1 / 9

Убрзавање алгоритама базираних на Gross Pitaevskii једначини (домен реалних бројева)

Убрзавање алгоритама базираних на Gross Pitaevskii једначини (домен реалних бројева). Саша Стојановић Вељко Милутиновић stojsasa@etf.bg.ac.rs vm@etf.bg.ac.rs. Дио кода који треба убрзати. for( cnti = 0; cnti < Nrun ; cnti ++) { calcnu (psi); calclux (psi, cbeta );

nevaeh
Download Presentation

Убрзавање алгоритама базираних на Gross Pitaevskii једначини (домен реалних бројева)

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Убрзавање алгоритама базираних наGross Pitaevskiiједначини(домен реалних бројева) Саша СтојановићВељко Милутиновић stojsasa@etf.bg.ac.rsvm@etf.bg.ac.rs

  2. Дио кода који треба убрзати for(cnti = 0; cnti < Nrun; cnti ++) { calcnu(psi); calclux(psi, cbeta); calcluy(psi, cbeta); calcluz(psi, cbeta); calcnorm(&norm, psi, tmpxi, tmpyi, tmpzi); }

  3. Функција calcnu void calcnu(double ***psi) { long cnti, cntj, cntk; double psi2, psi2lin, tmp; for(cnti = 0; cnti < Nx; cnti ++) { for(cntj = 0; cntj < Ny; cntj ++) { for(cntk = 0; cntk < Nz; cntk ++) { psi2 = psi[cnti][cntj][cntk] * psi[cnti][cntj][cntk]; psi2lin = psi2 * Nlin; tmp = dt * (pot[cnti][cntj][cntk] +psi2lin); psi[cnti][cntj][cntk] *= exp(- tmp); } } } return; }

  4. Функција calclux (calcluyи calcluz су сличне) void calclux(double ***psi, double *cbeta) { long cnti, cntj, cntk; double c; for(cntj = 0; cntj < Ny; cntj ++) { for(cntk = 0; cntk < Nz; cntk ++) { cbeta[Nx - 2] = psi[Nx - 1][cntj][cntk]; for (cnti = Nx - 2; cnti > 0; cnti --) { c = - Ax * psi[cnti + 1][cntj][cntk] + Ax0r * psi[cnti][cntj][cntk] – Ax * psi[cnti - 1][cntj][cntk]; cbeta[cnti - 1] = cgammax[cnti] *(Ax * cbeta[cnti] - c); } psi[0][cntj][cntk] = 0.; for (cnti = 0; cnti < Nx - 2; cnti ++) { psi[cnti + 1][cntj][cntk] = calphax[cnti] * psi[cnti][cntj][cntk] + cbeta[cnti]; } psi[Nx - 1][cntj][cntk] = 0.; } } return; }

  5. Проблем приступа подацима Смјер податакау меморији calclux calcluy calcluz Редослијед приступа унутар bursta читање читање упис упис читање упис

  6. Редослијед обраде података PSI[0] PSI[1] … PSI[N-3] PSI[N-2] PSI[N-1] OP OP … OP OP cbeta[0] cbeta[1] cbeta[N-3] cbeta[N-2] … 0 OP’ OP’ … OP’ OP’ 0 PSI[0] PSI[1] PSI[2] … PSI[N-3] PSI[N-2] PSI[N-1]

  7. Проблем искоришћености пајплајна 0 0 X[0,0] X[0,1] [0,0] [7,0] [6,0] [5,0] [4,0] [3,0] [2,0] [1,0] [0,0] [0,1][7,0] [6,0] [5,0] [4,0] [3,0] [2,0] [1,0] R[0,0] R[0,0] R[0,0]

  8. Проблем приступа подацима Смјерприступа подацима у меморији calclux calcluy calcluz Редослијед приступа унутар bursta … … …

  9. Функција calcnorm void calcnorm(double *norm, double ***psi, double *tmpx, double *tmpy, double *tmpz) { long cnti, cntj, cntk; for(cnti = 0; cnti < Nx; cnti ++) { for(cntj = 0; cntj < Ny; cntj ++) { for(cntk = 0; cntk < Nz; cntk ++) { tmpz[cntk] = psi[cnti][cntj][cntk] * psi[cnti][cntj][cntk]; } tmpy[cntj] = simpint(dz, tmpz, Nz); } tmpx[cnti] = simpint(dy, tmpy, Ny); } *norm = sqrt(simpint(dx, tmpx, Nx)); for(cnti = 0; cnti < Nx; cnti ++) { for(cntj = 0; cntj < Ny; cntj ++) { for(cntk = 0; cntk < Nz; cntk ++) { psi[cnti][cntj][cntk] /= *norm; } } } return;}

More Related