Ordre du jour

1. Ordre du jour • 10h45 Tour de table • 11h00 Actions transversales de CIMENT • 11h30 Nomination de nouveaux experts • 11h45-13h30 repas au Magellan • 13h30 Présentations scientifiques des 6 projets • 16h00 Questions au conseil scientifique • 16h30 Délibération du Conseil

2. Ordre du jour • 10h45 Tour de table • 11h00 Actions transversales de CIMENT • 11h30 Nomination de nouveaux experts • 11h45-13h30 repas au Magellan • 13h30 Présentations scientifiques des 6 projets • 16h00 Questions au conseil scientifique • 16h30 Délibération du Conseil

3. Contexte général calcul • Partenariat avec le CEA • financement 2000-2006 (Région - CEA) 7MF • redéfinition et renforcement du partenariat dans le contexte du déménagement vers Paris du centre de calcul du CEA • Utilisation des centres de calculs nationaux • IDRIS, CINES • Développement de projets « calcul » mésoscopiques au sein des universités de Grenoble

4. Équipement pour le calcul • Financement • Appel à projet national de Guy René Perrin, Nov 98 : 2MF • CPER 2000/2006 : 15MF • Compléments CNRS, IMAG, INPG, INRIA, etc. • Projets • Observatoire, MIRAGE, Grappe de PC, Chimie calculatoire (CECIC), BioIMAGe, PhyNum • Formation transversale au niveau des écoles doctorales

5. Coordination du projet • Comité de pilotage du projet : définit les grandes orientations • Participation à la journée CINES-IDRIS de l’automne 1999 et de l’automne 2000 (26 octobre), CEA (Visualisation, hier) • Mise en place d’un séminaire trimestriel (2000) http://ujf-grenoble.fr/CIMENT • Structurationdes projets de calcul au niveau des universités Grenobloises par des regroupements de projets : • “ Couplage modélisation hydrologique et météorologique ” inclus dansMIRAGE. • Génétique, bio-informatique et imagerie médicale (BIoIMAGe). • Création du CECIC :Centre d ’Expérimentation du Calcul Intensif en Chimie. • Le projet PhyNum pourrait s’associer au SCCIOG. • Recrutement d’un Ingénieur de Recherche UJF pour le projet MIRAGE : Laurence Viry (mais manque encore d’ingénieurs sur nos projets) • Accès prioritaire aux réseaux rapides au niveau du campus

6. Le cas du Campus Etat actuel Etat en Q1-2002 Le Man Grenoblois Etat actuel Etat en Q4-2002 Evolution réseau Jacques.Eudes@ujf-grenoble.fr Centre de Ressources Informatiques de Proximité - UJF

7. CIMENT Campus Cœur Giga/Eth100 (en production) Bâtiment OBS Ethernet 100 Ethernet 1000 Memory Channel Ethernet 100 (projet) Bâtiment IRIGM LPG Pôle Santé Ferme Osug Mirage Biologie Mirage Glaciologie Mirage LMC Secu-UJF Mirage Mécanique Imag Sortie Campus

8. CIMENT Campus Cœur Giga/Eth100 (Evolution Q1-2002) Bâtiment OBS Bâtiment IRIGM Ethernet 100 Ethernet 1000 Memory Channel Ethernet 1000 (projet) LPG Pôle Santé Ferme Osug Mirage Biologie Mirage Glaciologie Mirage Mécanique Secu-UJF Mirage LMC Imag Sortie Campus

9. Campus 100 Mb 100 Mb Inria 60 Mb 100 Mb Viallet Plaque métro CNRS Le réseau métropolitain GrenobloisMetroNet phase 1 -> Q4-2000/Q3-2002 Technologie IP / Ethernet 100 commuté 622 Mb vers Lyon, Puis 2,5Gb vers Paris 100 Mb NRD Vers Paris (NIO2 RENATER) Technologie IP / ATM CEA

10. Campus 1000 Mb 1000 Mb Inria 100 Mb 1000 Mb Viallet 1000 Mb Plaque métro CNRS CEA Le réseau métropolitain GrenobloisMetroNet phase 2 à compter de Q4-2002 Technologie IP / Ethernet 1000 commuté 622 Mb NRD Vers Paris

