Kullan ıcı Pratik Eğitimi

1. Kullanıcı Pratik Eğitimi

2. Kullanıcı Arayüzüne Erişim • Kullanıcı arayüzüne ssh ile bağlanın • ssh –l egitim(1-20) somon.ulakbim.gov.tr • .globus dizininin varlığını kontrol edin • ls –laR .globus • .globus: • total 16 • drwxr-xr-x 2 root root 4096 Aug 15 13:57 . • drwx------ 31 root root 4096 Feb 10 15:32 .. • -rw-r--r-- 1 root root 0 Mar 14 2006 usercert.pem • -rw-r--r-- 1 root root 1322 Mar 14 2006 usercert_request.pem • -rw------- 1 root root 963 Mar 14 2006 userkey.pem • Pratik eğitim için gerekli örnek dosyaları kullanıcı dizininize açın: • cd ~ • tar zxvf /home/egitim.tar.gz

3. Çalışabileceğiniz Kaynakları Görüntülemek • Herhangi bir sanal organizasyon için o an geçerli çalışabileceğiniz kaynakları görüntülemek için: • lcg-infosites –vo <VO> • komutunu kullanabilirsiniz. • sgdemo sanal organizasyonunda çalışılabilecek işlemcileri görmek için: • lcg-infosites –vo sgdemo ce • sgdemo sanal organizasyonunda veri saklama alanını görmek için: • lcg-infosites –vo sgdemo se • Sorgulanabilecek diğer özellikleri görmek için: • Lcg-infosites –list-attrs

4. Kullanıcı Sertifikanız • Bir X.509 sertifikası şu bilgileri içerir: • Kullanıcı açık anahtarı; • Kullanıcı hakkında bilgi; • Sertifika otoritesi bilgisi; • Geçerlilik süresi; • Sertifika otoritesinin imzası • Sertifikanızı incelemek için: openssl x509 –in usercert.pem –text veya grid-cert-info Açık Anahtar Subject: C=TR, O=TRGrid, OU=TUBITAK-ULAKBIM, CN=Onur Temizsoylu Issuer: C=TR, O=TRGrid, CN=TR-Grid CA • Validity • Not Before: Feb 5 10:05:58 2007 GMT • Not After : Feb 5 10:05:58 2008 GMT Sertifika Otoritesi İmzası

5. Globus Grid Security Infrastructure (GSI) • GSI PKI kullanarak ortakatman yazılımları için bir güvenlik standardı oluşturur. • Önemli bazı özellikler getirir: • “Single sign-on”: Her seferinde şifre girmek gerekmez. • Atama: Servisler kullanıcı adına çalışabilir. • Proxy sertifikaları sayesinde çalışırlar.

6. GSI Çevre Değişkenleri • Kullanıcı Sertifikaları: • Açık Anahtar: X509_USER_CERT ($HOME/.globus/usercert.pem) • ÖzelAnahtar: X509_USER_KEY ($HOME/.globus/userkey.pem) • Proxy: X509_USER_PROXY (/tmp/x509up_u<id>) • Sunucu Sertifikaları: • Açık Anahtar: X509_USER_CERT (/etc/grid-security/hostcert.pem) • Özel Anahtar: X509_USER_KEY (/etc/grid-security/hostkey.pem) • Sertifika Otoriteleri: • X509_CERT_DIR (/etc/grid-security/certificates)

7. Proxy Oluşturmak • Çalışmak için proxy oluşturun: • voms-proxy-init --voms sgdemo • Oluşturduğunuz proxy hakkında bilgi edinin • voms-proxy-info -all • Oluşturduğunuz proxy’i yok edin • voms-proxy-destroy

8. İşinizi Çalıştırmadan Önce • Bilmeniz gerekenler: • Hangi programlar gönderilecek? • Hangi veriye erişilecek, veri program ile birlikte mi gidecek? • Herhangi bir işletim sistemi, kütüphane bağımlılığı var mı? • Gönderdiğiniz uygulama: • Bilinmeyen bir sistemde çalışabilmeli • Çalışma dizini dışında yer alacak şekilde sabit olarak belirlenmiş dizinler ve dosyalar içermemelidir.

9. Grid Dünyasının Dili - JDL • Job Description Language (JDL) • Condor ClassAd dili standardında geliştirilmiştir • Bir JDL dosyası niteliklerle oluşturulur: • <nitelik> = <anahtar>; • # ile JDL içine açıklama satırları yazılabilir. • Nitelikler temel olarak ikiye ayrılabilir: • İş nitelikleri, işin kendini tanımlar • Kaynak nitelikleri, işe uygun kaynakların bulunmasını sağlar.

