1 / 13

Molekulární fylogenetika primárních endosymbiontů hmyzu

Molekulární fylogenetika primárních endosymbiontů hmyzu. Benjamín Skála vedoucí práce: Václav Hypša. Endosymbionti hmyzu. bakterie žijící v tělních buňkách primární X sekundární. Moran, 2006. P-endosymbionti. mutualistický vztah s hostitelem vertikální přenos redukce genomu

Download Presentation

Molekulární fylogenetika primárních endosymbiontů hmyzu

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript


  1. Molekulární fylogenetika primárních endosymbiontů hmyzu Benjamín Skála vedoucí práce: Václav Hypša

  2. Endosymbionti hmyzu • bakterie žijící v tělních buňkách • primární X sekundární Moran, 2006

  3. P-endosymbionti • mutualistický vztah s hostitelem • vertikální přenos • redukce genomu • koevoluce s hostitelem • Buchnera, Wigglesworthia, Blochmannia

  4. Molekulární fylogenetika • metodologické problémy: • vysoký obsah AT • potenciální horizontální přenos genů • příbuzenské vztahy jsou zatím nejasné

  5. groEL Herbeck et al., 2005

  6. Otázky • Co je podmínkou toho, aby mohli být P-endosymbionti hmyzu označeni jako organely? Existují skutečně důkazy, že již organelami nejsou??

  7. Otázky • Co je podmínkou toho, aby mohli být P-endosymbionti hmyzu označeni jako organely? Existují skutečně důkazy, že již organelami nejsou?? • Uvádíte, že duplikace genomů bakterií způsobují vznik paralogů a tak mohou zapříčinit špatnou topologii stromů. Prosím blíže a podrobně vysvětlete.

  8. Flegr, 2005

  9. Otázky • Co je podmínkou toho, aby mohli být P-endosymbionti hmyzu označeni jako organely? Existují skutečně důkazy, že již organelami nejsou?? • Uvádíte, že duplikace genomů bakterií způsobují vznik paralogů a tak mohou zapříčinit špatnou topologii stromů. Prosím blíže a podrobně vysvětlete. • Proč se odhad množství genů získaných prostřednictvím horizontálního přenosu genů (HGT) u různých autorů tak výrazně liší? (nepatrný počet až 60%)

  10. Otázky • Co je podmínkou toho, aby mohli být P-endosymbionti hmyzu označeni jako organely? Existují skutečně důkazy, že již organelami nejsou?? • Uvádíte, že duplikace genomů bakterií způsobují vznik paralogů a tak mohou zapříčinit špatnou topologii stromů. Prosím blíže a podrobně vysvětlete. • Proč se odhad množství genů získaných prostřednictvím HGT u různých autorů tak výrazně liší? (nepatrný počet až 60%) • Co je to nehomogenní (substituční) model? Vysvětlete.

  11. Otázky • Co je podmínkou toho, aby mohli být P-endosymbionti hmyzu označeni jako organely? Existují skutečně důkazy, že již organelami nejsou?? • Uvádíte, že duplikace genomů bakterií způsobují vznik paralogů a tak mohou zapříčinit špatnou topologii stromů. Prosím blíže a podrobně vysvětlete. • Proč se odhad množství genů získaných prostřednictvím HGT u různých autorů tak výrazně liší? (nepatrný počet až 60%) • Co je to nehomogenní (substituční) model? Vysvětlete. • Jaké symbiotické „houbovité organismy“ byly nalezeny u mšic?

  12. Některé mšice tribu Cerataphidini obsahují tzv. YLS – yeast-like symbiont vřeckovýtrusné houby (Ascomycota), Sordariomycetes Hypomyces lactifluorum Xet-Mull, 2004

More Related