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生命科學資料庫 Medline 、 PubMed 、 Biosis Previews 、 Agricola

生命科學資料庫 Medline 、 PubMed 、 Biosis Previews 、 Agricola. 臺大圖書館 推廣服務組 2009 / 10 / 16. 資料庫平台功能概述 認識主題檢索（控制語彙） 標題 索引典 生命科學常用資料庫操作示範 Medline [OvidSP 平台 ] PubMed [ 免費網路資源 ] BIOSIS Preview [WOK 平台 ] Agricola [CSA 平台 ] 生命科學其他相關資料庫資源. 課程大綱. 資料庫平台功能概述. 從文章發表流程看資料庫功能設計 資料庫平台功能 檢索技巧介紹. 確定主題.

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  1. 生命科學資料庫 Medline、PubMed、 Biosis Previews、Agricola 臺大圖書館 推廣服務組 2009 / 10 / 16

  2. 資料庫平台功能概述 認識主題檢索（控制語彙） 標題 索引典 生命科學常用資料庫操作示範 Medline [OvidSP平台] PubMed [免費網路資源] BIOSIS Preview [WOK平台] Agricola [CSA平台] 生命科學其他相關資料庫資源 課程大綱

  3. 資料庫平台功能概述 • 從文章發表流程看資料庫功能設計 • 資料庫平台功能 • 檢索技巧介紹

  4. 確定主題 大量閱讀與篩選 實驗、調查 實驗、調查 定調研究議題方向 從發表文章流程看資料庫功能設計 對資料庫的需求 完善的檢索功能與附加資訊 ，讓研究者找到相關文獻。 瀏覽browse/檢索Search 參考書目Reference 相關文獻Related Article 持續且自動地寄送最新書目 ，讓研究者掌握研究發展。 儲存檢索歷史 專題選粹 Alert / 最新目次服務 方便且完整的書目輸出功能 ，讓研究者易於引用。 書目匯出Export 書目引用格式Citation 撰寫文章與發表

  5. Basic/Quick vs. Advanced Search 2.查詢 查詢 刊名/作者/關鍵字… 6.輔助工具 布林/切截/限制查詢/其他工具 主題索引典 簡略顯示 vs. 詳細顯示 各式索引 3.顯示查詢結果 摘要 vs. 全文 7.個人化功能 勾選 → 勾選清單 4.輸出查詢結果 儲存檢索策略 輸出：列印/儲存/Email/ 輸出至書目管理軟體 E-mail/RSS Alert 資料庫平台功能 1.選擇不同主題的子資料庫 5.檢索歷史

  6. 基本檢索(basic/quick search) • 形同關鍵字查詢，運用單字或詞彙在書刊名、文章篇名或其它欄位中出現相同字彙的書目 • 使用關鍵字查詢，需留意誤檢(false drops)的現象 • 例如: 查virus AND birds，virus 出現在篇名，birds出現在其它欄位 • 使用原則 • 選用涵蓋主題概念的詞彙 • 儘量使用單字、詞組，而非句子

  7. 進階檢索(advanced search) • 限定欄位查詢（避免誤檢）+縮小查詢範圍 • 在進階檢索功能中，仍可選擇關鍵字檢索

  8. 使用限定欄位檢索(Fields) 使用精確片語檢索(Exact Phrase) 使用布林邏輯檢索(Boolean) 使用切截檢索(Truncation) 使用萬用字元檢索(Wildcard) 使用相近檢索(Proximity) 善用後分類功能 檢索技巧

  9. 限定檢索條件出現在特定欄位上，例如：篇名、摘要等限定檢索條件出現在特定欄位上，例如：篇名、摘要等 用來縮小檢索範圍 減少檢索到不相關的資料 排除誤檢(false drops)的現象，例如: “human cloning”兩字分別出現於不同欄位中。 限定欄位檢索

  10. 通常以””表示精確片語查詢 用來精確查詢某一詞彙(含其字彙順序)的查找 減少檢索到不相關的資料 精確片語檢索

  11. 布林邏輯檢索

  12. 巢狀布林邏輯是指在一檢索句中運用多次的布林邏輯運算元巢狀布林邏輯是指在一檢索句中運用多次的布林邏輯運算元 運算順序為：NOT→AND→OR 若要先行運算需使用括號() TI ( human clon* or human reproduction or human embryo research ) and TI ethic* 巢狀布林邏輯檢索

  13. 切截檢索 • 用於檢索單一詞彙之單複數形 • 用於檢索具有相同字根之詞彙 • 通常置於檢索詞字母之後 • 通常多以符號 * 與？代表 (但仍視資料庫而有所不同)

  14. 用於檢索單一詞彙之單複數形 用於檢索不確定之拼字 一個?代表一個英文字母，可置於檢索詞彙字母之間 萬用字元檢索

  15. 用來查找非片語，但希望是鄰近的字彙 不同資料庫可能採用不同的查詢字元，需查看資料庫使用說明 TULIPS：採用 Near(相距10個字以內，不限其次序) 採用Within # (如within 3相距三個字內) EV2，採用 Near/ONear (the exact order of terms) WOS，採用 SAME (查找topic、address欄位時) 相近(Proximity)檢索

