80 likes | 275 Views
דנ"א רקומביננטי בחקר חלבון ממברנלי- NhaA. נסיון מס' 4: למוד מבנה האוליגומר אסף בהט assafbahat@yahoo.com עדי אוגד adi_oged@yahoo.com. kDa. control. BMH. p-PDM. o-PDM. 62. דימר. 47.5. 32.5. מונומר. 25. 10.16 Å. 16.5. 11.13Å. 9.39Å.
E N D
דנ"א רקומביננטי בחקר חלבון ממברנלי- NhaA נסיון מס' 4:למוד מבנה האוליגומר אסף בהט assafbahat@yahoo.com עדי אוגד adi_oged@yahoo.com
kDa control BMH p-PDM o-PDM 62 דימר 47.5 32.5 מונומר 25 10.16Å 16.5 11.13Å 9.39Å שימוש ב-cross linkers לבדיקת מצב האוליגומריזציה
מסקנות לגבי מצב האוליגומריזציה: • הוספת כל אחד מהמגשרים גרמה לעליה בכמות החלבון הדימרי לעומת המונומרי. • העליה תלויה חיובית באורך המגשר – p-PDM, המגשר הארוך ביותר, גרם לדימריזציה הרבה ביותר.
kDa V254C H225C - - + + MTSET 62 47.5 32.5 25 16.5 גילוי שיירים חשופים למדיום:פלורסנציה
kDa V254C H225C - - MTSET + + 62 47.5 32.5 25 16.5 גילוי שיירים חשופים למדיום:צביעת coomassie
מסקנות לגבי מיקום השיירים: • הסימון של המוטנט V254C ע"י NEM פלורסנטי לא ירד כתוצאה מחשיפה מוקדמת ל- MTSET (ההבדל בפלורסנציה נובע מההבדל בכמות החלבון), כלומר שייר זה אינו פונה לפריפלסמה. • רמת הפלורסנציה של המוטנט H225C יורדת באופן ברור כתוצאה מחשיפה ל- MTSET, כלומר שייר זה נמצא ב- loop פריפלסמטי.
מסקנות לגבי הפעילות לאחר טיפול ב-p-PDM: • פעילות המשחלף עולה עם עליית ה- pH. • הטיפול ב- p-PDM מגביר את פעילות המשחלף ב- pH 7 ו- 7.5, ולא גורם להבדל ב- pH 8. • סביר שהגברת הדימריזציה משפרת את הפעילות, ואפשרי שירידת החומציות מעודדת דימריזציה ולכן ב- pH הגבוהה לא היתה השפעה ל- p-PDM.