11. Collaborations autour du projet • Scientifique • Thèses entre Observatoire et TIMC, ID et LMC, ID et Observatoire, Obs et PhyNum, … • Algorithmes d'ordonnancements optimaux en temps et en memoire : Etude de cas sur des problemes en mecanique quantique. These de N. Maillard, co-encadree par P. Valiron (LAOG) et J-L. Roch (ID). • une these coencadrées depuis 2 ans par le LGIT et le LPM2C : Renaud Hennino : il fera la partie presentation scientifique. (phynum - obs) • Collaborations inter-projets • Simulations de la propagationdes ondes sismiques dans la croÛte terrestre (B. Van Tiggelen (LPMMC), M. Campillo (LGIT)) • Analyse génétique et localisation spatiale: Stéphanie Manel et Françoise Berthoud (BioIMAGe et PhyNum):

12. Collaborations autour du projet • Technique • Partage des expertises • Séminaires, liste de diffusion, ingénieurs (bureau partagé au LMC), rapprochement du projet PhyNum de celui de l’Observatoire. Ex : • Portage de l'interface de programmation parallele Athapascan, developpee au laboratoire ID, sur les machines SMP de l'Observatoire. • Participation croisée à des commissions techniques d’appel d’offre pour gappes (ID-BioIMAGe) • collaboration technique entre Françoise Bertout (phynum) et Francoise Roch (obs) : une journée par semaine depuis 1 an. • Expérimentation du calcul hétérogène • projet Data Grid (participation de ID, expérimentation de globus) • Chimie quantique sur un serveur et une grappe de PC (Obs.) • Expérimentation de l’administration et du calcul sur grappes distribuées • Projet MRCT CNRS de Philippe Augerat (ID) « administration grappe de PC distribuée ». Partenariat (ID, LPMMC, LEGI-CORIOLIS, Observatoire de Grenoble, PRISM, TIMC)

13. Formation doctorale • Un projet de formation au Calcul Haute Performance transversale aux écoles doctorales => Formation accompagnée de TP (janvier 2002) • Toutes les écoles doctorales relatives à CIMENT (Math applis et Info, Chimie, Physique, EDIV,…) participent. • Accueil des cours et des TP au sein de l ’UFR IMA (mise en place des TP possible sur les pôles si c’est plus simple).

14. Formation doctorale • sous la forme de deux modules • Introduction au calcul réparti • Introduction au parallélisme et au calcul intensif • Formation à l’optimisation de code, à MPI et à OPEN MP • Utilisation de bibliothèques de calcul scientifique (ScaLaPack, …) • Modélisation numérique et calcul intensif • Différents problèmes apportés par les communautés utilisatrices, leur modélisation et leur résolution sur une grappe de PC, formeront les TP (MIRAGE, BioIMAGe, PhyNum,…) • Devra évoluer en cohérence avec le projets de formation doctorale de PhyNum prévu pour 2002-2003

15. Observatoire de Grenoble P.Valiron et F. Roch LAOG, LGIT, SGEP du LIS • Projet : calcul intensif en astrophysique et géophysique. • Solution retenue : IBM (SMP 16 procs 375MHz, 16Go, 24Gflops crête et 2 Quadri-Pro, SMP, 4 Go). Solution centralisée. • Financement : 500kF COMI CNRS +165kF quadriennal UJF ; 600kF Ministère (CIMENT) + 495 KF quadriennal UJF (soutien du ministère quadriennal 400kF/an) • État d’avancement : fin de mise en place juillet 2000 (coût 1,76MF) • Projets scientifiques (une vingtaine de thésards) : évolution stellaire, disque proto-planétaire, astrochimie quantique : dynamiques microphysique, simulation numérique MHD et hautes énergies, propagation des ondes sismiques, reconstruction en sismologie, champs magnétique terrestre, modélisation de l ’ionosphère dans les zonespolaires, Interactions cinétiques soleil/terre, ...

16. Plate forme MirageE. Blayo, L.ViryLMC, LEGI, LTHE, LGGE, LEA • Projet : modélisation, calcul, visualisation dans les problèmes d’environnement et climat. • Solution retenue : 7 DS20 (bi-pro alpha EV67, 7x2,5Go, Memory Channel) et 3x100Go DD ; LSF et TotalView. Solution répartie sur 3 sites. • État d’avancement : En exploitation depuis janvier 2000 (1,5MF) • Financement : 1,75MF [ 600kF MENRT, 650kF COMI CNRS, 100kF BQR INPG, 60kF CNES, 200kF des laboratoires ] + 200kF INRIA, soutien du ministère (quadriennal 60kF/an) • Projets scientifiques (une quinzaine de thésard) : modélisation des calottes polaires, couplage glace-atmosphère, Modélisation océanique, assimilation de données océaniques, modélisation interface sol-végétation atmosphère, hidrologie en zone montagneuse, assimilation de données avec Méso-NH.

