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Grenoble 21-22 décembre 2004

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Grenoble 21-22 décembre 2004 - PowerPoint PPT Presentation


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[email protected] & GENNERE. 6ème Séminaire synthèse technologique. Grenoble 21-22 décembre 2004. SIMS-REIN. Ben Saïd M, Richard JB, Le Mignot L, Taupin P, Dufour E, Mugnier C, X Ferreira, JP Necker Toubiana* L, Jais JP, Landais P. EA222, hôpital Necker Université Paris 5 & *U444 INSERM.

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- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E N D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Presentation Transcript
slide1
[email protected] & GENNERE

6ème Séminaire

synthèse technologique

Grenoble21-22 décembre 2004

slide2
SIMS-REIN

Ben Saïd M, Richard JB, Le Mignot L,

Taupin P, Dufour E, Mugnier C,

X Ferreira, JP Necker

Toubiana* L, Jais JP, Landais P.

EA222, hôpital Necker Université Paris 5

& *U444 INSERM

slide3
SIMS-REIN
  • Montée en charge
  • Réseau humain
  • Architecture du SI
  • Aspects techniques
  • Aspects fonctionnels
  • Contrôle de qualité
  • Nouvelles fonctionnalités
  • Évolution
  • Communications
slide4
SIMS-REIN

Montée en charge

Décembre 2004

slide5
SIMS-REIN Novembre 2004

6 régions + la Pédiatrie

jan. 2002

juin 2002

jan. 2003

jan. 2004

jan. 2004

jan. 2004

nov. 2004

Limousin

Languedoc Roussillon

Champagne Ardenne

Centre

Provence Alpes-Côte-d’Azur

Pédiatrie

Ile-de-France

slide6
9080 patients

SIMS-REIN

décembre 2004

8858

Limousin

Languedoc Roussillon

Champagne Ardenne

Centre

PACA

Pédiatrie

Ile-de-France

3022

Grenoble

21 déc 2004

2284

COS

23 Nov 2004

385

COS

Oct 2003

22

Déc 2000

Client-léger

Avril 2001

e-bordereau

Jan 2003

Champagne Ardenne

Jan 2004

Centre – PACA – Pédiatrie - IDF

Juin 2002

Languedoc

21 jan 2002

Limousin – SIMS-REIN

slide7
État Décembre 2004

9080 dossiers de patients dialysés

7576 dossiers de patients vivants

slide8
État déc. 2004 :7576 patients vivants
  • Limousin
  • Languedoc Roussillon
  • Champagne Ardenne
  • Centre
  • Provence Alpes Côte d’Azur
  • Pédiatrie
  • Ile de France
  • greffés
  • hors région

353

1406

697

1233

3039

61

77

634

76

slide9
SIMS-REIN : Outil - Flux & trajectoires des patients en IRTT

2404

1756

628

20

Total des transferts

d’une unité de dialyse

vers la dialyse:dans une même région (1654)

dans une autre région (111)

vers la transplantation

de la transplantation

vers la dialyse

slide10
SIMS-REIN : Recueil des informations longitudinales - recueil du suivi annuel
  • Limousin
  • Languedoc Roussillon
  • Champagne Ardenne

215/240 - 2003

195/294 - 2004

800/955 - 2003

674/1202 - 2004

360/412 - 2004

slide11
Démarrage d’une nouvelle région (1)
  • Identification des acteurs :
  • - Médecin régional,
  • - médecin de santé publique ,
  • - attaché de recherche Clinique
  • Identification des structures de soins de la région et des utilisateurs (profils)
  • Dossier des préconisations SIMS et accompagnement des utilisateurs et des ARCs
slide12
Démarrage d’une nouvelle région (2)

Intégration dans SIMS-REIN

des données existantes

  • Enquête CNAM-DHOS 2003
  • Bases locales - patients incidents à partir de juin 2003
slide13
Intégration dans SIMS-REIN

des données de

l’enquête CNAM-DHOS 2003

  • Gestion des données nominatives absentes
  • de la base de l’enquête CNAM-DHOS 2003
  • Gestion des données incomplètes, des doublons, du codage médical
  • Gestion de l’affectation des patients dans les unités de soins
slide14
État nov. 2004 :

intégration dans SIMS-REIN

des données de l’enquête CNAM

  • 3800dossiers de patient :
  • 1200 région CENTRE, 2600 en PACA
  • Complément et contrôle de qualité des
  • données par les ARCs
  • - Restent près de 1000 dossiers à vérifier dont plus de 900 en PACA
slide15
État 20 déc 2004. :

intégration dans SIMS-REIN

des données de l’enquête CNAM

3800dossiers de patient :

