90 likes | 221 Views
Cystická fibrosa. Cystická fibrosa. dědičné-autosomálně recesivní (AR) onemocnění závažná a chronicky progredující choroba střední délka života 36,8 let. Multiorgánové postižení: Dýchací cesty : h ustý hlen vede k obstrukci dýchacích cest infekce a sekundární zánětlivý proces
E N D
Cystickáfibrosa • dědičné-autosomálně recesivní (AR) onemocnění • závažná a chronicky progredující choroba • střední délka života 36,8 let • Multiorgánovépostižení: • Dýchací cesty:hustý hlen vede k obstrukci dýchacích cest • infekce a sekundární zánětlivý proces • progresivní destrukce plic. • Pankreas: pankreatickáinsuficience • tuková a proteinová malabsorpci • Játra: jaterní léze, fokální biliární cirhóza • Intestinum: obstrukce střeva,Meconiový illeus(15-20%dětí) • Reprodukční trakt: absence vas deferens, infertilita (95% mužů) • - Kůže: malfunkce potních žláz, zvýšený obsah soli v potu
Cl- TM1 TM2 NBD1 NBD2 R Příčinacystickéfibrosy -mutace v genu CFTR - CFTR kóduje chloridový kanál: cystic fibrosis transmembrane conductance regulator – transport Cl- přes plasmatickou membránu epiteliáních buněk výstelky dýchacích cest a jiných žláz - cAMP regulovaný chloridový kanál TM- transmembránové domény lumen cytoplasma NBD-nucleotid vázající domény (ATP) R-regulační doména (cAMPdep.)
MutaceCFTRgenu • mutace jsou germinální (ve všech buňkách jedince) • somatické nebyly dosud popsány • ancestrální povaha mutací přenášeny z generace na generaci • mutace de novo – velmi vzácně • distribuce mutací je populačně specifická
…E N I I F G V S Y D… …..GAA AAT ATC ATC TTT GGT GTT TCC TAT GAT…. …..GAA AAT ATC ATT GGT GTT TCC TAT GAT…. …E N I I G V S Y D… Cl- TM1 TM2 NBD1 NBD2 R F508del • nejčastější mutace v české populaci ~70% • delece tří bází v exonu 10 • výpadek methioninu 508 v proteinu
N VyšetřenímutaceF508del • Obecný primer (C) Normal specific primer(N) Mutation specific primer(M) TARGET SEQUENCE C M
O/N O/M O/N O/M O/N O/M 1 2 1 2 1 2 Homozygot bez mutace Heterozygot přenašeč Homozygot s mutací VyšetřenímutaceF508del PCR reakce probíhá ve dvou zkumavkách: PCRMix 0obsahuje primer obecnýa „normální“ PCRMix 1 obsahuje primer obecný a „mutovaný“
Pacient 1 2 3 DNA marker NK + + + P C R M i x 0 STS gen (P3,4) – kontrola průběhu PCR CFTR gen (P0,2) – obecný primer – primer specifický na sekvenci bez mutace + - + STS gen(P3,4) –kontrola průběhu PCR CFTR gen(P1,2) –obecný primer – primer specifický na sekvenci s mutací P C R M i x 1 VyšetřenímutaceF508del
PCRprotokol-vyšetření mutaceΔF508 Detekce mutacezpůsobující cystickou fibrózu v CFTR genupomocí sekvenčně specifických primerů PCR Mix 0 / Mix 1: • Voda 8,5µl • Pufr 2,0µl • dNTP mix 4,0µl • Mg2+ (MgCl2) 2,0µl • Primery M0 / M1 1,2µl • DNA 2,0µl • Taq polymeráza 0,4 µl (na ledu)