10. JDL Dosyası • Bir JDL dosyası en azından aşağıdaki nitelikleri içerir: • Çalışacak uygulamanın adı • İşin standart çıktısının ve hatasının yazılacağı dosyaları • Gerekli ise iş için gerekli argümanları • Girdi ve çıktı torbalarında yer alacak dosyaları • ornek1.jdl • Executable = “ls”; • StdError = “stderr.log”; • StdOutput = “stdout.log”; • Arguments = “-al”; • OutputSandbox = {“stderr.log”, “stdout.log”};

11. JDL Nitelikleri • JobTypeNormal (basit, seri iş), Interactive, MPICH, Checkpointable • Executable – Çalıştırılacak komut • Arguments – Komuta verilecek argümanlar • StdInput, StdOutput, StdError – Standart girdi, çıktı ve hata dosyaları • Environment – Çevre değişkenleri • InputSandbox– Kullanıcı arayüzünden çalışacağı siteye gönderilecek dosyalar • OutputSandbox– İş bitiminde alınacak dosyalar • Requirements– Gerekli kaynak nitelikleri • Rank– Bulunan kaynakların sıralanması

12. JDL Dosyası • ornek2.jdl • [ • Executable = "/bin/sh"; • Arguments = "HelloWorld.sh"; • Stdoutput = "stdoutput"; • StdError = "stderror"; • InputSandbox = {"HelloWorld.c","HelloWorld.sh"}; • OutputSandbox = {"stdoutput","stderror"}; • Requirements = (other. GlueHostOperatingSystemName == “linux") && (other.GlueCEPolicyMaxWallClockTime > 10000); • Rank = other.GlueCEStateFreeCPUs; • ]

13. Bir İşin Hayat Hikayesi Girditorbası Veri Bilgisi UI JDL Çıktı torbası Expanded JDL İş Gönderme İş Sorgulama İş Durumu SE Globus RSL İş Durumu İş Durumu WMS (RB) LFC voms-proxy-init SE & CE Bilgisi Çıktı Torbası VOMS BDII Girdi torbası + Planlama Bilgisi İş Gönderme Servisi CE LB

14. İşi göndermeden önce • JDL dosyasında yer alan niteliklere göre işin çalışabileceği • siteleri görebilirsiniz. • glite-job-list-match<job.jdl> • İşinizin belli bir sitede çalışması için Requirement satırı • ekliyebilirsiniz. • Requirements = other.GlueCEUniqueID == • "ce.ulakbim.gov.tr:2119/jobmanager-lcgpbs-sgdemo";

15. İş Göndermek • glite-job-submit [-vo <VO>] [-o <dosya_ismi>]<job.jdl> • -vo Sanal organizasyon, proxy oluşturulurken tanımlandı ise gerek yoktur • -o Oluşacak JobID bu dosyaya yazılır • glite-job-status –i<dosya_ismi> (veya jobId) • -i İş gönderilirken verilen dosya ismi burada kullanılabilir

16. İş Göndermek glite-job-submit testJob.jdl **** Warning: UI_VOMS_OVERRIDE **** The Virtual Organisation name "dteam" you have specified with the UI conf file will be overriden by the default VO in your proxy credentials: "sgdemo" Selected Virtual Organisation name (from proxy certificate extension): sgdemo Connecting to host wms.ulakbim.gov.tr, port 7772 Logging to host wms.ulakbim.gov.tr, port 9002 ********************************************************************************************* JOB SUBMIT OUTCOME The job has been successfully submitted to the Network Server. Use glite-job-status command to check job current status. Your job identifier is: - https://wms.ulakbim.gov.tr:9000/2n33HIg63quJXLKgHG2m-A JobID *********************************************************************************************

17. İş Göndermek • glite-job-cancel <jobid> • Belirtilen işi iptal eder • glite-job-status <jobid> • İş hakkında bilgi verir • glite-job-output <jobid> • İşin çıktı torbasını getirir • glite-job-logging-info <jobid> • İş hakkında detaylı bilgi verir, hata gidermek için yararlı bir komuttur

18. İş Durumları

19. Olası İş Durumları

20. İnteraktif İşler İnteraktif iş, standart girdi, çıktı ve hataları iş gönderilen istemciye yönlendiren iş tipidir: • KullanıcıJobType niteliğiniinteractive olarak ayarlamalıdır. • Bir interaktif iş gönderildiğinde glite-job-submit komutu arka planda bir gölge konsol işi başlatır. • Konsolun kullanacağı port,ListenerPort niteliği ile değiştirilebilir. • DISPLAY çevre değişkeni düzgün ayarlanmalı veya –nogui parametresi kullanılmalıdır • OutputSandbox niteliğini tanımlamaya gerek yoktur. İnteraktif pencereye çıktılar gelecektir.

21. MPICH İşleri • Paralel iş koşturmak için birçok kütüphane vardır. gLite orta katmanında MPICH tercih edilmiştir. • Kullanıcı JobType niteliğini MPICH olarak ayarlamalı ve NodeNumber niteliği ile gerekli işlemci sayısını ayarlamalıdır. • Bir sitede MPICH işi çalışması için sitenin uygun şekilde düzenlenmesi dışında: • Sitenin MPICH desteklediğinin işaretlenmesi gerekmektedir • İstenen işlemci miktarı sitedeki mevcut işlemci sayısından az olmalıdır

22. MPICH İşleri [ JobType = “MPICH"; Executable = "cpi"; NodeNumber = 2; StdOutput = "test.out"; StdError = "test.err"; InputSandbox = {"cpi"}; OutputSandbox = {"test.out","test.err"}; ] • NodeNumber işin çalışacağı işlemci sayısını belirtir. • İşlemci sayısı arttıkça işin kuyrukta bekleme süresi de artacaktır