1 / 30

Türkiye’deki Kistik Fibrozis Mutasyonları

Türkiye’deki Kistik Fibrozis Mutasyonları. Prof. Dr. Deniz Doğru Ersöz Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi Çocuk Göğüs Hastalıkları Ünitesi. KF Genetiği. KF geni 7. kromozomun uzun kolunda Bu gende 1500’den fazla mutasyon (1604). KF geni. KF geni 1480 amino asitlik bir protein sentezler

noma
Download Presentation

Türkiye’deki Kistik Fibrozis Mutasyonları

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Türkiye’deki Kistik Fibrozis Mutasyonları Prof. Dr. Deniz Doğru Ersöz Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi Çocuk Göğüs Hastalıkları Ünitesi

  2. KF Genetiği • KF geni 7. kromozomun uzun kolunda • Bu gende 1500’den fazla mutasyon (1604)

  3. KF geni KF geni 1480 amino asitlik bir protein sentezler “KF transmembran regülatör (KFTR) protein”

  4. KFTR

  5. KFTR mutasyonları Ağır Hafif

  6. Türkiye’de Kistik Fibrozis • 24 merkez ve 70 doktor KF ile ilgileniyor • KF doğum prevalansı: 1/3000 • Tanı alamayan 5000 KF hastası olduğu tahmin ediliyor • Ulusal veri sistemi hazırlandı • 2007 ‘de 35 merkeze mektup yazıldı, 10 cevap

  7. Türkiye’de Kistik Fibrozis Üniversite Hasta sayısı % Hacettepe 318 45.8 Marmara 195 28 Dokuz Eylül 49 7 Ege 39 5.6 Çukurova 37 5.3 Akdeniz 14 2 Erciyes 10 1.4 Uludağ 17 2.4 Celal Bayar 7 1 Ankara 5 0.7 Harran 3 0.4 Total 694 100

  8. KF mutasyonları

  9. Bilinen KF mutasyonları

  10. Mutasyon dağılımı

  11. Türk KF hastalarında KFTR mutasyonu saptama sıklığı Yıl Hasta Saptanan Mutasyon Yazarlar Merkez mutasyon saptama sayısı (n) (%) 1995 67 …. 34.6 Yılmaz Ankara 1997 6 7 53.8 Angelicheva Bulgaristan • 73 18 52.2 Onay İstanbul 2001 98 27 56.5 Onay İstanbul • 83 36 75 Kılınç İstanbul 2008 31 62.4 Lakeman Hollanda

  12. Türk KF hastalarında Delta F508 mutasyonu sıklığı Yıl Hasta DF508 Yazarlar Merkez (n) (%) 1990 15 27 Hundreiser Almanya • 25 20.3 Köprübaşı İzmir • 67 28.4 Yılmaz Ankara 1997 6 46 Angelicheva Bulgaristan • 73 18.8 Onay İstanbul 2001 98 25 Onay İstanbul • 83 23.5 Kılınç İstanbul 2007 499 29.6 ........ Türkiye

  13. Türk KF hastalarında diğer mutasyonların sıklığı Onay, et al, 2001

  14. Türk KF hastalarında diğer mutasyonların sıklığı Kılınç, et al, 2002

  15. Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi • Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı Moleküler Genetik Tanı Laboratuarı’nda • INNO-LiPA, CFTR17 ve CFTR19 kitleri kullanılarak • 36 KFTR mutasyonunun taranması yapılmaktadır • Mutasyon saptanamayan alileler için doğum öncesi tanı işleminde KFTR geninde bulunan polimorfik belirleyiciler (IVS6a-GATT, TUB18:intron 18 3601-65 A/C, TUB20 :intron 20 4006-200 A/C ) ile indirekt tanı analizi yapılmaktadır

  16. HÜTF Mutasyonların Sıklığı MutasyonlarSıklığı % delF50825.22 1677delTA5.22 N1303K4.25 2789+5GA3.05 G85E3.82 G542X2.62 2183AA-G2.07 R334W1.4 W1282X1.0 Diğerleri≤ 1 • Yılmaz E, et al. Study of 17 mutations in Turkish cystic fibrosis patients. Human Heredity 1995; 45;175-177. • Dayangaç D, et al. Mutations of the CFTR gene in Turkish patients with congenital bilateral absence of the vasdeferens. Hum Reprod 2004;19:1094-1100.

  17. CBAVD olan 51 erkek hasta • 27 KF mutasyonu • Mutasyon bulma oranı %72.5 • 2/3 hastada her iki kromozomda CF mutasyonu • En sık IVS8-5T ve D1152H mutasyonu

  18. Türkiye’de KF • Türkiye, Avrupa ve Asya’nın birleştiği, göçün sık olduğu yerde • Populasyon çok eski • Türkiye, büyük göç hareketlerinin olduğu yol üzerinde olmuştur; birçok değişik uygarlık ve değişik populasyonlara ev sahipliği yapmıştır • Türkiye, coğrafik yerleşim ve tarihi geçmişi nedeniyle genetik köprü görevi görmüştür • Ülkenin bu yerleşim ve tarihi, Türk populasyonunda görülen yüksek heterojeniteyi açıklamaktadır

  19. Türkiye’de KF • KF hastalığının sık olması beklenir, fakat muhtemelen tanı konulamıyor • Türk populasyonunun KF moleküler genetiği hakkında çok az şey biliyoruz • En sık görülen mutasyon bilinmiyor • DF508 sıklığı düşük • Diğer ülkelerde sık görülen mutasyonlar değil, çok sayıda daha değişik mutasyonlar görülüyor • Akdeniz ülkelerinin mutasyon çeşitlerine benzer mutasyonlar

  20. Türkiye’de KF • Akdeniz bölgesinde mutasyonların heterojenitesi çok yüksek • Anadolu bölgesindeki populasyondaki genetik heterojenite daha sık • Türkiye populasyonu en sık genetik heterojeniteye sahip

  21. 27.177 kromozomdaki coğrafik dağılım • 29 Avrupa ülkesi • 3 tane kuzey Afrika ülkesi • Avrupa’da 272 değişik mutasyon saptanmış • 25 ülkeden 63 laboratuar/ülke anket doldurmuş • M Özgüç, A Göçmen, H Erdem (Hacettepe Üniversitesi, Ankara), Türkiye

  22. DF508 mutasyonu en sık Danimarka’da (87.2%) en az Türkiye’de (21.3%) • DF508 sıklığı Kuzey ve orta Avrupa ülkelerinde 72.8%, Akdeniz bölgesinde 56.8%. • Akdeniz ülkeleri arasında Cezayir, İsrail, Tunus ve Türkiye’de DF508 en az sıklık

  23. Avrupa’daki en sık 3 mutasyon T (DF508, G542X ve N1303K) birçok ülkede mevcut • Avrupa’daki değişik KF mutasyonlarının coğrafik dağılımı, bu mutasyonların Akdeniz bölgesinde çok heterojen dağıldığını gösteriyor

  24. Türkiye’de KF • Türkiye’de KF’in genetik tanısı çok zor • KFTR genindeki heterojenite çok sık • Mutasyonların %60’ının tanınması ve haplotip analizi ile Türkiye’de genetik danışma şansı artacaktır • KF populasyon taraması çok zor gibi görünmektedir

More Related