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Service RADEZOO: Digitalisation des échantillons de plancton actuels (semaine après semaine) et passés (depuis 1966) par le ZOOSCAN. Digitalisation. Archives digitales. 3 échantillons/sem. et 5000 en collection. 10 WP2 5 Regent 10 JB Soit 25 filets. Traitement des données. Diffusion

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Presentation Transcript


  1. Service RADEZOO: Digitalisation des échantillons de plancton actuels (semaine après semaine) et passés (depuis 1966) par le ZOOSCAN Digitalisation Archives digitales 3 échantillons/sem. et 5000 en collection 10 WP2 5 Regent 10 JB Soit 25 filets Traitement des données Diffusion Site web OOV RNSLM NODC/IODC Publications Archives dans formol (bat Jean Maetz) Le comptage selon méthode traditionnelle maintenue (1/mois).

  2. État des analyses ZooScan depuis 2004 et depuis sept. 2009 1966 1995 2003 2010 1 2 3 4 Mai 2010 Sept. 2009 1 2000 échantillons, reste env. 500 reste env. 500 2 2000 échantillons, reste env. 1950, reste environ 1850 3 800 échantillons, totale 4 225 échantillons, reste 100 totale • La ré-analyse des collections a été effectuée par un personnel non permanent (4 étudiants M1, 4 étudiants M2, 2 thèses UPMC et 1 technicien (en CDD 2007-2009) avec des crédits de recherche. Cette activité reprendra en juillet 2010 (série 2). • - Le travail d’observation au quotidien est réalisé par un technicien permanent (analyse des séries 2 et 4). La série 1 devrait reprendre.

  3. RADEZOO et la communauté scientifique • Analyse d’échantillons en collaboration avec le LEGOS (V. Garçon), LSCE (L. Labeyrie), Univ. Liège (JH Hecq), EPHE Perpignan (S. Planes), Univ. Bizerte (N. Daly Yaya), SZN (M. Mazzochi), Corée du Sud (NFRDI), Conseil Général (RIMMO), • DUNE 1 et 2, MOOSE (L. Coppola, 100 échantillons), TARA (200 échantillons) • Près de 9000 échantillons ont été scannés depuis 2001 soit 9.106 organismes mesurés constituant 9tOctets de données. • Accueil des Journées du RNSLM Déc. 2009 • Accueil de la réunion SCOR 130 (Automatic Visual Plankton Identification, mai 2010), acceuil du RNSLM (2009 et 2011 peut être) RADEZOO un site Internet http://www.obs-vlfr.fr/Rade/RadeZoo NOUVEAU

  4. I PERSPECTIVES de RADEZOO • Participer au développement d’un Centre d’Analyse National du zooplancton par méthode imagerie dans le cadre d’un réseau d’expert (REN, selon RNSM 2008,2009,) • Centre de formation et de calibration pour la communauté utilisatrice • Participation à l’analyse standard des échantillons du chantier Méditerranée et du Réseau National des Stations Marines. Cette analyse est en complément des analyses propre à chaque équipe de recherche. Elle assure l’inter-comparabilité des séries de données. • Améliorer les algorithmes de reconnaissance automatique (FP7 JERICHO)

  5. II Perspective de l’observation de l’écosystème « end to end » Projet PRES (UNSA, UPMC, ISITV) UVP, LISST spectres de tailles et groupes fonctionnels ou composition taxonomique Opération pilote au point B 3 1 2

  6. III Perspectives: Miniaturization for monitoring • FOR • Real time monitoring of: • Oil aggregates in pelagic systems • Large Plastic particles • Swarms of medusae • FOR REAL TIME ASSIMILATION IN CURRENT MODELS • AND FORECAST POLLUTED AREAS OR JELLYFISH LANDINGS FUTURE Multi-captors monitoring systems equiped with UVP6, <0.5 kg

  7. III Réseau global d’observation du zooplancton et du carbone particulaire • Réseau global d’observation • ARGO-> BIOARGO+image • fixed stations + image • Service d’analyse et de validation des images avant une large diffusion • Observation en temps réel du plancton et des particules • - Assimilation des données dans les modèles halieutiques et biogéochimiques Zooplancton Carbone Organique Particulaire

  8. Merci à : OOV, LOV, SORADE, SOMLIT, MOOSE ModZoo project (INRIA) CNR/CNRS bilateral program CIESM Data Rescue project by EUR-OCEANS and SESAME project, funded by the European Commission's Sixth Framework Programme.

  9. Service RADEZOO les intermittents les permanents Marc (10%), Gaby (5%), Frank (100%) et Lars (50%) 23 Stagiaires depuis 2004 Technicien: Corinne Desnos Doctorants Jean Baptiste Romagnan, Ancien doctorant Carmen Garcia Comas (Taiwan), Pieter Vandromme (IFREMER) les financeurs OOV, LOV, past: CNR/CNRS bilateral program Data Rescue project by EUR-OCEANS and SESAME project, funded by the European Commission's Sixth Framework Programme. recent: PRES, JELLYWATCH, GELAMED, JERICHO, EUROBASSIN Merci à : SORADE, SOMLIT, MOOSE

  10. Publications • Licandro, D. V. P. Conway, M. N. Daly Yahia, M. L. Fernandez de Puelles, S. Gasparini, J. H. Hecq, P. Tranter and R. R. Kirby (2010) A blooming jellyfish in the northeast Atlantic and Mediterranean. Biology Letters. doi: 10.1098/rsbl.2010.0150 • Gorsky, G., Ohman, M.D., Cawood, A., Gasparini,S., Picheral, M., Prejger, F., Romagnan, J.-B., Stemmann,L. Digital zooplankton image analysis using the ZooScan integrated analysis system. (in press, Journal of Plankton Research) • Léo Berline, Ma Luz Fernández de Puelles, Ivona Marasović, Olja Vidjak, Maria Grazia Mazzocchi, Ioanna Siokou, Kalliopi Pagou, Georgia Assimakopoulou, Soultan Zervoudaki, Serena Fonda Umani, Alexandra Conversi, Carmen Garcia-Comas, Lars Stemmann, Frédéric Ibanez, Stéphane Gasparini, Gabriel Gorsky. Intercomparison of six mesozooplankton time series in the Mediterranean Sea (in review for Progress in Oceanography) • Pieter Vandromme, Lars Stemmann, Carmen Garcia-Comas, Marc Picheral, Steven Colbert, Léo Berline, Jean-Marc Guarini, Jonathan Rault, Éric Benoît and Gaby Gorsky. Zooplankton Size Spectra. Part I: from Data to Models. (in prep for Journal of Marine System) • V. Rossi, V. Garçon, J. Tassel, J. B. Romagnan, L. Stemmann, F. Jourdin, P. Morin,Y. Morel A. mesoscale survey of the northern and central Iberian Peninsula Upwelling System: spatial variability and bio-physical interactions.(in prep for Progress in Oceanography) • Carmen Garcia-Comas, Lars Stemmann, Frederic Ibanez, Stéphane Gasparini, Maria Grazia Mazzocchi, Leo Berline, Marc Picheral and Gabriel Gorsky Zooplankton long-term changes in the NW Mediterranean Sea: Decadal periodicity forced by large-scale atmospheric changes? (in prep for Journal of Marine system)

  11. Profileur de Vision Marine Fusion des protocoles d’analyse, traitement et diffusion des images FILETS Digitalisation Archives digitales FLOWCAM Traitement rapide pour Monitoring temps réel Metadata Data Diffusion Site web OOV RNSLM NODC/IODC

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