Bartholomew C., Beausoleil R., Bergès N., 2004.

1. Estimation de la réponse corrélée des caractères de croissance lors de sélection des lapins sur la taille de la portée. Utilisation d'une population contrôle cryopréservée et des tendances génétiques. Bartholomew C., Beausoleil R., Bergès N., 2004. Génétique-Biostatistique

2. Introduction • Sélection génétique  prolificité  productivité (lapins, porcs) • Succès de la sélection à long terme sur la taille des portées. Génétique-Biostatistique

3. But de l’étude: montrer si il y a eu des réponses corrélées sur différents caractères de croissance quand l’objet de la sélection était la taille de la portée.(Cf. synthèse de l’article) • Résultats de la littérature variés. Réponse définitive? Génétique-Biostatistique

4. Synthèse de l’article Introduction: • Principales méthodes statistiques = modèles mixtes pour l’analyse des données: • Amélioration de la production du bétail • Prédiction des valeurs de reproduction • Estimation des paramètres et des tendances génétiques. Génétique-Biostatistique

5. Importance des caractères de croissance pour la production de viande de lapin: • Poids au sevrage et à la fin de la période d’engraissement • GQM en post-sevrage • Prise de nourriture • Index de conversion (aliments poids vif) Génétique-Biostatistique

6. Deux approches expérimentales possibles: • Comparer la dernière génération avec une génération préalablement cryoconservée, • Appliquer les modèles mixtes pour calculer les tendances génétiques. Génétique-Biostatistique

7. Les animaux: • La lignée V : lignée maternelle sélectionnée durant 21 générations en fonction du nombre de jeunes par portée, selon la procédure BLUP utilisant un modèle animal répétable. • Les jeunes: sevrés à 28 jours; engraissement 5 semaines (nourriture commerciale ad libitum: 16% PB, 15.5% FB, 3.4% EE). Génétique-Biostatistique

8. Le groupe contrôle (GC): descendance de 73 femelles et 31 mâles provenant de la génération 15 (cryoconservée). • Le groupe sélectionné (GS): jeunes de la génération 21 (actuelle) et contemporains du GC. • Total: 1854 lapins (cages de 7 à 9 lapins). Génétique-Biostatistique

9. Données récoltées: • Poids individuel au sevrage (28 j): WW (g) • Poids individuel en fin d’engraissement (63j): WS (g) Génétique-Biostatistique

10. GQM individuel durant l’engraissement: DG (g/j) • Consommation journalière entre sevrage et abattage: FC (g) • Index de conversion alimentation poids vif pendant l’engraissement: IC(g/g) (Les 2 derniers points ont été récoltés sous forme de moyenne pour chaque cage.) Génétique-Biostatistique

11. Traitement des données: • Le modèle prends en compte: • La proportion d’animaux en cage pour chaque effet fixe et aléatoire • La moyenne des covariables • Les données ont été analysées suivant un modèle mixte où tous les caractères ont les mêmes effets fixes et aléatoires, et selon la covariable de la taille totale de la portée à la naissance. Génétique-Biostatistique

12. Méthode de calcul: algorithme REML • Modèle animal bivariable: • Caractères de croissance • Taille de la portée au sevrage Génétique-Biostatistique

13. Le modèle mixte utilisé pour les caractères de croissance est: yijklmn = µ+b*LS+Ysi+POj+ak+pl+cm+eijklmn • Le modèle mixte utilisé pour la taille de la portée au sevrage est: yijkl = µ+YSRi+RSj+ak+pk+eijkl Génétique-Biostatistique

14. La lignée V ayant été sélectionnée selon la taille de la portée, cette covariable a été incluse dans le modèle . Cela permet de distinguer: • les différences entre groupes dues aux différences de taille de portée • les différences dues à d’autres causes. Génétique-Biostatistique

15. Génétique-Biostatistique

16. Résultats: • Primiparité: effet négatif sur les caractères de croissance (autres auteurs: idem) • Covariable taille de portée à la naissance: effet négatif significatif, sauf pour l’IC. • Après comparaison avec le groupe contrôle: modifications des caractères de croissance strictement dues à la modification de la taille de la portée. Génétique-Biostatistique

17. L’effet taille de la portée diminue avec le temps valeurs plus élevées au sevrage qu’à l’abattage. • Corrélation non-additive permanente: significative (négative) pour le poids au sevrage ;  0 pour le poids à l’abattage. • En terme de tendances génétiques: réponses corrélées significatives pour le poids au sevrage et le GQM; pour le poids à l’abattage: non significative. Génétique-Biostatistique

18. Poids à l’abattage = poids au sevrage + [GQM * 35j (post-sevrage)] ; or Tendance génétique (TG)  TG (poids au sevrage) + 35 * TG (gain post-sevrage)  contradiction ? Prévisible car: • Chiffres très petits • estimations actuelles des corrélations génétiques très petites Génétique-Biostatistique

19. Résultats de l’article: Pas de réponse corrélée des caractères de croissance par rapport à une population contrôle • Rochambeau et al. (1994): sélection pour la taille de la portée  poids individuel au sevrage  mais poids total de la portée au sevrage .  Objectifs de sélection des lignées maternelles. Génétique-Biostatistique

20. Discussion: • Intérêt limité d’une sélection unique sur la taille de la portée. • Méthodologie? • Effets de la cryopréservation connus lors de l’expérience? Génétique-Biostatistique