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PubMed 資料庫

PubMed 資料庫. 時間： 2011 年 10 月 7 日 (13:30-16:30) 主講：醫教部淡水圖書組劉淑容 分機： ( 淡 )2509. PubMed 的課程. PubMed 簡介 PubMed 檢索技巧 篩選實證醫學資料方法 MyNCBI 個人化設定. PubMed 的課程. PubMed 簡介 PubMed 檢索技巧 篩選實證醫學資料方法 MyNCBI 個人化設定. PubMed 簡介 1. PubMed National Institutes of Health (NIH)

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Presentation Transcript

  1. PubMed資料庫 時間：2011年10月7日(13:30-16:30) 主講：醫教部淡水圖書組劉淑容 分機：(淡)2509

  2. PubMed的課程 • PubMed簡介 • PubMed檢索技巧 • 篩選實證醫學資料方法 • MyNCBI個人化設定

  3. PubMed的課程 • PubMed簡介 • PubMed檢索技巧 • 篩選實證醫學資料方法 • MyNCBI個人化設定

  4. PubMed 簡介1 • PubMed National Institutes of Health (NIH) National Library of Medicine (NLM) 美國國家醫學圖書館 National Center for Biotechnology Information (NCBI) Entrez retrieval system(資訊檢索系統) PubMed

  5. PubMed 簡介2 1.MEDLINE(一般商業資料庫取用範圍) 是PubMed最大宗也最重要的資料庫 其學科領域含括:生物醫學,基礎醫學,臨床醫學, 護理,獸醫學,牙醫學,健康照護系統,保健醫學 medicine, nursing, dentistry, veterinary medicine, health care system, and the preclinical sciences 2.OLDMEDLINE (1950~1960沒有摘要) 3.In Process Citations（尚未用標題分類的最新文獻) 4.Publisher Supplied Citations（e+未分類+可能未出版）

  6. PubMed 簡介3 • 收錄有5200多種生命醫學期刊 • 全球性資料庫，除美國外另收有80多國期刊 • 自1948年至今已有2000多萬筆資料,且每日 更新加入最新資料 • 可直接聯結電子全文,並可利用內建機制找 到相關性資料 • 全球免費檢索 • MeSH詞彙控制

  7. 自由詞彙 free text 代表作:UpToDate、Google 資料庫自動比對使用者輸入之關鍵字，字與篇名、刊名、摘要…吻合之所有文獻就會被檢索出。 ◎優點：檢索方法容易、適用新名詞或較地區性的用詞。 ◎缺點：未經嚴謹分析、語意容意模糊(ex.字與字分開出現) 、要盡可能列舉同義詞及狹義 stroke≠CVA ≠cerebrovascular accident 控制詞彙controlled vocabulary 代表作:PubMed之MeSH 索引專家預先為每篇文章分析歸類，當user輸入之關鍵字意義與該類別相同時，該批文獻就會被檢索出。 ◎優點：解決同義字問題、可彈性檢索廣/狹意詞、使用得宜可提高精確率及回收率。 ◎缺點：user需學習使用、不適用新概念及local用詞、部份用語容易受限不彈性。 diabetes mellitus type2＝NIDDM＝diabetes mellitus type II ≠type2 DM 資料庫檢索機制

  8. MeSH—Medical Subject Heading控制辭彙;樹狀結構;有標準;會更新的分類表 • controlled vocabulary(控制詞彙) used for indexing articles for PubMed Medline. MeSH terminology provides a consistent way to retrieve information that may use different terminology for the same concepts. Ex. HIVD Anesthesia V.S. Anaesthesia 若您的關鍵字都不在MeSH中 PubMed會以自由詞彙檢索

  9. 善用MeSH term做為關鍵字  多個MeSH term + HIVD 全寫且為MeSH term 縮寫且未被MeSH詞彙表收錄 用錯檢索詞 “差”很大喔!!

