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Oihana Belar 1 , Sergio Bartolomé 2 , Josu Aramberri 3 Roberto Bilbao 1

Nuevas necesidades de comunicaciones en el ámbito de la imagen médica para el desarrollo de un motor de búsqueda con fines de investigación. Oihana Belar 1 , Sergio Bartolomé 2 , Josu Aramberri 3 Roberto Bilbao 1 1 Biobanco Vasco, Bilbao, 2 Redytel, Erandio , 3 I2BASQUE Donostia-San Sebastián.

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Oihana Belar 1 , Sergio Bartolomé 2 , Josu Aramberri 3 Roberto Bilbao 1

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Presentation Transcript


  1. Nuevas necesidades de comunicaciones en el ámbito de la imagen médica para el desarrollo de un motor de búsqueda con fines de investigación • Oihana Belar1, Sergio Bartolomé2, Josu Aramberri3Roberto Bilbao1 • 1Biobanco Vasco, Bilbao, 2Redytel, Erandio, 3I2BASQUE Donostia-San Sebastián

  2. BIOPOOL: un proyecto de servicios de imagen médica

  3. Funcionamiento de los biobancos Sociedad Biobancos Donantessanos Pacientes Datos Research center DATOS Procesamientomuestras Muestras y datos MUESTRAS

  4. Biobank 2 • Biobank n • Biobank 3 • Biobank 1 SITUATION BEFORE THE BIOPOOL PROJECT 40 colon adenocarcinoma Many queries based on diagnosis for each biobank

  5. Biobanks are misused National Bioethics Advisory Commission estimated that there were 282 million specimens in the US

  6. IDEA: DEVELOPMENT OF DIGITAL BASE DATA Lung tumor processed to histological slide Digital scanning of histological sections Tumor surgically removed Lung with tumor Histological images Central server of Biobank Associated Clinical data Tumor Imagen

  7. Datosmorfológicos Datosdiagnóstico AP Datos

  8. IDEA: DEVELOPMENT OF DIGITAL BASE DATA Lung tumor processed to histological slide Digital scanning of histological sections Tumor surgically removed Lung with tumor Histological images Central server of Biobank Associated Clinical data Búsquedasbasadas en texto y/o imágenes

  9. Servicios BIOPOOL Red de biobancos y hospitales BIOPOOL: Web 3.0 interface Investigador Docente Médico

  10. Application to the call: FP7 ICT 2011.4.1 SME initiative on digital content and languages

  11. 3. THE COMPOSITION OF THE CONSORTIUM From 4 different countries

  12. Buscador de muestras BIOPOOL RESULTADO OBTENIDOS

  13. www.biopoolproject.eu

  14. BIOPOOL prototype

  15. Search engine result

  16. Problemas a resolver • Almacenamiento de datos • Comunicaciones: envío de datos

  17. Problemas de comunicaciones y almacenamiento • 2000-3000 imágenes/año • 0.5-10 GB/imágen • Diferentesformatos de almacenamiento • Diferentestipos de fichero

  18. Almacenamiento de imágenes: Nube privada Proveedor de servicios de nube privada: almacenamiento de imágenes Edificio central del Sistema sanitario Biobanco Vasco

  19. Nube Biobanco

  20. Recomendaciones de AEPD I • La jurisdicción aplicable es la española • El cliente tiene que dar su conformidad a la participación de terceras empresas, al menos delimitando genéricamente los servicios en los que participarán • A la terminación del contrato, a entregar toda la información al cliente en el formato que se acuerde. • El cliente debe tener la opción de exigir la portabilidad de la información a sus propios sistemas de información o a un nuevo prestador de cloud cuando considere inadecuada la intervención de algún subcontratista o la transferencia de datos a países que estime no aportan garantías adecuadas. • Deben preverse mecanismos que garanticen el borrado seguro de los datos cuando lo solicite el cliente y, en todo caso, al finalizar el contrato

  21. Flujo de datos en el proyecto BIOPOOL

  22. Cumplimiento de la normativa legal

  23. GRACIAS Eskerrikasko

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