slide1
Download
Skip this Video
Download Presentation
Rodzina białek C/EBP w zarysie

Loading in 2 Seconds...

play fullscreen
1 / 25

Rodzina białek C/EBP w zarysie - PowerPoint PPT Presentation


  • 174 Views
  • Uploaded on

Rodzina białek C/EBP w zarysie. Przemysław Grudnik Zakład Biochemii Ogólnej, Wydział Biotechnologii, Uniwersytet Jagielloński. Wstęp Struktura C/EBP Wybrane funkcje Zarys Regulacji - regulacja transkrypcyjna Translacja Modulacja funkcji Interakcje białko – białko Schorzenia

loader
I am the owner, or an agent authorized to act on behalf of the owner, of the copyrighted work described.
capcha
Download Presentation

PowerPoint Slideshow about ' Rodzina białek C/EBP w zarysie' - donny


An Image/Link below is provided (as is) to download presentation

Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author.While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server.


- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E N D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Presentation Transcript
slide1

Rodzina białek C/EBP w zarysie

Przemysław Grudnik

Zakład Biochemii Ogólnej, Wydział Biotechnologii, Uniwersytet Jagielloński

slide2

Wstęp

  • Struktura C/EBP
  • Wybrane funkcje
  • Zarys Regulacji- regulacja transkrypcyjna
  • Translacja
  • Modulacja funkcji
  • Interakcje białko – białko
  • Schorzenia
  • Podsumowanie

Rodzina białek C/EBP

c ebp czyli z czym to si je
C/EBP - czyli z czym to się je
  • CCAAT/ enhancer-binding proteins synonim: CCAAT-box binding factor
  • sekwencja regulatorowa CCAAT – ok. 80-60 pz od miejsca inicjacji transkrypcji
  • sekwencja wzmacniająca TT/GNNGA/CAAT
  • domena N-końcowa: funkcja regulatorowa
  • domena C-końcowa: wiązanie DNA, struktura b-Zip

Rodzina białek C/EBP

geny c ebp
Geny C/EBP
  • C/EBP alfa, beta i delta – brak intronów
  • lokalizacja: alfa – 19q13.1 beta – 20q13.1 delta – 8p11.2-p11.1
  • C/EBP – epsilon: 3 eksony, 14q11.2

Rodzina białek C/EBP

krewni i znajomi kr lika czyli c ebp z rodzin
Krewni i znajomi królika –czyli C/EBP z rodziną
  • C/EBP – alfa (CEBPA)
  • C/EBP – beta (CEBPB, IL-DBP ...)
  • C/EBP – gamma (Ig/EBP)
  • C/EBP – delta (CEBPD ...)
  • C/EBP – epsilon (CEBPE)

Rodzina białek C/EBP

struktura
Struktura

Rodzina białek C/EBP

funkcje c ebp
Funkcje C/EBP
  • Adipocyty
  • regulacja adipogenezy
  • wysoka ekspresja C/EBP-alfa
  • inicjacja adipogenezy bez obecności innych czynników
  • ekspresja antysensownego C/EBP-alfa blokuje a-genezę
  • brak C/EBP-beta –gamma: blok adipogenezy

Rodzina białek C/EBP

slide10

Funkcje C/EBP

  • Komórki mieloidalne
  • ekspresja C/EBP α β γ i ε
  • niedobór α prowadzi do nie wytwarzania dojrzałych neutrofili
  • niedobór ε:- atypowa morfologia neutrofili - defekt wybuchu oddechowego - opóźniony efekt zapalny
  • C/EBP β – rola w różnicowaniu się makrofagów

Rodzina białek C/EBP

slide11

Funkcje C/EBP

  • Inne komórki
  • różnicowanie się: hepatocyty, keratynocyty, kom. nerwowe ...
  • miejsca wiązania C/EBP w promotorach genów hepatocytów odpowiedzialnych za odpowiedź na uszkodzenie
  • brak ekspresji C/EBP-alfa prowadzi do nowotworów wątroby
  • poprawna ekspresja C/EBP -> ekspresja białek mleka ssaczego

Rodzina białek C/EBP

slide12

Funkcje C/EBP

  • Odczyn zapalny
  • C/EBP α β i γ regulacja przez czynniki prozapalne: - LPS - IL-1, IL-6
  • niedobór C/EBP ε opóźnia migrację neutrofili