17. Pôle de chimie calculatoireS.Perez et P.VattonLEDSS, CERMAV, Cristallographie, LEOPR, DPM • Projet : création du CECIC : Centre d ’Expérimentation du Calcul Intensif en Chimie • Solution : Une machine IBM SP (3 quadri Pro Power III 3x8Go) + une machine SGI 0200 quadri pro,4Go (logiciels de modélisation moléculaire) • Avancement : En cours de démarrage. • Financement : 1.5MF dans le cadre du CPER + 0,5MF CNRS + 462kF sur fonds propres labo • Projets scientifiques (une dizaine de thésards) : Chimie quantique, Mécanique/Dynamique Moléculaires, Etat condensé, Recherches des Conformations Bio-Actives, Bases de données

18. Grappe de PCB.Plateau, P. Augerat ID, SIRAC et ReMaP (ENS L) • Projet : expérimentation des systèmes et du calcul distribué sur une grappe de PC. • Solution envisagée : 100 PC (bi-pro, 1Go) disposant d’un réseau rapide de technologie myrinet. Solution massivement distribuée. • État d’avancement : expérimentation locale le i-cluster (225 PIII en réseau ethernet : no=385 du TOP 500/81,6Gflops). Un appel d’offre infructueux en cours de réactualisation. Simplification vers une solution grappe très intégrée • Financement : 5MF (0,8MF MENRT, 0,3MF ENSL + CPER : 2,5MF INRIA et 1,2MF Région) • Projets scientifiques (une dizaine de thésards) : outils d’exploitation et méthodes de programmation (projet RNTL : CLIC Bull, Mandrake,UJF distribution linux pour cluster incluant MPI/OPEN MP,…, athapascan).

19. Projet BIOIMAGEL. Desbat G. Bourrel TIMC-IMAG, Unité INSERM 438, RMN Bioclinique, Laboratoire de Biologie des Populations d'Altitude • Projet : Imagerie et modélisation biomécanique médicales Biologie informatique et analyse génétique spatialisée. • Solution : modifiée au printemps 2001 pour migrer d ’une solution à base d ’alpha vers une grappe de PC bi-pro, 2Go, en réseau ethernet. • Avancement : lié à grappe de PC. • Financement : deux tranches CPER 800kF 2001, 1MF 2002(?) • Projets scientifiques (une quinzaine de thésards) : reconstruction rapide en imagerie 3D, atténuation et diffusion en imagerie nucléaire (quantification),IRMfonctionnelle 3D, modélisation biomécanique d ’organes, Equations de Maxwell pour la modélisation de neurones, pôle bio-informatique (étude des structures génétiques spatiales, identification de matrices d ’interaction génique, modélisation du génome,…)

20. Projet PHYNUMA. Pasturel et F. BerthoudIPMC (Louis Néel, Basses Températures et Physique Numérique) • Solution envisagée : centralisée, 16 à 32 proc, 16 à 32 Go mais évolution possible vers une grappe de PC • Avancement : 2002, couplage envisagé avec l’Observatoire. • Financement : Dans le cadre du CPER (1,5MF 2002) • Projet scientifiques (une quinzaine de thésards) • Simulations de la propagation des ondes sismiques dans la croûte terrestre • Etude de la diffusion multiple de la lumière en milieu complexe • Supraconductivité dans des systèmes de dimension réduite • Transport thermique dans un conducteur mésoscopique • Manipulation des états quantiques dans des nanocircuits supraconducteurs • Elasticité de la croissance cristalline et auto-organisation de nanostructures • Structures d'équilibre et dynamique réactionnelle de surfaces • Thermodynamique et Transition de Phases. • ...

21. Perspectives • Maturation des grappes de PC (matériel et logiciel) => solutions économiques du calcul intensif => Plus grande diffusion • Nécessité de former les étudiants aux techniques de calcul intensif • Renforcement des actions transversales • Projet d’administration centralisée de grappes de PC distribuées (Philippe Augerat) • Formation transversale au niveau des écoles doctorales

22. Perspectives • Projet ACI Grilles • Proposition CIMENT en avril 2001 • 2 postes de CDD • 50kF de fonctionnement sur 2 ans • Octobre 2001 (?) • Dans le cadre de CIMENT, pas de demande de crédit d’équipement, mais CDD (éventuellement fonctionnement). • Coordonnés par « grappe de PC » • Accompagnement/prolongement du projet MRCT CNRS de Philippe Augerat d’administration à distance de grappe par un soutien aux utilisateurs aux techniques de calcul réparti

