Bioinform tica
Download
1 / 22

Bioinformática - PowerPoint PPT Presentation


  • 168 Views
  • Uploaded on

Bioinformática. Introducción. Bioinformática Definición intuitiva. Conjunto de herramientas informática s que sugieren soluciones a problemas bio lógicos. Bioinformática Definiciones oficiales NIH.

loader
I am the owner, or an agent authorized to act on behalf of the owner, of the copyrighted work described.
capcha
Download Presentation

PowerPoint Slideshow about ' Bioinformática' - regis


An Image/Link below is provided (as is) to download presentation

Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author.While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server.


- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E N D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Presentation Transcript
Bioinform tica

Bioinformática

Introducción


Bioinform tica definici n intuitiva

BioinformáticaDefinición intuitiva

Conjunto de herramientas informáticas que sugieren soluciones a problemas biológicos


Bioinform tica definiciones oficiales nih
BioinformáticaDefiniciones oficiales NIH

Bioinformatics -Research, development, or application of computational tools and approaches for expanding the use of biological, medical, behavioral or health data, including those to acquire store, organize, archive, analyze, or visualize such data.

Computational Biology - The development and application of data-analytical and theoretical methods, mathematical modeling and computational simulation techniques to the study of biological behavioral, and social systems.


Bioinform tica por que tan popular

BioinformáticaPor que tan popular?

Los experimentos actuales son imposibles de analizar sin la ayuda de poderosas herramientas informáticas


Los experimentos actuales son imposibles de analizar sin la ayuda de poderosas herramientas informáticas


OBTENCIÓN DE DATOS ayuda de poderosas herramientas informáticas

OBTENCIÓN DE INFORMACIÓN

DATOS

INFORMACIÓN


...AGGATTACCGAGGATTACCATTATCTAGTTGACGCGAG ayuda de poderosas herramientas informáticas

TAGCTATCGGGTTACCGTGTTGATACCGAGGATTACCG....

E. Coli: 4x106 bp = 2.6x109 D

Human: 3x109 bp = 2.0x1012 D


Bioinform tica1
Bioinformática ayuda de poderosas herramientas informáticas

  • Biología de sistemas

  • Bioinformática estructural

  • Análisis de perfiles de expresión en experimentos genómicos / proteómicos.

  • Análisis y manipulación de secuencias de DNA o proteína,...

  • Minería de datos


Biolog a de sistemas
Biología de sistemas ayuda de poderosas herramientas informáticas

  • Predicción y manipulación de redes metabólicas

  • Construcción de la célula virtual

  • Definición dinámica del metaboloma

  • Localización de puntos de control.


Bioinform tica estructural
Bioinformática estructural ayuda de poderosas herramientas informáticas

  • Explotación de la información estructural

  • Caracterización del reconocimiento estructural

  • Asignación de función

  • Predicción alta/baja resolución de estructura de macromoléculas

  • Modelización microscópica de la acción de las macromoléculas


An lisis perfiles expresi n
Análisis perfiles expresión ayuda de poderosas herramientas informáticas

  • Diseño de chips y arrays de DNA / Proteínas.

  • Seguimiento de los chips

  • Procesado de los experimentos

    • Eliminación de ruido

    • Clusterización de los datos

    • Formulación de hipótesis

    • Diseño de experimentos complementarios


An lisis de secuencias
Análisis de secuencias ayuda de poderosas herramientas informáticas

  • Determinación de genes y lugares de Splicing

  • Anotación del genoma

  • Búsqueda de relaciones evolutivas

  • Asignación de elementos funcionales.


Miner a de datos
Minería de datos ayuda de poderosas herramientas informáticas

  • Eliminar el ruido en procesado de experimentos

  • Busqueda automática de bibliografía

  • Reconstrucción de redes metabólicas.


Bioinform tica objetivos

Bioinformática ayuda de poderosas herramientas informáticasObjetivos

Familiarizarse con las herramientas básicas de la bioinformática


Bioinform tica 1
Bioinformática (1) ayuda de poderosas herramientas informáticas

  • Bases de datos de interés en Bioinformática

  • Servidores de referencia

  • Manipulación básica de secuencias

    • Búsqueda de homólogos

    • Obtención de información elemental macroscópica derivada de secuencia

    • Determinación de motivos de secuencia especiales.


Bioinform tica 2
Bioinformática (2) ayuda de poderosas herramientas informáticas

  • Determinación de parámetros estructurales

    • Predicciones de elementos de estructura secundaria.

    • Diseño por homología

    • Threading

    • Otras aproximaciones


Bioinform tica 3 joaquin dopazo cnio
Bioinformática (3) ayuda de poderosas herramientas informáticasJoaquin Dopazo CNIO

  • Análisis de chips de DNA

    • Construcción de chips

    • Análisis de perfiles de expresión


Bioinform tica 4 roderic guigo upf
Bioinformática (4) ayuda de poderosas herramientas informáticasRoderic Guigo (UPF)

  • Análisis génico

    • Localización de genes

    • Determinación de sitios de splicing alternativo


Bioinform tica 5 alfonso valencia cnb
Bioinformática (5) ayuda de poderosas herramientas informáticasAlfonso Valencia (CNB)

  • Minería de datos


Procesado de la informaci n

IDENTIFICACIÓN GENES ayuda de poderosas herramientas informáticas

ATTW...PGL

CC...TWP

AGG....FVG

PREDICCIÓN ESTRUCTURA Y FUNCIÓN

Procesado de la información

...CTTAGC........CAGGC.......CCTTAACG..........


Flujo de información ayuda de poderosas herramientas informáticas

Sec. Proteína

Secuencia Genómica

cDNA...

Nueva Secuencia

¿Sabemos qué es?

¿Se parece a otras?

¿Podemos “Copiar” estructura? Función? Propiedades?


Búsqueda homólogos ayuda de poderosas herramientas informáticas

Bases de datos

Información básica

Modelización estructural

Esquema Sesiones 1-2


ad