Rodzina białek C/EBP

slide13

Regulacja C/EBP

Legenda: DBA – DNA binding activity; NL – nuclear localisation; AP – activation potential

Rodzina białek C/EBP

slide14

Regulacja transkrypcyjna

  • C/EBP alfa
  • promotor z miejscami wiązania: C/EBP, Sp1, NF-1, NF-Y, NF-κB
  • autoaktywacja w transfekowanych komórkach (plazmid)
  • aktywacja przy braku lub nadekspresji c-myc
  • hormony tyroidowe [-602-589 – promotora]
  • inhibicja: białko c-Myc (interakcja z rdzeniem promotora)

Rodzina białek C/EBP

slide15

Regulacja transkrypcyjna

  • C/EBP beta
  • autoregulacja
  • CREB (cAMP-response-element-binding protein) - interakcja w pobliżu TATA-box
  • Indukcja poprzez IL-6 -> CREB
  • APR – Acute phase response zależne od cytokin: IL-6, TNF- α

Rodzina białek C/EBP

slide16

Regulacja transkrypcyjna

  • C/EBP delta
  • ekspresja konstytutywna w osteoblastach (aktywacja syntezy IGF-I)
  • promotor z Runt domain factor binding place (Runx)
  • aktywność promotora zmniejszona przy mutacji Runx
  • miejsce wiążące STAT-3

Rodzina białek C/EBP

slide17

Regulacja transkrypcyjna

  • C/EBP epsilon
  • dwa różne promotory transkrypcji: pα i pβ
  • promotory z TATAAA – box
  • element wiążący kwas retinowy

Rodzina białek C/EBP

slide18

Translacja

  • C/EBP- alfa
  • dwie izoformy: 42 kDa i 30 kDa – z jednego mRNA
  • forma 30 kDa – mniejszy potencjał aktywacyjny
  • stosunek obu form różny w zależności od fazy różnicowania
  • uORF – konserwatywna, 7pz od kodonu start
  • C/EBP – beta
  • formy LAP – aktywator, LIP – represor
  • LAP/LIP tkankowo zależna np. LIP więcej w nowotw. Piersi
  • stosunek izoform kontrolowany przez RNA-dep. PK, szlak mTOR oraz czynniki inicjacyjne: eIF-2α i eIF-4E

Rodzina białek C/EBP

slide19

Translacja

42 kDa

30 kDa

Rodzina białek C/EBP

slide20

Modulacja Funkcji

  • C/EBP beta
  • supresja poprzez fosforylację
  • fosforylacja Thr235 przez szlak MAPK Ser105 przez PKC
  • fosforylacja poprzez PKC zmniejsza możliwości wiązania
  • PKA -> translokacja do jądra i aktywacja genu c-fos
  • Fosforylacja zazwyczaj zmniejsza możliwości wiązania C/EBP do DNA

Rodzina białek C/EBP

slide21

Szlak MAPK

Rodzina białek C/EBP

slide22

Interakcje białko – białko

  • C/EBPα najsilniejszy aktywator transkrypcji
  • tworzenie heterodimerów przez białka z rodziny C/EBP
  • heterodimery z białkami bZIP i non-bZIP: - interakcja C/EBPβ z jednostką p50 NF-κB, AP1, Rb, wirusowym białkiem X,
  • heterodimery często posiadają inną specyficzność wiązania

Rodzina białek C/EBP

slide23

Schorzenia

  • C/EBPα – ostra białaczka szpikowa (delecja 263 – 269)
  • C/EBPε – specyficzne upośledzenie granulocytów (delecja 2 eksonu)

Rodzina białek C/EBP

slide24

Podsumowanie

  • 6 białek z rodziny C/EBP
  • motyw suwaka leucynowego
  • największa ekspresja w: adipocytach, hepatocytach, kom. mieloidalnych, kom nerwowych...
  • regulacja odczynu zapalnego
  • wiele szlaków aktywacji
  • kilka izoform jednego czynnika
  • upośledzenie powoduje zaburzenia i ciężkie choroby

Rodzina białek C/EBP

slide25

Bibliografia

Vidal N. O. A. i wsp. J. Endocrinol. (1997) 155, 433-441

Chin-Jing Chang i wsp. Mol.Cell.Biol. 1990 p. 6642-6653

Protein Data Bank - www.rcsb.org/pdb

Online Mendelian Inheritance in Man –www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=OMIM

Rodzina białek C/EBP

ad