Restent 6 dossiers à vérifier en PACA

Contrôle de qualité des données de 2 à 5 mois après l’intégration des données de la région PACA et la région Centre dans SIMS-REIN

slide16
Démarrage d’une nouvelle région (3)
  • Montée en charge en 2005 :
  • Ile de France (2 ARCs +/- 1 ARC)
  • Midi- Pyrénées (1 ARC)
  • Basse Normandie (1 ARC)
  • Bourgogne (?)
  • Pays de Loire (?)
slide17
SIMS-REIN

le réseau humain

Décembre 2004

slide18
Les néphrologues et SIMS-REIN

170 codes d’accès à l’application

pour 337 unités de soins

Le réseau n’a pu se développer

qu’avec la contribution de l’ensemble

des acteurs

slide19
Les médecins coordinateurs

J-C. Aldigier

F. de Cornelissen

H. Maheut

S. Baudin, F. Von Ey

P. Brunet, R. Sambuc

MH. Saïd, P. Niaudet

G. Bobrie

Limousin

Languedoc Roussillon

Champagne Ardenne

Centre

PACA

Pédiatrie

Ile-de-France

slide20
Les Attachés de Recherche Clinique

et SIMS REIN

Florence Glaudet

Françoise Lebeau

Y Duny

Marie-Dominique Lorenzi

Claudette Berquez

Anne-Claire Durand

Pierre Taupin

Patricia Chaignot

Limousin

Languedoc Roussillon

Champagne Ardenne

Centre

PACA

Ile-de-France

slide21
Structures d’Appui Épidémiologique

A. Vergnenègre

J-P. Daurès

F. Vitry

J-M. Halimi

J-C. Delaroziere

P. Landais

P. Landais

Limousin

Languedoc Roussillon

Champagne Ardenne

Centre

PACA

Pédiatrie

Ile-de-France

slide22
SIMS-REIN

Aspects techniques et fonctionnels

Décembre 2004

slide23
SIMS-REIN

Serveur d’identité

Décembre 2004

slide24
clients

universels

serveur web dynamique

données

Interface Web

Fonctions métiers

Datamart REIN

alimentation

JSP

Serveurs d’évènements

Base d’évènements

Serveurs d’identités

Servlets

intégrateur

Base d’identité

SIMS : une architecture n-tier

slide25
Dossier CNIL(Annexes n° 5, 7, 8, 12, 13 & 14)

Mise en œuvre de l’application « Système d’Information Multi-Sources du Réseau Epidémiologie et Information en Néphrologie »

slide26
interface

gestion des droits

création

synchro

batch

reconnais-

sance

identité

BDD

modification

apprentissage

lecture

algorithme

comparaison

Architecture du SI

slide27
Découplage identité

et données médicales

Client

Serveur d’identité

N° Patient

Etat civil

Interface web

N° Patient

Données médicales

Données médicales

slide28
Création d’une base d’identifiant

dédoublonnage à la source

slide31
SIMS-REIN

notes techniques et fonctionnelles

Décembre 2004

slide32
SIMS-REIN
  • aspects techniques et fonctionnels :
    • Environnement
    • Transactions
    • Exports
    • Transferts
slide33
Environnement : migration

Java

Mysql

Tomcat

1.4

4.0

5.0

XML, logging, assertions

robustesse, performances, transactions

performances, gestion mémoire

slide34
Migration à venir

Java

Mysql

Tomcat

5.0

4.1

5.5

metadata, templates, ...

- requêtes imbriquées,

- procédures stockées,

- contraintes d’intégrité,

-fonctionnalités OpenGIS

slide35
Transactions (1)

Au niveau de l’application :

Encapsulation des traitements dans une servlet générique

=> gestion des connections, erreurs et rollbacks, systématisée

slide36
Transactions (2)

Écriture

affichage

résultat

Filtre

connexion

traitement

erreur

récupération

exception

slide37
Transactions (3)

Au niveau des données :

moteur MyIsam -> InnoDB , compatible ACID

  • Atomicity
  • Consistency
  • Isolation
  • Durability
slide38
Exports (1)
  • Évolution des exports
  • les exports sont structurés pour faciliter leur utilisation :
    • analyse épidémiologique et demande de soins
    • analyse de l’offre de soins
    • analyse annuelle
    • analyse longitudinale
slide40
SIMS-REIN