  16. 針對檢索結果，提供類型、主題之再分類，以協助研究者縮小查誤範圍針對檢索結果，提供類型、主題之再分類，以協助研究者縮小查誤範圍 主題後分類 作者後分類 機構後分類 文章類型後分類 出版年份後分類 出版品後分類 常提供分類後之筆數予使用者參考。 後分類功能

  17. 後分類功能

  18. 認識主題檢索 • 控制語彙 • 主題表—Medical Subject Headings (MeSH) • 索引典

  19. 控制語彙controlled vocabulary 自然語彙 vs. 控制語彙 例如: 愛滋病 愛滋病、後天免疫缺乏症候群 、艾滋病 、愛之病(大陸用語) Acquired Immune Deficiency Syndrome 、AIDS、Human Immunodeficiency Virus (HIV)、HIV disease、 Thesaurus (索引典、同屬詞典、主題詞彙典)、Concept Heading & Subject Heading (標題)皆屬於控制語彙 用來表達文章或書中的主要概念，可補足Tilte中沒有使用到的主題概念詞彙

  20. 控制語彙 • 乃收集足以表示某特定學科領域的詞彙，並以特定的結構排列，以顯示出詞彙之間的關係。 • 透過索引典或標題表，可了解某特主題「廣義詞」、「狹義詞」、「相關詞」三者間的運用，作為擴大檢索與縮小檢索之用 廣 義 詞 同義詞 Key Concept 相關詞 狹義詞 狹義詞 狹義詞 狹義詞

  21. 控制語彙的樹狀結構—以MESH為例 • MESH 分為16大類，每大類採樹狀結構（tree structure） • 依層級細分小標題，可顯示標題之間的類屬關係。 • 最上層顯示者，表示該標題詞所代表的主題意涵較廣（generic）。 • 而愈下層顯示者，則表示該 標題詞所代表的主題意涵愈 為專指（specific）。 • 如此上下標題層級的呈現方 式，更可比擬為各標題詞間 的廣義詞（broad terms）及 狹義詞（narrow terms）關係。 MeSH Diseases Neoplasms Neoplasms by Site Digestive System Neoplasms Gastrointestinal Neoplasms Intestinal Neoplasms Colorectal Neoplasms

  22. 醫學標題表（Medical Subject Headings，簡稱MeSH）是NLM針對生物醫學資料所整理出的標準詞彙控制表。 對同一概念採用固定的詞彙表達方式，以達到控制詞彙目的，方便生物醫學領域的學者或從業人員彼此間的溝通，更可用以陳述資料內容的主題意涵並提供檢索。 架構： 主標目：描述主題或內容特性的詞彙，可能由一個字、片語或多個字組成 副標目，如 Disease - Diagnosis Disease - Therapy Disease - Epidemiology 複分：形式複分。如: Social Sciences – Encyclopedias 地理複分。如: Labor supply – France 範圍註(scope note) 、參見(see also) 、見(see) MESH醫學標題表

  23. 索引典多用於資料庫中，但並非所有資料庫都建立索引典索引典多用於資料庫中，但並非所有資料庫都建立索引典 EBSCOhost Sociology Thesaurus (SocINDEX with Full Text) Business Thesaurus (Business Source Premier ) ERIC -- Thesaurus Ovid SP PsycINFO CSA Illumina Life Science Thesaurus … 索引典(Thesaurus)

  24. 資料庫操作示範 • 資料庫使用範圍與進入途徑說明 • Medline [OvidSP] • PubMed [免費電子資源] • BIOSIS Preview [WOK] • Agricola [CSA]

  25. 臺大校區內使用 IP: 140.112.*.* 校外連線 Proxy: lib.cc.ntu.edu.tw port: 3128 SSL VPN服務：https://sslvpn.ntu.edu.tw 尊重智慧財產權 資料庫使用範圍

  26. 路徑：[工具][網際網路選項][連線] ADSL上網：[設定值]設定proxy 固網、寬頻、區網：[區域網路設定]設定proxy 身份認證：計中email帳號及密碼 校外連線-proxy ADSL 區域網路

  27. 校外連線-VPN • 開啟IE等瀏覽器，在網址列輸入VPN網址： https://sslvpn.ntu.edu.tw • 鍵入計中email帳號及密碼，使用者名稱為user。

  28. 進入資料庫

  29. 進入資料庫

  30. 進入資料庫

  31. 美國國家醫學圖書館(National Library of Medicine,簡稱NLM)所發展的線上醫學資料庫檢索系統。 是檢索生物醫學領域文獻最重要的資料庫。 收錄年限：1950-Present。 資料類型：醫學期刊文獻、學術專論、會議論文資料。 更新頻率：週更新。 收錄內容：基礎生命科學、臨床生命科學、生物科學、解剖學、 心理學、醫事資訊學等12類。 本館購買OvidSP平台10人同時上線使用權。 2009年另有EBSCOhost平台可使用。 Medline資料庫

