datorst dd molekylmodellering f r gymnasiet
Download
Skip this Video
Download Presentation
Datorstödd molekylmodellering för gymnasiet

Loading in 2 Seconds...

play fullscreen
1 / 20

Datorst dd molekylmodellering f r gymnasiet - PowerPoint PPT Presentation


  • 175 Views
  • Uploaded on

Datorstödd molekylmodellering för gymnasiet. Kemiska institutionen (Chemicum). Står för den bredaste kemi undervisningen i Finland Avdelningar i Chemicum Laboratoriet för analytisk kemi Laboratoriet för oorganisk kemi Laboratoriet för fysikalisk kemi Laboratoriet för organisk kemi

loader
I am the owner, or an agent authorized to act on behalf of the owner, of the copyrighted work described.
capcha
Download Presentation

PowerPoint Slideshow about 'Datorst dd molekylmodellering f r gymnasiet' - makana


An Image/Link below is provided (as is) to download presentation

Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author.While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server.


- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E N D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Presentation Transcript
kemiska institutionen chemicum
Kemiska institutionen (Chemicum)
  • Står för den bredaste kemi undervisningen i Finland
  • Avdelningar i Chemicum
      • Laboratoriet för analytisk kemi
      • Laboratoriet för oorganisk kemi
      • Laboratoriet för fysikalisk kemi
      • Laboratoriet för organisk kemi
      • Laboratoriet för polymerkemi
      • Laboratoriet för radiokemi
      • Laboratoriet för svenskspråkig undervisning
      • Lärarutbildningsenheten
  • Ifall du skriver Eximia eller laudatur i kemins ämnesreal i studentskrivningarna, är du välkommen att studera vid kemiska institutionen – utan inträdesprov!
kemiska institutionen chemicum3
Kemiska institutionen (Chemicum)
  • De aktuella specialiseringsområden vid fakulteten:
      • grön kemi
      • material- och nanokemi
      • datorstödd och teoretisk kemi
      • syntetik och kemisk analytik.
luma center och webb tidningen kreativ
LUMA-center och webb-tidningen Kreativ
  • LUMA-center
  • webb-tidningen Kreativ
datorer och kemi
Datorer och kemi
  • Hjälpmedel för experimentell kemi
      • skrivande, räknande, presenterande
      • mätningnsautomatik
  • Hjälpmedel för teoretisk kemi
      • simuleringar, beräkningar
      • beräkningskemi
  • Internet
      • informationssökning, publicering, e-post
vad r ber kningskemi
Vad är beräkningskemi?
  • = molekylmodellering
  • Förklarar
  • Förutspår
  • Hypotes, en modell
vad kan man unders ka med ber kningskemi
Vad kan man undersöka med beräkningskemi?
  • Kemiska strukturer
      • bindningslängder och –vinklar
      • rymdstruktur, placering i rymden
  • Kemiska egenskaper
      • laddningsfördelning
      • elektrontäthet
      • spektroskopi
  • Kemisk reaktivitet
      • reaktionsmekanismer
      • reaktionshastigheter
visualisering av ett kemiskt fenomen
Visualisering av ett kemiskt fenomen
  • Olika skeden i visualiseringen
      • Väljer den modell med vilken vi vill beskriva det kemiska fenomenet
      • Beräknings arbete
      • Analysering av resultat
hur g r man p riktigt
Hur gör man på riktigt?
  • Acetylsalicylsyra
  • Aspirin
  • C9H8O4
  • o-acetoxibensoesyra
spartan 1
Spartan (1)
  • Med molekylmodelleringsprogrammen kan man göra beräkningar för organiska molekyler
  • Starta maskinen:

Novell  HY-PUU  Science  Spartan 2004 Student

Välj ”File”  ”New”

slide12

stänger molekyleditorn

mäter bindningslängder och -vinklar

minimerar strukturensenergi

Spartan (standard) atomfärger:

väte – vit kol – grå kväve – blågråsyre – röd fluor – grön natrium – gulmagnesium – blå aluminium – purpur kisel – grå svavel – himmelsblåbrom – orange jod – brun transitionsmetaller– grönHe–Kr – orangexenon – gul

öppnar molekyleditorn

eliminerar

spartan 3
Spartan (3)

1

  • Bygger molekylmodellen för aspirin
    • bygger bensenringen
    • lägger till en karbonylgrupp
    • lägger till en alkoholgrupp
    • lägger till en karbonylgrupp (även =O)
    • tillsätter ett sp3-kol
    • vi förflyttar oss från editorial till själva modelleringen

2

3

4

5

spartan 4
Spartan (4)
  • Att röra på molekylen i Spartan
      • sväng på molekylen – musens vänstra tangent nertryckt
      • rör på molekylen i arbetsbordet – musens högra tangent nertryckt
      • förstora, förminska molekylen – shift + musens högra tangent nertryckt
      • sväng på molekylen i arbetsbordet – shift + musens vänstra tangent nertryckt
spartan 5
Spartan (5)

Putsar ”steriska hinder”

spartan 6
Spartan (6)
  • Med ”Model” som finns i menyn kan man ändra på strukturens utseende

space filling(kalottmodell)

ball and spoke(boll- och stickmodell)

tube(tubmodell)

spartan 7
Spartan (7)
  • Vi söker ett energetiskt minimi för molekylen – minimerar elektronernas energi

Välj "Setup"  "Calculations

Calculate: Equilibrium Geometry with Semi Empirical

Compute: IR

Total Charge: Singlet

Välj slutligen: "Submit"

  • "Display"  "Properties" visar energetiska egenskaper för den minimerade strukturen
  • Mät bindningslängder och –vinklar (blåa ?-tangenterna och välj de atomer du vill betrakta; det ifrågavarande resultatet syns till höger i nedre hörnet
spartan 8
Spartan (8)
  • Vi studerar elektronernas fördelning i molekylen
  • Välj ”Setup”  ”Surfaces” Surface: DensityProperty: PotentialVälj slutligen ”OK”
  • Välj ”Setup”  ”Submit”, med vilken den valda ytan beräknas (Den gula lådan i ”Surfaces” fönstret berättar om den beräknade ytan)
  • Klicka på den gula ytan, varvid ytan syns
  • Klicka på ytan med musens vänstra tangent, varvid du kan ändra på ytans presentationssätt nere i det högra hörnet
spartan 9
Spartan (9)
  • Granskar molekylens fingerprint inom infraröd området
  • Välj ”Display”  ”Spectra” Fönstret som öppnas presenterar de räknade vibrationsfrekvenserna och –intensiteterna
  • Genom att klicka på den gula lådan animeras den ifrågavarande vibrationen
  • Klicka på ”Draw IR Spectrum”, varvid du samtidigt får fram det "experimentella spektret"
slide20

Tack för visat intresse

och tack för besöket !!!

ad