23. Financement dans le cadre du CPER => Financement 2002 = Agglo et Ville de Grenoble • => Besoin de postes d’ingénieurs pour soutenir les projets • BioIMAGe : + AFIP CNRS pour un AI (TIMC) • Grappe de PC : +/- départ à mi-temps de P.Augerat

24. Ordre du jour • 10h45 Tour de table • 11h00 Actions transversales de CIMENT • 11h30 Nomination de nouveaux experts • 11h45-13h30 repas au Magellan • 13h30 Présentations scientifiques des 6 projets • 16h00 Questions au conseil scientifique • 16h30 Délibération du Conseil

25. Pilotage et évaluation du Projet • Comité de pilotage du projet • Les responsables des projets (réunion en gros trimestrielle) • Conseil scientifique : • Un expert extérieur par projet • Un expert du parallélisme (président d’ORAP) • Les représentants des institutions et des établissements (CNRS, MENRT, IMAG, INPG, INRIA, UJF) • Les responsables des projets • Une réunion annuelle (28/09/2000, 27/09/2001)

26. Pilotage et évaluation du Projet • Conseil scientifique : • Un expert extérieur par projet => Trois nouveaux experts • CECIC • BioIMAGe • PhyNum

27. Ordre du jour • 10h45 Tour de table • 11h00 Actions transversales de CIMENT • 11h30 Nomination de nouveaux experts • 11h45-13h30 repas au Magellan • 13h30 Présentations scientifiques des 6 projets • 16h00 Questions au conseil scientifique • 16h30 Délibération du Conseil

28. Ordre du jour • 10h45 Tour de table • 11h00 Actions transversales de CIMENT • 11h30 Nomination de nouveaux experts • 11h45-13h30 repas au Magellan • 13h30 Présentations scientifiques des 6 projets • 16h00 Questions au conseil scientifique • 16h30 Délibération du Conseil

29. Grappe de PC Denis Trystram et Philippe Augerat 13h30 - 14h00

30. MIRAGE Eric Blayo et Laurence Viry 14h00 - 14h30

31. SCSI Pierre Valiron et Françoise Roch 14h30 - 15h00

32. CECIC Serge Perez et Pierre Vatton 15h00 - 15h20

33. BioIMAGe Laurent Desbat et Guy Bourrel 15h20 - 15h40

34. PhyNum Alain Pasturel et Françoise Berthoud 15h40 - 16h00

35. Ordre du jour • 10h45 Tour de table • 11h00 Actions transversales de CIMENT • 11h30 Nomination de nouveaux experts • 11h45-13h30 repas au Magellan • 13h30 Présentations scientifiques des 6 projets • 16h00 Questions au conseil scientifique • 16h30 Délibération du Conseil

36. Question 1 • Formation • Intérêts des universités ? • Soutiens ? • Ouverture, partenariat ?

37. Question 2 • Projet scientifique • Point sur visualisation • du partage d’expertise technologique vers les collaborations scientifiques

38. Question 3 • Grappe de PC ou SMP IBM ???

39. Ordre du jour • 10h45 Tour de table • 11h00 Actions transversales de CIMENT • 11h30 Nomination de nouveaux experts • 11h45-13h30 repas au Magellan • 13h30 Présentations scientifiques des 6 projets • 16h00 Questions au conseil scientifique • 16h30 Délibération du Conseil

40. FIN Merci et Bon retour

41. Plate forme MirageE. Blayo, L.ViryLMC, LEGI, LTHE, LGGE, LEA • Les financements Mirage 2001 : 50 KF d'autofinancement sur des contrats, 200 KF de la part de l'Inria (qui ont permis le debut de l'upgrade : passage en OS 5.1 + qq achats de disque et matos reseau pour un meilleur aspect "true cluster") • Prevu en 2002 : 500 KF Inria pour fin de l'upgrade (essentiellement upgrade des procs)

42. Pôle de chimie calculatoireS.Perez et P.VattonLEDSS, CERMAV, Cristallographie, LEOPR, DPM • Financement :CIMENT 1500 kf ( 1250 + 250) , Labos 462 kf , CNRS 250 kf (500 kf sur 2 ans) dont provisions pour logiciels 250 kf • Travaux et équipement salle machine 100 kfEquipement réseaux 60 kfMatériel SGI et IBM 1745 kf Logiciels et Exploitation 57 kfSeptembre : réunion inaugurale du conseil de Gestion du CECIC