  10. 如何進入PubMed 因為PubMed為全世界免費檢索之資料庫 所以 利用google、yahoo…都可以找到該網站 但是 透過馬偕圖書館網頁再點進PubMed有好康的…

  11. 如何進入PubMed 好康1.標示出該篇文獻,馬偕有無電子全文可用. 好康2.標示出該次檢索結果,馬偕總共可用之電子全文篇數.

  12. 馬偕紀念醫院 淡水圖書館 2010/6/25 PubMed首頁介紹 個人化服務 NCBI有30多種資料庫 進階檢索； history MeSH詞彙檢索 找特定已知資料之文獻 實證醫學資料檢索

  13. PubMed的課程 • PubMed簡介 • PubMed檢索 • 篩選實證醫學資料方法 • MyNCBI個人化設定

  14. 末期病人利用音樂治療使疼痛緩解改善生活品質末期病人利用音樂治療使疼痛緩解改善生活品質 實做範例PICO

  15. 由問題建立搜尋模式 • 找出關鍵字 • 依重要性標示順序 1 2 4 3

  16. PICO檢索示範 –關鍵字 (初級班)

  17. 初級檢索技巧 • 如果只想快速找到一篇文章看看… • 直接利用AND整合查詢 • P AND I AND O • end of life AND music therapy AND (pain relief OR life quality) 或 #1 end of life #2 music therapy #3 pain relief #4 life quality #5 #3 OR #4 #6 #1 AND #2 AND #5 逐字檢索 可瞭解個別結果 再靈活整合

  18. PICO分別檢索可靈活運用，並得知關鍵字需修正否PICO分別檢索可靈活運用，並得知關鍵字需修正否  PIO分別檢索，可靈活整合 PIO分別檢索後再用AND交集 O ？ I P PIO一次用布林邏輯檢索

  19. PICO檢索示範 –關鍵字 (中級班) • 關鍵字及同義詞的擬定，可參考上層EBM資料庫、Textbook、藥學資料庫或PubMed的MeSH表(醫學詞彙表) • 底線字表示為 MeSH Term

  20. P：end of life C： I：music therapy O：pain relief end of life palliative care hospice care terminal ill end stage of… Un-music therapy music therapy music sing song Melody alternative therapy pain relief analgesia life qualityfunctional well-being 中級檢索技巧 • 如果想找到比較完整的文獻 • PICO分別逐次檢索 • 一次檢索一群同義詞（用 OR聯集） • 再將所有群組結合（用 AND交集） AND AND AND

  21. 熟練布林邏輯：同義詞用OR聯集.PICO間用AND交集熟練布林邏輯：同義詞用OR聯集.PICO間用AND交集  PI PIO O I P 同義詞及相關詞彙越完整 資料獲得率就提升

  22. PubMed的課程 • PubMed簡介 • PubMed檢索技巧 • 篩選實證醫學資料方法 • MyNCBI個人化設定

  23. 篩選實證醫學資料（進階班） • 方法一：Clinical Queries檢索介面PubMed根據Haynes RB理論，為實證醫學專設的搜尋介面，內建系統會將檢索條件自動設限在較具實證研究的文獻中。 • 方法二：limit 利用limit中的”Type of Article”將檢索條件限制在clinical trial、Randomized Controlled Trial 、meta-analysis或review中。 • 方法三：限定實證醫學期刊或資料庫在Advance Search介面中執行，可限定有被收錄在 Cochrane Database of Systematic Reviews或Evidence Based Nursing期刊中的文獻。

  24. 篩選實證醫學資料（進階班） 方法一：Clinical Queries檢索介面 最好有前面的中級檢索結果，例如 #38 下 拉 PubMed根據Haynes RB理論，為實證醫學專設的搜尋介面，內建系統會將檢索條件自動設限在較具實證研究的文獻中。

  25. 方法一：Clinical Queries檢索介面 #38 與PICO問題面向有關 ※etiology:探討病因 ※diagnosis:診斷問題 ※therapy:治療或處置 ※prognosis:預後 與質量有關 Narrow:精準篇數少 Broad:敏感篇數多