Transferts

Décembre 2004

slide41
SIMS-REIN
  • Typologie des problèmes
    • transferts et reconstitution des trajectoires
    • dates
  • aspects fonctionnels :
    • mise à jour annuelle
slide42
Transfert vers la greffe (1)
  • Création des unités de greffe :
    • les transferts de greffe se feront dorénavant dans les unités de greffes
    • et non plus vers l’administrateur SIMS REIN
slide45
Transfert vers la greffe (4)
  • Administrateur SIMS-REIN
  • CHU Reims
  • CHU La Conception - Marseille
  • CHU Nice
  • CHU Tours
  • CHU Montpellier
  • Ile de France
  • Autres

448

52

45

34

17

11

10

15

slide46
Autres transferts
  • Le retour à domicile et le départ définitif vers un autre pays restent déclarés à l’administrateur SIMS REIN
slide47
SIMS-REIN

nouveaux bordereaux

Décembre 2004

slide48
Nouveaux bordereaux
  • Évolution vers le bordereau 2005
    • préconisations du Guide du REIN
    • modifications mineures dans SIMS REIN :
      • numéro EfG
      • qualification des comorbidités
      • modalités des lieux de traitement
      • voie d’abord vasculaire
slide49
SIMS-REIN
  • Sécurité

Décembre 2004

composants de la s curit
Composants de la sécurité
  • Intégrité du système
    • Contre les attaques extérieures
    • Contre les pannes logicielles ou matérielles
  • Gestion des accès
    • Authentification
    • Autorisation
    • Accounting (Journalisation)
principe g n ral
Principe général
  • La zone production ne communique pas directement avec les autres zones
  • Elle n’est accessible que via le mandataire (proxy)
r le du pare feu
Rôle du pare-feu
  • Routage et filtrage des flux entre les différents segments au niveau des adresses IP et des protocoles (ports)
    • Protocoles http (port 80) et https (port 443) autorisés en flux entrant sur la zone proxy, interdits vers les autres zones
  • Translation des adresses locales (adressage privé) en adresses publiques légales sur Internet
  • Accounting des règles de filtrage
r le du mandataire inverse reverse proxy
Rôle du mandataire inverse(reverse proxy)
  • Réécriture des URL publiques en URL privées
    • http://simsrein.necker.fr/index.html ->http://192.168.2.2/sims/public/index.html
  • Filtrage au niveau applicatif (filtrage des URL)
    • http://simsrein.necker.fr/cgi/test.cgi
  • Accounting du proxy (Apache mod_proxy)
  • Gestion de SSL (mod_SSL)
d tection d intrusion
Détection d’intrusion
  • Carte réseau dédiée sans adresse IP pour l’analyse du trafic
  • Recherche de signatures d’attaques (SNORT)
  • Accounting
pannes logicielles et mat rielles
Pannes logicielles et matérielles
  • Configuration RAID des serveurs
  • Serveur de sauvegarde dédié dans la zone production
gestion des acc s
Gestion des accès
  • Utilisation du protocole SSL-TLS
    • Authentification
    • Cryptage
  • Approche mini-PKI
    • Certificats serveur
    • Certificats clients -> distribution des certificats clients ?
slide58
SIMS-REIN

Contrôle de qualité

Décembre 2004

slide59
SIMS-REIN : Contrôle de qualité
  • Procédures mises en place avec
  • les ARC
  • contrôle de l’exhaustivité
  • et de la qualité des données
slide60
consolidation

Saisie

brouillon

validation

Datamart REIN

Base d’évènements

Vérification d’identité

Base d’identité

Contrôle exhaustivité

et qualité

clients

universels

serveur web dynamique

données

slide61
Contrôle Exhaustivité : Limousin (1)

Patients traités hors région

Centre Lourd

Association

Listing

secrétariat

Contact avec

les centres de dialyses

PMSI

Code de Dialyse Z491

Complément de la base

SIMS REIN

slide62
Monitoring du suivi : Limousin (2)

SUIVI MENSUEL

Listing de chaque centre Listing de la base SIMS REIN

SUIVI ANNUEL

Patients absentsde SIMS REIN

Patients de SIMS REIN absents du listing des unités

Edition du listing

A l’aide de l’outil Mise à Jour dans SIMS REIN

Nouveaux patients

Identification de la sortie de liste

Préparation de la fiche

GREFFE

DECES

TRANSFERT

Identification du médecin référentet envoi des fiches

SAISIE SIMS REIN

slide63
Contrôle Qualité : Languedoc Roussillon (1)
  • contrôle exhaustif :

