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ANALISIS DE SECUENCIA GB1

ANALISIS DE SECUENCIA

Miriam20
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Presentation Transcript

  1. 1 UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA ESCUELA PROFESIONAL DE INGENIERÍA AMBIENTAL TRABAJO PRÁCTICO “IDENTIFICACIÓN DE ESPECIES SEGÚN SU SECUENCIA DE ADN ” DOCENTE: Blgo. Soto Gonzales, Hebert Hernan CURSO: BIOTECNOLOGÍA CICLO: VII PRESENTADO POR: Arocutipa Ticona, Miriam Elizabeth Mamani Alvarez, Olenka Fiorella Sosa Pino, Flavia Andreina Tavara Lira, Mayra Geraldine 19 de Mayo del 2023 ILO - MOQUEGUA

  2. ANALISIS DE SECUENCIA RAR G1 SECUENCIA CALIDAD Explicacion: ITEM % IDENTIFICACION (BLAST) Al abrir cada secuencia en el block de notas se observa la calidad, si el archivo contiene muchas “N” se considera que es de mala calidad, ya que eso representa vacíos. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 E09_5_09 E10_13_10 F07_6H_11 F09_6_11 F10_14_12 G07_7H_13 G09_7_13 G10_15_14 H07_8H_15 H09_8_15 H10_16_16 Mala Mala Regular Regular Mala Regular Buena Regular Mala Mala Regular 89 - 96 83 - 92 - 96 - - 84 Klebsiella pneumoniae negativo Enterobacter ludwigii Klebsiella sp. negativo Kosakonia oryzae negativo Enterobacter cloacae negativo negativo Enterobacter sp. Bacteria - Enterobacteria Enterobacteria - Enterobacteria - Enterobacteria - - Enterobacteria

  3. ANALISIS DE SECUENCIA RAR G2 CALIDAD mala mala mala mala mala mala mala ITEM 2 3 4 7 9 10 13 SECUENCIA C07_3H_05 C08_11H-06 C_09_3_05 D07_4H_07 D09_4_07 D10_12_08 E09_5_09 % 23 23 30 29 25 53 51 Identificacion(Blastn) Bacteria Bacteria Bacteria Bacteria Bacteria Bacteria Bacteria NOTA: Como se puede observar la secuencia del numero 1,5,6,8,11,12 no se encontro

  4. ANALISIS DE SECUENCIA RAR G3 CALIDAD Buena Mala Mala 76.7 Buena Buena Mala Mala Buena Mala Buena 79.3 Buena 83.9 Buena Mala ITEM 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 SECUENCIA user_12set2007_01 user_12set2007_02 user_12set2007_03 user_12set2007_04 user_12set2007_05 user_12set2007_06 user_12set2007_07 user_12set2007_08 user_12set2007_09 user_12set2007_10 user_12set2007_11 user_12set2007_12 user_12set2007_13 % 83 - IDENTIFICACION (BLAST) Enterobacter sp No se encontro Klebsiella variicola Kosakonia radicincitans Bacteria No se encontro No se encontro No se encontro No se encontro Achromobacter kerstersii b-proteobacteria Enterobacteriaceae no cultivadaBacteria No se encontro No se encontro NOTA: Según el cuadro se puede observar que no se encontraron resultados en el ITEM 2, 6, 7, 8, 9, 12 y 13. Enterobacteria - Enterobacteria Enterobacteria Bacteria - - - - 84 88 - - - - - - - -

  5. ANALISIS DE SECUENCIA RAR G4 CALIDAD regular buena mala buena regular regular buena buena buena mala mala buena regular regular buena ITEM 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 SECUENCIA % IDENTIFICACION (BLAST) Klebsiella pneumoniae Enterobacter sp. Klebsiella oxytoca Enterobacter sp. Negativo Klebsiella variicola Klebsiella sp. Klebsiella pneumoniae Klebsiella pneumoniae endosymbiont of Sphenophorus Uncultured bacterium Klebsiella sp. Enterobacter sp. Enterobacter hormaechei Bacillus thuringiensis NOTA: Como se puede observar el único ITEM no encontrado es el 5. USER_04set2007_06-526Y1_F01_11 USER_04set2007_07-419Y1_G01_13 USER_04set2007_08-375H_H01_15 USER_04set2007_09-419YZ_A02_02 USER_04set2007_01-419NZ_A01_01 USER_04set2007_02-526NZ_B01_03 USER_04set2007_03-419AZ_C01_05 USER_04set2007_04-88NZ_D01_07 USER_04set2007_05-88AZ_E01_09 USER_04set2007_10-88H_B02_04 USER_04set2007_11-375NZ_C02_06 USER_04set2007_12-526YZ_D02_08 USER_04set2007_13-483NZ_E02_10 USER_04set2007_14-483H_F02_12 USER_04set2007_15-456NZ_G02_14 95.81 98.61 73.75 95.81 - 86.71 97.35 94.39 93.25 72.46 75.43 95.25 88.89 88.47 91.54

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