enzim ini di dalam sitoplasma.

  12. RIBOSOM • terdiri atas subunit besar dan subunit kecilprotein-protein dan rRNA • mempunyai 3 tempat untuk pengikatan tRNA: • P-site (tRNA peptidil): tempat pengikatan tRNA yang membawa rantai polipeptid yang sedang tumbuh. • A-site (tRNA-aminoasil): tempat pengikatan tRNA yang membawa asam amino yang berikutnya akan ditambahkan pada rantai polipeptida. • E-site (tRNA-Elongasi): tRNA yang tidak lagi mengandung asam amino meninggalkan ribosom melalui E-site.

  13. Ribosom

  14. TAHAPAN PROSES TRANSLASI • Inisiasi • Elongasi • Terminasi

  15. Translasi

  16. MODIFIKASI POST-TRANSLASI • Folding (pelipatan) konformasi spesifik • Asetilasi, glikosilasi, fosforilasi, hidroksilasi • Pemisahan satu atau lebih asam amino pada ujung amino rantai polipeptida • Pembelahan rantai polipeptida menjadi dua atau lebih potongan. Contoh insulin • Bergabung dengan rantai polipeptida lainnya • Perubahan modifikasi protein penyakit (c: Alzheimer’s)

  17. PENGATURAN AKTIVITAS GEN

  18. Ciri organisme  kemampuan untuk beradaptasi terhadap perubahan  survive  pengaturan aktivitas gen Pengaturan metabolisme • Kontrol metabolisme: • Mengatur jumlah enzim spesifik  mengatur ekspresi suatu gen • Mengatur aktivitas katalitik dari enzim yang sudah ada

  19. Prekursor Gen 1 Enzim 1 Gen 2 Enzim 2 Gen 3 Enzim 3 Triptofan

  20. PENGATURAN AKTIVITAS GEN PROKARIOT • 2 katagori enzim: • Enzim yang tidak diregulasi  enzim konstitutif • Enzim tergantung kepada metabolit yang spesifik, misalnya substrat dapat diregulasi.

  21. Pengaturan aktivitas gen bakteri  Francois Jacob dan Jacques Monod (1961) sistem operon. • Operon  sekelompok gen yang berhubungan erat dan terlibat dalam sintesis sekelompok protein yang terlibat dalam biosintesis suatu asam amino

  22. System operon terdiri dari: • Gen pengontrol  gen operator dan promoter • Gen operator menentukan akses RNA polimerase ke gen struktur. • Gen promoter  tempat inisiasi transkripsi • Gen struktur adalah gen yang akan ditranskripsi dan ditranslasi menghasilkan protein sesuai dengan fungsi gen tersebut.

  23. Lac-operon: operon indusibel • Produksi energi dari -galaktosidase • -galaktosidase memecah laktosa glukosa dan galaktosa. • Gen struktur gen z (-galaktosidase), gen y (permease) dan gen a (transasetilase). • Gen pengatur (gen i)  protein represor • operon indusibel jalur katabolik enzim-enzim diproduksi hanya jika nutriennya tersedia maka dapat dihindarkan pembuatan protein yang tidak diperlukan.

  24. Trp – operon: operon represibel • E. coli mensintesis triptofan dari sebuah molekul precursor melalui beberapa tahap reaksi. • Seluruh enzim yang diperlukan untuk sintesis triptofan dikelompokkan menjadi satu di dalam kromosom. • Satu promoter bekerja untuk seluruh gen yang menyandi enzim tersebut, membentuk unit transkripsi. • Operon represibel  jalur anabolic, jika triptofan dalam sel kadarnya >>  mekanisme umpan balik

  25. trp-operon dan lac-operon kontrol negatif aktivitas gen  operon diubah menjadi off oleh protein repressor yang aktif • kontrol positif jika protein activator berinteraksi langsung dengan gen operator menyebabkan operon menjadi on.

  26. PENGATURAN AKTIVITAS GEN EUKARIOT • Lebih kompleks • Struktur gen eukariot yang lebih kompleks • Organisme multiseluler  diferensiasi • Diferensiasi  spesialisasi dari struktur dan fungsi sel selama periode perkembangan suatu organisme. • Pengaturan aktivitas gen eukariot  setiap langkah dalam jalur dari gen sampai protein fungsional.

  27. Kromosom eukariot DNA 2 X 108 nt 6 cm ribuan kali lebih panjang dari diameter nucleus. • Seluruh DNA dalam 46 kromosom dapat masuk ke dalam nucleus melalui system pengemasan DNA yang kompleks.

  28. DNA dikemas dengan protein histon  nukleosom • H1, H2A, H2B, H3 dan H4. • Nukleosom  DNA dan 2 molekul histon (dari H2A, H2B, H3 dan H4)  H1  benang kromatin  30 nm protein non-histon melipat kromosom • Proses replikasi dan transkripsi DNA dalam kromosom baru bisa terjadi jika protein histon dan non-histon melepaskan diri dari DNA.

  29. Kromosom dg miskroskop elektron: • Heterokromatin  lebih padat/gelap gen tidak aktif • Eukromatin  lebih terang  gen aktif

  30. Pengaturan aktivitas gen eukariot dapat terjadi melalui: • Modifikasi struktur kromatin • Inisiasi transkripsi • Modifikasi post transkripsi • Kontrol translasi • Modifikasi post translasi

  31. Modifikasi kromatin • Metilasi DNApenempelan gugus metil (-CH3) pada basa DNA (citosin)  tidak aktif  demetilasi  inaktif menjadi aktif. Contohnya salah satu kromosom X-nya banyak memiliki gugus metil sehingga biasanya salah satu kromosom X tersebut tidak aktif. • Asetilasi histonpenempelan gugus asetil (-COCH3) pada asam amino tertentu dari protein histon  ikatannya terhadap DNA menjadi melonggar mempermudah akses factor transkripsi

  32. Kontrol transkripsi • Struktur gen eukariot, terdiri dari: • oEkson • oIntron • oElemen kontrol inisiasi transkripsi: • Promoter • Enhancer  terletak jauh dari gen yang dikontrolnya Faktor transkripsi yang berinteraksi dg enhancer dan menstimulasi transkripsi activator inhibisi transkripsi disebut repressor.

  33. Kontrol modifikasi post transkripsi • Alternatif splicing: beberapa molekul mRNA mature dihasilkan dari 1 molekul pre-mRNA • Pengaturan degradasi mRNA Molekul mRNA sel prokariot umur pendek didegradasi oleh enzim di dalam sitoplasma dalam beberapa menit. mRNA sel eukariot bisa berjam-jam, berhari-hari atau bahkan berminggu-minggu

  34. Kontrol translasi • Kontrol inisiasi translasi  penempelan subunit kecil ribosom dan tRNA inisiator. • Translasi dapat dihambat apabila suatu protein regulator mengikatkan diri pada ujung 5’ mRNA mencegah penempelan ribosom • Contoh: sel telur banyak menyimpan mRNA di sitoplasmanya yang tidak ditranslasi sampai tepat sesudah fertilisasi.

  35. Kontrol modifikasi post translasi • Modifikasi protein dan transport protein ke sel sasarankontrol ekspresi gen. • Protein  umur yang terbatas  degradasi. • Protein siklin  siklus sel  umur yang relatif pendek agar berfungsi dengan baik Mutasi gen siklin  protein tidak didegradasi  kanker.

More Related