Bioinform tica
Sponsored Links
This presentation is the property of its rightful owner.
1 / 22

Bioinformática PowerPoint PPT Presentation


  • 142 Views
  • Uploaded on
  • Presentation posted in: General

Bioinformática. Introducción. Bioinformática Definición intuitiva. Conjunto de herramientas informática s que sugieren soluciones a problemas bio lógicos. Bioinformática Definiciones oficiales NIH.

Download Presentation

Bioinformática

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation

Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author.While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server.


- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E N D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Presentation Transcript


Bioinformática

Introducción


BioinformáticaDefinición intuitiva

Conjunto de herramientas informáticas que sugieren soluciones a problemas biológicos


BioinformáticaDefiniciones oficiales NIH

Bioinformatics -Research, development, or application of computational tools and approaches for expanding the use of biological, medical, behavioral or health data, including those to acquire store, organize, archive, analyze, or visualize such data.

Computational Biology - The development and application of data-analytical and theoretical methods, mathematical modeling and computational simulation techniques to the study of biological behavioral, and social systems.


BioinformáticaPor que tan popular?

Los experimentos actuales son imposibles de analizar sin la ayuda de poderosas herramientas informáticas


Los experimentos actuales son imposibles de analizar sin la ayuda de poderosas herramientas informáticas


OBTENCIÓN DE DATOS

OBTENCIÓN DE INFORMACIÓN

DATOS

INFORMACIÓN


...AGGATTACCGAGGATTACCATTATCTAGTTGACGCGAG

TAGCTATCGGGTTACCGTGTTGATACCGAGGATTACCG....

E. Coli: 4x106 bp = 2.6x109 D

Human: 3x109 bp = 2.0x1012 D


Bioinformática

  • Biología de sistemas

  • Bioinformática estructural

  • Análisis de perfiles de expresión en experimentos genómicos / proteómicos.

  • Análisis y manipulación de secuencias de DNA o proteína,...

  • Minería de datos


Biología de sistemas

  • Predicción y manipulación de redes metabólicas

  • Construcción de la célula virtual

  • Definición dinámica del metaboloma

  • Localización de puntos de control.


Bioinformática estructural

  • Explotación de la información estructural

  • Caracterización del reconocimiento estructural

  • Asignación de función

  • Predicción alta/baja resolución de estructura de macromoléculas

  • Modelización microscópica de la acción de las macromoléculas


Análisis perfiles expresión

  • Diseño de chips y arrays de DNA / Proteínas.

  • Seguimiento de los chips

  • Procesado de los experimentos

    • Eliminación de ruido

    • Clusterización de los datos

    • Formulación de hipótesis

    • Diseño de experimentos complementarios


Análisis de secuencias

  • Determinación de genes y lugares de Splicing

  • Anotación del genoma

  • Búsqueda de relaciones evolutivas

  • Asignación de elementos funcionales.


Minería de datos

  • Eliminar el ruido en procesado de experimentos

  • Busqueda automática de bibliografía

  • Reconstrucción de redes metabólicas.


BioinformáticaObjetivos

Familiarizarse con las herramientas básicas de la bioinformática


Bioinformática (1)

  • Bases de datos de interés en Bioinformática

  • Servidores de referencia

  • Manipulación básica de secuencias

    • Búsqueda de homólogos

    • Obtención de información elemental macroscópica derivada de secuencia

    • Determinación de motivos de secuencia especiales.


Bioinformática (2)

  • Determinación de parámetros estructurales

    • Predicciones de elementos de estructura secundaria.

    • Diseño por homología

    • Threading

    • Otras aproximaciones


Bioinformática (3)Joaquin Dopazo CNIO

  • Análisis de chips de DNA

    • Construcción de chips

    • Análisis de perfiles de expresión


Bioinformática (4)Roderic Guigo (UPF)

  • Análisis génico

    • Localización de genes

    • Determinación de sitios de splicing alternativo


Bioinformática (5)Alfonso Valencia (CNB)

  • Minería de datos


IDENTIFICACIÓN GENES

ATTW...PGL

CC...TWP

AGG....FVG

PREDICCIÓN ESTRUCTURA Y FUNCIÓN

Procesado de la información

...CTTAGC........CAGGC.......CCTTAACG..........


Flujo de información

Sec. Proteína

Secuencia Genómica

cDNA...

Nueva Secuencia

¿Sabemos qué es?

¿Se parece a otras?

¿Podemos “Copiar” estructura? Función? Propiedades?


Búsqueda homólogos

Bases de datos

Información básica

Modelización estructural

Esquema Sesiones 1-2


  • Login