à partir de la liste SIMS REIN

vérification exhaustive des 10 items de base

  • contrôle par sondage:

Tirage au sort dans la liste SIMS REIN

Prise en compte de la taille des échantillons.

slide64
Contrôle Qualité : Languedoc Roussillon (2)

Données SIMS REIN

comparées aux données des dossiers patients

Variables quantitatives:

  • Coefficient de correlation intra-classe (ICC).

Variables qualitatives:

  • Coefficient Kappa de Cohen
  • Classification sur l’échelle de Landis et Koch
  • Test de Mac Némar
slide65
SIMS-REIN : Contrôle de qualité

Rubrique Infos/outils

Outils de monitoring

. listes de requêtes ciblées,

. module d’extractions de données,

. suivi des mises à jour annuelles

slide74
2005 : deux objectifs ciblés
  • Stabiliser la cohorte
  • Compléter la montée en charge
  • … et préparer le futur
slide75
SIMS-REIN

Évolutions du SIMS

Décembre 2004

slide76
SIMS – Évolutions

1/ développer les outils de reporting

2/ stabiliser l’entrepôt de données

3/ finaliser le SIGNe : Système d’Information Géographique

4/ développer la modélisation

spatio-temporelle

slide77
clients

universels

données

Datamart REIN

Outils

tableaux

de

bord

Base d’évènements

Base d’identité

Le reporting

VUES

DWH

Analyses

statistiques

SIG

Interface Web

Fonctions métiers

serveur web dynamique

slide78
Identifiabilité

JP Jais, M Ben Saïd, L Le Mignot,

X Ferreira, JP Necker

Être identifiable, être identifié

Créer un site SIMS commun

Mise à disposition des informations

standardiser et automatiser la pr sentation des grands axes d analyse
Standardiser et automatiser la présentation des grands axes d’analyse

Incidence selon l’âge

Pourcentages de cas Taux / 106

slide80
Développer le SIGNeProgramme STIC SANTE INSERM-CNRS

L. Toubiana, J.-B. Richard, P. Landais

Programme de recherche

  • adapter l’approche spatio-temporelle aux besoins d'évaluation et de décision
  • simulations et scénarios d’optimisation du couple demande/offre de soins
slide84
SIMS-REIN

contractualiser

Décembre 2004

slide85
Faire fructifier les partenariats GENNERE

Michel Simonet, Didier Guillon, Paul Landais

Programme GENNERE

  • adapter l’approche SIMS aux besoins d'évaluation et de décision en matière d’IRT pour la Chine, ville de Shanghai
  • généricité du modèle SIMS appliqué à une autre affection chronique : la polyarthrite rhumatoïde
slide86
GENNERE septembre 2004

Contrat Europe – ASIE 2002- 2005

slide87
SIMS-REIN

Communiquer

Décembre 2004

slide89
"l’évaluation des besoins de prise en charge des insuffisants rénaux chroniques au stade terminal : étude de faisabilité de différents scénarios de recueil d’informations pour répondre aux besoins prioritaires de l’Administration de la Santé, des cliniciens et des chercheurs".B. Stengel, P. Landais

Rapport DGS INSERM 1997

slide94
2 février 2002 / 31 / n°4 - pp165-185

B. Kouchner : Insuffisance rénale chronique : vers une politique de santé publique

J. Chanard : L’insuffisance rénale terminale en France

La situation de l’insuffisance rénale chronique en France

P. Landais : Épidémiologie de la demande de soins

P. Landais : Offre de soins et prévention

slide95
Comptes rendus Biologies Académie Sciences 2002ISSN : 1631-06912002 - Volume 325 - Numéro 4 - pp: 515-528

[email protected] : un système d'information multi-sources pour l'insuffisance rénale terminale

Paul Landais, Ana Simonet, Didier Guillon, Christian Jacquelinet, Mohamed Ben Saïd, Claude Mugnier, Michel Simonet.

slide96
E R A - E D T A R e g i s t r y meeting

A Multi-Source Information System for End-Stage Renal disease

D. Guillon & P. Landais for the SIMS-REIN WG

slide97
Stud Health Technol Inform.

2003;95:95-100.

