Datorst dd molekylmodellering f r gymnasiet l.jpg
This presentation is the property of its rightful owner.
Sponsored Links
1 / 20

Datorstödd molekylmodellering för gymnasiet PowerPoint PPT Presentation


  • 141 Views
  • Uploaded on
  • Presentation posted in: General

Datorstödd molekylmodellering för gymnasiet. Kemiska institutionen (Chemicum). Står för den bredaste kemi undervisningen i Finland Avdelningar i Chemicum Laboratoriet för analytisk kemi Laboratoriet för oorganisk kemi Laboratoriet för fysikalisk kemi Laboratoriet för organisk kemi

Download Presentation

Datorstödd molekylmodellering för gymnasiet

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation

Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author.While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server.


- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E N D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Presentation Transcript


Datorst dd molekylmodellering f r gymnasiet l.jpg

Datorstödd molekylmodellering för gymnasiet


Kemiska institutionen chemicum l.jpg

Kemiska institutionen (Chemicum)

  • Står för den bredaste kemi undervisningen i Finland

  • Avdelningar i Chemicum

    • Laboratoriet för analytisk kemi

    • Laboratoriet för oorganisk kemi

    • Laboratoriet för fysikalisk kemi

    • Laboratoriet för organisk kemi

    • Laboratoriet för polymerkemi

    • Laboratoriet för radiokemi

    • Laboratoriet för svenskspråkig undervisning

    • Lärarutbildningsenheten

  • Ifall du skriver Eximia eller laudatur i kemins ämnesreal i studentskrivningarna, är du välkommen att studera vid kemiska institutionen – utan inträdesprov!


  • Kemiska institutionen chemicum3 l.jpg

    Kemiska institutionen (Chemicum)

    • De aktuella specialiseringsområden vid fakulteten:

      • grön kemi

      • material- och nanokemi

      • datorstödd och teoretisk kemi

      • syntetik och kemisk analytik.


    Luma center och webb tidningen kreativ l.jpg

    LUMA-center och webb-tidningen Kreativ

    • LUMA-center

    • webb-tidningen Kreativ


    Datorer och kemi l.jpg

    Datorer och kemi

    • Hjälpmedel för experimentell kemi

      • skrivande, räknande, presenterande

      • mätningnsautomatik

  • Hjälpmedel för teoretisk kemi

    • simuleringar, beräkningar

    • beräkningskemi

  • Internet

    • informationssökning, publicering, e-post


  • Vad r ber kningskemi l.jpg

    Vad är beräkningskemi?

    • = molekylmodellering

    • Förklarar

    • Förutspår

    • Hypotes, en modell


    Vad kan man unders ka med ber kningskemi l.jpg

    Vad kan man undersöka med beräkningskemi?

    • Kemiska strukturer

      • bindningslängder och –vinklar

      • rymdstruktur, placering i rymden

  • Kemiska egenskaper

    • laddningsfördelning

    • elektrontäthet

    • spektroskopi

  • Kemisk reaktivitet

    • reaktionsmekanismer

    • reaktionshastigheter


  • Visualisering av ett kemiskt fenomen l.jpg

    Visualisering av ett kemiskt fenomen

    • Olika skeden i visualiseringen

      • Väljer den modell med vilken vi vill beskriva det kemiska fenomenet

      • Beräknings arbete

      • Analysering av resultat


    Hur g r man p riktigt l.jpg

    Hur gör man på riktigt?

    • Acetylsalicylsyra

    • Aspirin

    • C9H8O4

    • o-acetoxibensoesyra


    Spartan 04 molekylmodellerings program l.jpg

    Spartan ’04 molekylmodellerings program


    Spartan 1 l.jpg

    Spartan (1)

    • Med molekylmodelleringsprogrammen kan man göra beräkningar för organiska molekyler

    • Starta maskinen:

      Novell  HY-PUU  Science  Spartan 2004 Student

    Välj ”File”  ”New”


    Slide12 l.jpg

    stänger molekyleditorn

    mäter bindningslängder och -vinklar

    minimerar strukturensenergi

    Spartan (standard) atomfärger:

    väte – vit kol – grå kväve – blågråsyre – röd fluor – grön natrium – gulmagnesium – blå aluminium – purpur kisel – grå svavel – himmelsblåbrom – orange jod – brun transitionsmetaller– grönHe–Kr – orangexenon – gul

    öppnar molekyleditorn

    eliminerar


    Spartan 3 l.jpg

    Spartan (3)

    1

    • Bygger molekylmodellen för aspirin

      • bygger bensenringen

      • lägger till en karbonylgrupp

      • lägger till en alkoholgrupp

      • lägger till en karbonylgrupp (även =O)

      • tillsätter ett sp3-kol

      • vi förflyttar oss från editorial till själva modelleringen

    2

    3

    4

    5


    Spartan 4 l.jpg

    Spartan (4)

    • Att röra på molekylen i Spartan

      • sväng på molekylen – musens vänstra tangent nertryckt

      • rör på molekylen i arbetsbordet – musens högra tangent nertryckt

      • förstora, förminska molekylen – shift + musens högra tangent nertryckt

      • sväng på molekylen i arbetsbordet – shift + musens vänstra tangent nertryckt


    Spartan 5 l.jpg

    Spartan (5)

    Putsar ”steriska hinder”


    Spartan 6 l.jpg

    Spartan (6)

    • Med ”Model” som finns i menyn kan man ändra på strukturens utseende

    space filling(kalottmodell)

    ball and spoke(boll- och stickmodell)

    tube(tubmodell)


    Spartan 7 l.jpg

    Spartan (7)

    • Vi söker ett energetiskt minimi för molekylen – minimerar elektronernas energi

      Välj "Setup"  "Calculations

      Calculate: Equilibrium Geometry with Semi Empirical

      Compute: IR

      Total Charge: Singlet

      Välj slutligen: "Submit"

    • "Display"  "Properties" visar energetiska egenskaper för den minimerade strukturen

    • Mät bindningslängder och –vinklar (blåa ?-tangenterna och välj de atomer du vill betrakta; det ifrågavarande resultatet syns till höger i nedre hörnet


    Spartan 8 l.jpg

    Spartan (8)

    • Vi studerar elektronernas fördelning i molekylen

    • Välj ”Setup”  ”Surfaces” Surface: DensityProperty: PotentialVälj slutligen ”OK”

    • Välj ”Setup”  ”Submit”, med vilken den valda ytan beräknas (Den gula lådan i ”Surfaces” fönstret berättar om den beräknade ytan)

    • Klicka på den gula ytan, varvid ytan syns

    • Klicka på ytan med musens vänstra tangent, varvid du kan ändra på ytans presentationssätt nere i det högra hörnet


    Spartan 9 l.jpg

    Spartan (9)

    • Granskar molekylens fingerprint inom infraröd området

    • Välj ”Display”  ”Spectra” Fönstret som öppnas presenterar de räknade vibrationsfrekvenserna och –intensiteterna

    • Genom att klicka på den gula lådan animeras den ifrågavarande vibrationen

    • Klicka på ”Draw IR Spectrum”, varvid du samtidigt får fram det "experimentella spektret"


    Slide20 l.jpg

    Tack för visat intresse

    och tack för besöket !!!


  • Login