  26. 方法一：Clinical Queries檢索介面 #38 AND #38 AND

  27. My NCBI 個人化設定 PubMed的 檢索details

  28. 方法一：Clinical Queries檢索介面

  29. 方法一：Clinical Queries檢索介面 (2011/5/11) 馬偕圖書館員至PubMed註冊的 電子全文標示 PubMed用該筆文獻到2000萬筆資料比對相關文獻  ◎用一篇文獻的MeSH Term 回推正確的檢索詞 ◎用一篇文獻的Publication type 判斷文獻類型 ◎用一篇文獻的Related articals滾雪球

  30. 篩選實證醫學資料（進階班） 方法二：limit利用limit中的”Type of Article” #39 也可直接下關鍵字後再選 Limits 可用前面的中級檢索結果，例如 #39

  31. 方法二：limit 利用limit中的”Type of Article”  使用Limit檢索可抓取到 證據等級較優，設計較好的文獻   使用Limit檢索後就無法抓取到 尚未被分類整理的最新文獻    

  32. 篩選實證醫學資料（進階班） 方法三：限定實證醫學期刊或資料庫 AND "Cochrane database of systematic reviews #38

  33. 方法三：限定實證醫學期刊或資料庫 限定期刊檢索 Clinical Queries/Broad Clinical Queries/Narrow Limit  欄位檢索亦可用於檢索特定作者、機構…所發表文獻

  34. 作者背景 Affiliation[AD]作者姓名 Author [AU]期刊名Journal [TA]MeSH Major Topic [MAJR] PMID [PMID]Publication Type [PT]任何關鍵字Text Words [TW]篇名任一字Title [TI]Title/Abstract [TIAB] Mackay memorial hospital[AD] Lin C C[AU] nursing outlook[TA] pain[MAJR] 20738438[PMID] 文獻類形[PT] nursing care[TW] chemotherapy[TI] 篇名或摘要任一字[TIAB] 特定欄位檢索—手動

  35. Display、Save、Email及其應用

  36. Display My NCBI 個人化設定 檢索得篇數 篇名 作者 刊名 年月 卷(期):頁數 PubMed的 檢索details

  37. 檢視摘要 (2010/9)

  38. 檢視摘要 (2011/5/11) 馬偕圖書館員至PubMed註冊的 電子全文標示 PubMed用該筆文獻到2000萬筆資料比對相關文獻  文獻類型 ◎用一篇文獻的MeSH Term 回推正確的檢索詞 ◎用一篇文獻的Publication type 判斷文獻類型 ◎用一篇文獻的Related articals滾雪球

  39. Save– clipboard(剪貼簿)    

  40. Save– clipboard(剪貼簿) Clipboard可在該電腦存8hr，最多可存500筆

  41. E-mail    

  42. 特定單篇文獻 Single Citation Matcher

  43. 主任給的作業中有一篇文章為 作者：Luks AM, Swenson ER. 篇名：Medication and dosage considerations in the prophylaxis and treatment of high-altitude illness. 刊名：Chest 年代：2008 Mar1 卷期：133(3) 頁數：744-55 PMID: 18321903 只要有其中任一或 二條件 就可找到該篇文章

  44. chest 133 744

  45. 刊名、年月、卷(期) 、頁數 作者 MeSH詞彙 可作為修正 檢索關鍵字參考

  46. Skills of Searching 搜尋現有的最佳實證之檢索技巧 複習

  47. PubMed檢索技巧—基礎 • 確立問題，建立PICO模式，找出關鍵字 • 找出同義詞或相關詞 ◎利用MeSH資料庫檢索MeSH term ◎display時展開MeSH term回推關鍵字 ◎利用detail檢視策略及關鍵字 • 布林邏輯運算概念要清楚熟練同義詞用OR聯集.PICO間用AND交集 • 善用history介面靈活組合檢索策略 • 適時修改檢索策略，不厭其煩多次檢索

  48. PubMed檢索技巧– 篩選實證文獻 不論用初級檢索或中級檢索都可再利用方法篩選實證文獻 • Clinical Queries先選擇面向，再選擇質量 • Limit限定特殊文獻類型 • Advance Search 指定實證期刊或資料庫 • MyNCBI個人化設定

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