  32. Medline-Basic Search • Basic Search協助初學者以最快速的方式找到核心資料。 • 可輸入主題關鍵字、片語、甚至是一段問題陳述 • 例如：欲查詢有關「幼兒肥胖症的治療方法」，可輸入「treatment for childhoodobesity」 • 勾選「Including Related Terms」，可同時查詢同義詞、相關概念詞、異體字等。 因為有Related Terms的輔助，使用者可以慣用的簡單字彙去進行檢索，不需特地使用專用語法。

  33. 檢索結果筆數 列出系列進行查詢的其他同義詞、相關詞 依據相關程度呈現最適合的文獻資料

  34. Count檢索詞彙 在每個段落中出現的次數 How many search concepts appear in the passage Frequency相關概念的詞彙在每個段落中出現的頻率 How often concepts occur in the passage Importance關鍵字在資料庫中的重要性 How rare the terms are in the database Cohesion關鍵字彼此之間的距離遠近 Whether or not terms within phrases occur closely together Vocabulary Level與輸入的關鍵字相符程度 How closely a passage's language matches your word choices rather than variants and synonyms 說明：每篇文獻關聯性的計算因子

  35. Medline-Advanced Ovid Search • Advanced Search 協助研究者完整地找到某特定主題的所有文章。 • 可輸入主題關鍵字或片語。 • 勾選「Map Term to Subject Heading」，先去找出與關鍵字相關、或是更適當的主題述語。 因為有Map Term to Subject Heading，系列會將輸入關鍵字與醫學標題做配對，呈現合適的主題供選擇。

  36. Medline—MESH之SCOPE Scope可以提供該標題的說明與相關詞彙，當發表文獻的人使用這些同義辭彙時，就會被歸類在此一標題下 系統主動比對出適合的醫學標題

  37. 回到之前的標題主題頁 提供該標題簡單的定義以及選擇時的注意事項 顯示該標題的同義詞或片語 某些標題還有「See Related」的項目， 建議讀者可以同時查詢的相關標題

  38. Medline—MESH之Explode與 Focus

  39. 依需要勾選適合的MeSH主題

  40. 在MeSH樹狀標題表中可以清楚了解相關主題的彼此從屬或對應關係在MeSH樹狀標題表中可以清楚了解相關主題的彼此從屬或對應關係 若想要更進一步了解相關主題，可以點選進入MeSH樹狀標題表

  41. Medline—MESH之副標題 副標題幫助我們精準的確認文獻查詢的方向

  42. 有勾選，系統會在醫學主題表中找出與該term最相關的控制字彙索引，並用and、or 做複選，資料較多。 不勾選，系統只會從 Title 、abstract、identifiers 或subject heading這些欄位中去找該term，資料較少，且易有遺漏文獻的狀況。 建議勾選，並利用副標題的功能縮小特定主題，或利用限制查詢功能縮小查詢範圍。 Medline--Map term

  43. Basic Search 或Advanced OVID Search，皆有限制查詢「limits」的功能。 預設值為是否限定英文、是否限定電子全文、是否為書評、與出版時間等常見限制條件。 點選「Additional Limits」可開啟醫學專屬的限制條件。 Medline--限制條件

  44. Medline--限制條件

  45. 經由主題的確認與Limit的協助，快速找到較精確的結果經由主題的確認與Limit的協助，快速找到較精確的結果 Medline--限制條件

  46. Map Term：詞彙比對 Thesaurus：顯示以字順排列之主題表；標準控制詞彙以字順方式排列，讀者可以了解輸入之關鍵字或片語可對應的主題，並且顯示相關Broader Term、Narrow Term、Related Term和Used-for Terms。 Permuted Index：替代索引；藉由輸入單一關鍵字顯示所有包含此關鍵字的主題、Related terms和Used-for terms等。 Scope Note：名詞解釋；提供該標準主題詞彙的參考資料。 Explode：延展主題查詢；延展搜尋結果，包含該主題以及子階層之主題。 Classification Codes：分類號查詢；部分資料庫提供分類號及主題供查詢。 Medline—Search Tools 46

  47. Medline查詢小撇步

  48. Medline--檢索結果清單 可以看到目前正在瀏覽的文獻清單號碼， 以及檢索結果總筆數。 Narrow search：提供主題、作者以及期刊的後分類功能，幫助使用者縮小檢索範圍。 經由作者後分類，可探知該領域的專家學者。 經由期刊名後分類，可探知某期刊的主要學科領域。

  49. Medline—簡易書目 • 摘要 • 完整的書目資料 • 開啟全文 • 與臺大館藏目錄連結 • 與文獻傳遞系統連結 • 網路資源 Find Similar：延伸查詢篇名類似的文獻。 (類似PubMed資料庫中Related Articles的功能) Find Citing Articles：查詢引用該篇資料的文獻。

  50. MEDLINE -詳細書目提供醫學標題

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