Unveiling fungal zooflagellates as members of freshwater picoeukaryotes: evidence from a molecular

1. Unveiling fungal zooflagellates as members of freshwater picoeukaryotes: evidence from a molecular diversity study in a deep meromictic lake Lefèvre et al., 2007

2. Etude de la biodiversité de picoeucaryotes basée sur des méthodes moléculaires au Lac Pavin U33: Diversité des Organismes Marins Exposé présenté par: HAMOUDA Amine Lojou Vincent Etudiants en Master I – COM

3. Lac Pavin Géographiquement:

5. Lac Pavin • Il est né d'une explosion volcanique qui creusa le flanc du puy de Montchal. • De forme presque circulaire, surface de 44ha, profondeur max est de 92m, enchâssé dans une forêt, et influence anthropique relativement faible.

6. Procédé expérimental • L’échantillonnage à des profondeurs variables: • 5m (épilimnion) • 9-10m (métalimnion) • 30 m (hypolimnion) • 56-59 m (oxycline) • Filtration: On n’a gardé que les organismes de taille <5µm

7. Procédé expérimental • Extraction d’ADN + Amplification par PCR • Détection des ADNr 18S • Détermination des affiliations phylogéniques, calcul des distances et alignement par des méthodes Bioinformatiques. Construction de l’arbre phylogénique

8. T(°C), O2 (mg l–1) T(°C), O2 (mg l–1) Chl a (μg l–1) Chl a (μg l–1) Profil vertical de température, d'oxygène et de Chlorphylle a mesurés le 310804 au Lac Pavin Profil vertical de température, d'oxygène et de Chlorophylle a mesurés le 061004 au Lac Pavin

9. Fungi Rhizaria Alvéolés

10. Arbre Phylogénétique • Nouveau clade 1: Asteronella formosa un Diatomée parasité par un Rhizophydium

11. Fungi Rhizaria Alvéolés

12. Nouveau clade 4 est frère des Euglypha rotunda Euglypha rotunda Euglypha sp

13. Fungi Rhizaria Alvéolés

14. Nouveau clade 5 fait parti des Perkinsea, ici une espèce qui parasite un bivalve: philippinarum

15. Courbes de raréfaction • Sont obtenus par extrapolation des valeurs d’OTU en fonction du nombre de clones, via des outils informatiques. • Le palier est synonymes de biodiversité maximale atteinte.

16. Courbes de raréfaction Zone oxique du 310804 Zone oxique 061004 % OTU Zone oxycline 061004 Zone oxycline 310804 Nombre de clones

17. Courbes de raréfaction • Biodiversité maximale atteinte: • 310804: en oxycline (50-60 m) • 061004: en zone oxique( 0-60 m)

18. Abondance relative 310804 Zone oxique Oxycline Abondance en %

19. Abondance relative 061004 Zone oxique Oxycline Abondance en %

20. Conclusion • La communauté du lac Pavin est unique: • Meromictie • Biodiversité découverte avec 5 nouveaux clades • Le parasitisme est important dans la communauté des picoeucaryotes, et influence sur les producteurs primaires.

21. Conclusion • Diversité très variable en fonction de la saison. • 2 écosystèmes dans le lac Pavin: • Oxycline • La zone oxique • Les populations sont différentes en comparaison avec d’autres études sur des lacs.

22. Conclusion • Une grande diversité des picoeucaryotes est à découvrir.

23. Critiques • Les valeurs de Bootstrap sont parfois illisibles, ceci ne nous permet pas de discuter la solidité de l’arbre.

26. Critiques • Certains graphiques sont difficilement lisibles.

27. Critiques • La méthode est basée uniquement sur les phylogénies moléculaires • Utilisation d’autres marqueurs moléculaires pour renforcer la phylogénie. • L’écosystème des nouveaux clades découverts?

28. FIN

29. Bibliographie • Olive P., BoulègueJ. ;étude biogéochimique d'un lac méromictique :le lac Pavin, France;Géomorphologie : relief, processus, environnement, 2004, n° 4, p. 305-316. • http://commons.wikimedia.org/wiki/Image:Euglypha_sp.jpg • http://protist.i.hosei.ac.jp/PDB6/PCD0222/htmls/35.html • http://www.com.univ-mrs.fr/~boudouresque • http://www.env.sci.toho-u.ac.jp/topics/009204.html • http://www.pac.dfo-mpo.gc.ca/sci/shelldis/pages/perkincc_e.htm