slide1 n.
Download
Skip this Video
Loading SlideShow in 5 Seconds..
ELŐNYÖK ÉS LIMITÁCIÓK PowerPoint Presentation
Download Presentation
ELŐNYÖK ÉS LIMITÁCIÓK

Loading in 2 Seconds...

play fullscreen
1 / 19

ELŐNYÖK ÉS LIMITÁCIÓK - PowerPoint PPT Presentation


  • 93 Views
  • Uploaded on

ELŐNYÖK ÉS LIMITÁCIÓK. MOLEKULÁRIS MIKROBIOLÓGIAI VIZSGÁLATI MÓDSZEREK ALKALMAZHATÓSÁGA A BIOREMEDIÁCIÓBAN. Balázs Margit. Miért alkalmaznak molekuláris biológiai módszereket a bioremediációban ?. 1 g talajban közel 10 8 -10 9 db prokarióta sejt található.

loader
I am the owner, or an agent authorized to act on behalf of the owner, of the copyrighted work described.
capcha
Download Presentation

ELŐNYÖK ÉS LIMITÁCIÓK


An Image/Link below is provided (as is) to download presentation

Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author.While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server.


- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E N D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
    Presentation Transcript
    1. ELŐNYÖK ÉS LIMITÁCIÓK MOLEKULÁRIS MIKROBIOLÓGIAI VIZSGÁLATI MÓDSZEREK ALKALMAZHATÓSÁGA A BIOREMEDIÁCIÓBAN Balázs Margit

    2. Miért alkalmaznak molekuláris biológiai módszereket a bioremediációban? 1 g talajban közel 108-109 db prokarióta sejt található Hugenholtz P, Goebel BM & Pace NR (1998) Impact of cultureindependentstudies on the emerging phylogenetic view of bacterial diversity. J Bacteriol 180: 4765–4774.

    3. Nem tenyészthető mikrobák vizsgálata • Sejtalkotók: • DNS –minden információ ott van • RNS – a sejt éppen mit csinál • Fehérjék

    4. Milyen (a bioremediáció szempontjából Fontos) információ nyerhető? • Mikrobiális összetétel • Milyen metabolikus tulajdonságokkal rendelkezik • Milyen lebontási útvonal lehetséges, potenciális köztitermékek 1g talajban akár 10 000 féle faj is lehet!

    5. Milyen (a bioremediáció szempontjából Fontos) információ nyerhető? • Mikrobiális összetétel • Milyen metabolikus tulajdonságokkal rendelkezik • Milyen lebontási útvonal lehetséges, potenciális köztitermékek

    6. Milyen (a bioremediáció szempontjából Fontos) információ nyerhető? • Mikrobiális összetétel • Milyen metabolikus tulajdonságokkal rendelkezik • Milyen lebontási útvonal lehetséges, potenciális köztitermékek

    7. Hasonlóan a kémiai analitikához, ez is egy mérési módszer, ahol a hibázást a minta előkészítés, mérés kivitelezés és eredmény kiértékelések során lehet elkövetni.

    8. 0. lépés: Mintavétel – minta heterogenitás Mikrobiális ujjlenyomat Minta térfogat: 0,1-1g talaj Talaj részecskék 20 m 20,2 m 20,4 m baktériumok 26 m 28 m 30 m Talaj szennyezők

    9. 1. lépés: Minta előkészítés: nukleinsav extrakció (DNS, RNS) hatékonysága Minőség Mennyiség Mátrix minőség Sejt feltárás Szennyező anyag

    10. 1. lépés: Minta előkészítés: nukleinsav extrakció (DNS, RNS) hatékonysága * talaj DNS extrakciós kit alkalmazásával ** saját DNS extrakciós módszer alkalmazásával

    11. 2. lépés: Mérés: Amplifikáció hatékonysága Templát DNS Jó termék DNS polimeráz Fals termék Szennyeződés, inhibitor

    12. 2. lépés: Mérés: Amplifikáció hatékonysága a b c * nem hibajavító DNS polimeráz ** hibajavító DNS polimeráz

    13. 2. lépés: Mérés: Amplifikáció hatékonysága * nem hibajavító DNS polimeráz ** hibajavító DNS polimeráz

    14. Sok minden más, ami még befolyásolhatja az eredmények minőségét • Minta tárolás: hőmérséklet, idő, atmoszféra • DNS alapú módszereknél élő és halott sejtek együttes kimutatása történik • Amlifikáció és a DNS polimeráz enzim hibái: fals termékek, hibázás • Detektálás érzékenysége

    15. Molekuláris biológia kell vagy nem kell? • Igen, ha • „nem tenyészthető” baktériumok vizsgálunk • pl. klórozott alifás szénhidrogén reduktív deklorináció

    16. Molekuláris biológia kell vagy nem kell? • Igen, ha • Ha nem egyedi baktériumot, hanem mikrobiális konzorciumot vizsgálunk • pl. A bioremediáció megfelelő irányba megy-e? Vagy éppen miért nem működik egy biológiai víztisztító rendszer?

    17. Molekuláris biológia kell vagy nem kell? • Igen, ha • Ha nem egyedi baktériumot, hanem mikrobiális konzorciumot vizsgálunk • pl. A bioremediáció megfelelő irányba megy-e? Injektáltunk a felszín alá baktériumot, de vajon életben maradt-e? • MTBE biodegradáció

    18. Molekuláris biológia kell vagy nem kell? • Igen, ha • Ha nem egyedi baktériumot, hanem mikrobiális konzorciumot vizsgálunk • Egy beavatkozással (pl. kémiai oxidáció, redukció) milyen változást okozunk a talaj ökoszisztémában?