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Données cliniques

Quand les anomalies constitutionnelles et somatiques s’emmêlent ( del 16p11.2 ; del / dup 18q12.3-q21.1) Laboratoire de génétique chromosomique MARSEILLE Hôpital de la Timone PETIT-PRENANT Ophélie Professeur MONCLA. Données cliniques. Le patient présente : -dysmorphie faciale

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Presentation Transcript

  1. Quand les anomalies constitutionnelles et somatiques s’emmêlent(del 16p11.2 ; del/dup18q12.3-q21.1)Laboratoire de génétique chromosomique MARSEILLE Hôpital de la TimonePETIT-PRENANT OphélieProfesseur MONCLA

  2. Données cliniques • Le patient présente : -dysmorphie faciale -un retard mental sévère : Aucun langage -troubles du comportement :très amical, se tape le thorax lors des émotions -bon niveau de compréhension -trouble de l’équilibre (pas d’épilepsie) • Placé sous tutelle et dans une Maison d’Accueil Spécialisée Caryotype et Puce à ADN

  3. Caryotype Délétion interstitielle 18q12.3-q21.1

  4. Caryotype A priori caryotype normal

  5. Conclusion caryotype • Mosaïcisme : Présence de 2 lignées cellulaires: 25% de cellules délétées 75% de cellules a priori normales

  6. Qu’est ce qu’une ACPA • But: mesurer les déséquilibres génomiques (gain et perte de matériel génétique) • Hybridation compétitive = technique d’hybridation de deux échantillons (chacun avec un fluorochrome différent) sur un nombre variable de sondes • Utilisation de puces de type oligonucléotides 4x180 K (plateau technique Agilent)

  7. Puce à ADN (ACPA)

  8. Conclusion Puce à ADN L’analyse de la puce nous montre : - une délétion en 16p11.2 - une variation à type duplication en mosaïque de la région18q12.3 –q21.1

  9. Vérification des anomalies en FISH • Del en 16p11.2 de 29 560 500 à 30 104 798 (hg18)(550kb) Choix du BAC RP11-74E23 16p11.2 29 500 797 à 29 730 387 • Dup en mosaïque 18q12.3-q21.1 de 40 217 101 à 44 721 415 (hg18)(4,5Mb) Choix de 2 BACs : -RP11-463D1718q23.3 41 216 561 - 41 408 730 SO -RP11-46D118q21.1 44 393 176 - 44 552 924 SG Pour mettre en évidence l’orientation de la duplication

  10. Image délétion 16p11.2

  11. Image Del/Dup BAC RP11-463D17 SO + Centromère 18 SG

  12. Image Del/Dup BAC RP11-46D1 SG + Centromère 18 SO

  13. Image « duplication 18q12.3-q21.1 » des 2 BACs

  14. Duplication inversée

  15. Conclusion FISH • Mosaïcisme de l’anomalie sur le bras long du chromosome 18: Présence de 2 lignées cellulaires : 25 % délétées 75 % dupliquées

  16. Caryotype + Puce + FISH • Pas de lignée cellulaire normale ( ce qui semblait être vu au caryotype : limite du caryotype dû à sa résolution mais nous permet de voir les mécanismes). • Présence d’une DEL / DUP en mosaïque (vu en FISH mais non prévisible avec la Puce, car ce qui semblait être une DUP classique en mosaïque d’une lignée normale et d’une lignée dupliquée était en fait le résultat d’une compression de cellules délétées et de cellules dupliquées. • L’importance d’associer ces 3 techniques.

  17. Conclusion clinique • La DEL du 16p11.2 entraîne un retard dans le développement du langage ce qui est observé chez le patient. • La DEL/DUP implique le gène SETBP1décrit dans la littérature comme étant responsable de retard mental léger et difficultés d’expression sans toucher la compréhension: retrouvé chez le patient. • Les individus atteints par la mutation du gène SETBP1 ont acquis le langage des signes, chez notre patient ceci n’a pas été possible : mauvaise prise en charge et à cela s’ajoute la délétion du 16p11.2

  18. Anomalie hérité ou de novo pour la délétion du 16p11.2 Origine constitutionnelle (accident dans un des 2 gamètes avant la fécondation) • Anomalie DEL/DUP du 18 est issue probablement d’une recombinaison chromatidienne Origine somatique (accident post-zygote)

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