A dynamic Web application within an n-tier architecture:

a Multi-Source Information System for end-stage

renal disease.

Ben Said M, Simonet A, Guillon D, Jacquelinet C, Gaspoz F,

Dufour E, Mugnier C, Jais JP, Simonet M, Landais P.

slide98
Systèmes d'information de santé

(Ingénierie des systèmes d'information-RSTI

série ISI Vol.8 N° 1/2003)

  • Un entrepôt de données pour l’aide à la décision sanitaire
  • en néphrologie
  • Simonet, M. Simonet, F. Gaspoz, M.Ben Saïd, D. Guillon,
  • C. Jacquelinet, C. Mugnier, J-P. Jais, P. Landais
slide99
Workshop on fundamental issues

on geographic and spatial ontologies,

COSIT’03

Conference on Spatial Information Theory

Ittingen, Switzerland 23 sept. 2003.

Ontology and Geographical Information System

for End-Stage Renal Disease: the SIGNe

Michel Simonet,Laurent Toubiana, Ana Simonet, Mohamed Ben Saïd, Paul Landais.

slide100
Medinfo. 2004;2004(CD)

PMID: 15360591 [PubMed - in process]

Avoiding doubles in distributed nominative medical databases: optimization of the needleman and wunsch algorithm.

Mugnier C, Ben Said M, Le Mignot L, Jais J, Le Bihan C, Landais P.

slide101
Journal of Epidemiology

& Community Health

Vol 58 Supplement 1

August 2004

GIS INTEGRATION IN NEPHROLOGY: A SIGNEJ. Richard, L. Toubiana, M. Ben Said, L. Mignot, JP. Jais, C. Mugnier, P. Landais.

RELIABILITY OF PATIENT IDENTIFICATION IN A MULTISOURCE WEB DATABASEL. Le Mignot, C. Mugnier, M. Said, JP. Jais, J. Richard, C. Le Bihan, P. Landais.

MULTI-SOURCES INFORMATION SYSTEM AND

EPIDEMIOLOGICAL FOLLOW UP OF CHRONIC DISEASEM. Ben Said, C. Mugnier, L. Le Mignot, J. Richard, JP. Jais, P. Landais.

slide102
Volume 52 No Hors-série 1

Réseau Epidémiologie et Information en Néphrologie

(REIN). Résultats du contrôle de qualité du réseau REIN

en Languedoc-Roussillon

Duny Y., Landais P., Ben Saïd M., De Cornelissen, F. Marty L., Daurès J.P.

Contrôle d’exhaustivité et de qualité de l’enquête

Épidémiologique REIN dans une des régions de l’étude :

le Limousin

Glaudet F., Aldigier J.C., Lebeau F., Preux P.M., Vergnenegre A.

slide103
Volume 52 No Hors-série 1

Projet SIGNe : Intégration d’un système d’information

géographique pour la néphrologie

Richard J.B., Toubiana L., Ben Said M., Le Mignot L., Jais J.P., Mugnier C., Landais P.

Dédoublonnage d’identité dans des bases web-dynamiques

multi-sources

Le Mignot L., Mugnier C., Ben Said M., Jais J.P., Richard JB., Le Bihan C., Landais P.

Système d’information multi-source et suivi épidémiologique

des maladies chroniques

Ben Saïd M., Mugnier C., Le Mignot L., Richard J.B., Jais J.P., Landais P.

slide104
IDEAS'04-DH Beijing Sept, 1-3 2004

Workshop On Medical Information Systems

The Digital Hospital

Genericity of an Epidemiological Network for Nephrology

and Rheumatology

A Simonet, M Simonet, CG Bassolet, S Ferriol, C. Gueydan, R Patriarche,

HJ Yu, P Hao, Y Liu, W Zhang, N Chen, M Forêt, P Gaudin, M. Ben Saïd, D Guillon,

P Landais.

slide105
SHANGHAI 8-12 novembre 2004

GENNERE: a Generic Epidemiological Network

for Nephrology and Rheumatology

A Simonet, M Simonet, CG Bassolet, S Ferriol, C Gueydan, R Patriarche,

H Yu, P Hao, Y Liu, W Zhang, N Chen, M Forêt, P Gaudin, G De Moor, G Thienpont,

M Ben Saïd, P Landais, D Guillon.

slide106
Geographical Information System

For End‑Stage Renal Disease: SIGNe,

an Aid to Public Health Decision making.

Toubiana L, Richard JB, Landais P.

ad