Rodzina białek C/EBP w zarysie
This presentation is the property of its rightful owner.
Sponsored Links
1 / 25

Rodzina białek C/EBP w zarysie PowerPoint PPT Presentation


  • 127 Views
  • Uploaded on
  • Presentation posted in: General

Rodzina białek C/EBP w zarysie. Przemysław Grudnik Zakład Biochemii Ogólnej, Wydział Biotechnologii, Uniwersytet Jagielloński. Wstęp Struktura C/EBP Wybrane funkcje Zarys Regulacji - regulacja transkrypcyjna Translacja Modulacja funkcji Interakcje białko – białko Schorzenia

Download Presentation

Rodzina białek C/EBP w zarysie

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation

Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author.While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server.


- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E N D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Presentation Transcript


Rodzina bia ek c ebp w zarysie

Rodzina białek C/EBP w zarysie

Przemysław Grudnik

Zakład Biochemii Ogólnej, Wydział Biotechnologii, Uniwersytet Jagielloński


Rodzina bia ek c ebp w zarysie

  • Wstęp

  • Struktura C/EBP

  • Wybrane funkcje

  • Zarys Regulacji- regulacja transkrypcyjna

  • Translacja

  • Modulacja funkcji

  • Interakcje białko – białko

  • Schorzenia

  • Podsumowanie

Rodzina białek C/EBP


C ebp czyli z czym to si je

C/EBP - czyli z czym to się je

  • CCAAT/ enhancer-binding proteins synonim: CCAAT-box binding factor

  • sekwencja regulatorowa CCAAT – ok. 80-60 pz od miejsca inicjacji transkrypcji

  • sekwencja wzmacniająca TT/GNNGA/CAAT

  • domena N-końcowa: funkcja regulatorowa

  • domena C-końcowa: wiązanie DNA, struktura b-Zip

Rodzina białek C/EBP


Geny c ebp

Geny C/EBP

  • C/EBP alfa, beta i delta – brak intronów

  • lokalizacja: alfa – 19q13.1 beta – 20q13.1 delta – 8p11.2-p11.1

  • C/EBP – epsilon: 3 eksony, 14q11.2

Rodzina białek C/EBP


Krewni i znajomi kr lika czyli c ebp z rodzin

Krewni i znajomi królika –czyli C/EBP z rodziną

  • C/EBP – alfa (CEBPA)

  • C/EBP – beta (CEBPB, IL-DBP ...)

  • C/EBP – gamma (Ig/EBP)

  • C/EBP – delta (CEBPD ...)

  • C/EBP – epsilon (CEBPE)

Rodzina białek C/EBP


Struktura

Struktura

Rodzina białek C/EBP


Rodzina bia ek c ebp w zarysie

Rys 1. Zamek Leucynowy C/EBP (pdb)

Rodzina białek C/EBP


Rodzina bia ek c ebp w zarysie

Rys 2. C/EBP – beta + DNA (pdb)

Rodzina białek C/EBP


Funkcje c ebp

Funkcje C/EBP

  • Adipocyty

  • regulacja adipogenezy

  • wysoka ekspresja C/EBP-alfa

  • inicjacja adipogenezy bez obecności innych czynników

  • ekspresja antysensownego C/EBP-alfa blokuje a-genezę

  • brak C/EBP-beta –gamma: blok adipogenezy

Rodzina białek C/EBP


Rodzina bia ek c ebp w zarysie

Funkcje C/EBP

  • Komórki mieloidalne

  • ekspresja C/EBP α β γ i ε

  • niedobór α prowadzi do nie wytwarzania dojrzałych neutrofili

  • niedobór ε:- atypowa morfologia neutrofili - defekt wybuchu oddechowego - opóźniony efekt zapalny

  • C/EBP β – rola w różnicowaniu się makrofagów

Rodzina białek C/EBP


Rodzina bia ek c ebp w zarysie

Funkcje C/EBP

  • Inne komórki

  • różnicowanie się: hepatocyty, keratynocyty, kom. nerwowe ...

  • miejsca wiązania C/EBP w promotorach genów hepatocytów odpowiedzialnych za odpowiedź na uszkodzenie

  • brak ekspresji C/EBP-alfa prowadzi do nowotworów wątroby

  • poprawna ekspresja C/EBP -> ekspresja białek mleka ssaczego

Rodzina białek C/EBP


Rodzina bia ek c ebp w zarysie

Funkcje C/EBP

  • Odczyn zapalny

  • C/EBP α β i γ regulacja przez czynniki prozapalne:- LPS- IL-1, IL-6

  • niedobór C/EBP ε opóźnia migrację neutrofili

Rodzina białek C/EBP


Rodzina bia ek c ebp w zarysie

Regulacja C/EBP

Legenda: DBA – DNA binding activity; NL – nuclear localisation; AP – activation potential

Rodzina białek C/EBP


Rodzina bia ek c ebp w zarysie

Regulacja transkrypcyjna

  • C/EBP alfa

  • promotor z miejscami wiązania: C/EBP, Sp1, NF-1, NF-Y, NF-κB

  • autoaktywacja w transfekowanych komórkach (plazmid)

  • aktywacja przy braku lub nadekspresji c-myc

  • hormony tyroidowe [-602-589 – promotora]

  • inhibicja: białko c-Myc (interakcja z rdzeniem promotora)

Rodzina białek C/EBP


Rodzina bia ek c ebp w zarysie

Regulacja transkrypcyjna

  • C/EBP beta

  • autoregulacja

  • CREB (cAMP-response-element-binding protein)- interakcja w pobliżu TATA-box

  • Indukcja poprzez IL-6 -> CREB

  • APR – Acute phase response zależne od cytokin: IL-6, TNF- α

Rodzina białek C/EBP


Rodzina bia ek c ebp w zarysie

Regulacja transkrypcyjna

  • C/EBP delta

  • ekspresja konstytutywna w osteoblastach (aktywacja syntezy IGF-I)

  • promotor z Runt domain factor binding place (Runx)

  • aktywność promotora zmniejszona przy mutacji Runx

  • miejsce wiążące STAT-3

Rodzina białek C/EBP


Rodzina bia ek c ebp w zarysie

Regulacja transkrypcyjna

  • C/EBP epsilon

  • dwa różne promotory transkrypcji: pα i pβ

  • promotory z TATAAA – box

  • element wiążący kwas retinowy

Rodzina białek C/EBP


Rodzina bia ek c ebp w zarysie

Translacja

  • C/EBP- alfa

  • dwie izoformy: 42 kDa i 30 kDa – z jednego mRNA

  • forma 30 kDa – mniejszy potencjał aktywacyjny

  • stosunek obu form różny w zależności od fazy różnicowania

  • uORF – konserwatywna, 7pz od kodonu start

  • C/EBP – beta

  • formy LAP – aktywator, LIP – represor

  • LAP/LIP tkankowo zależna np. LIP więcej w nowotw. Piersi

  • stosunek izoform kontrolowany przez RNA-dep. PK, szlak mTOR oraz czynniki inicjacyjne: eIF-2α i eIF-4E

Rodzina białek C/EBP


Rodzina bia ek c ebp w zarysie

Translacja

42 kDa

30 kDa

Rodzina białek C/EBP


Rodzina bia ek c ebp w zarysie

Modulacja Funkcji

  • C/EBP beta

  • supresja poprzez fosforylację

  • fosforylacja Thr235 przez szlak MAPK Ser105 przez PKC

  • fosforylacja poprzez PKC zmniejsza możliwości wiązania

  • PKA -> translokacja do jądra i aktywacja genu c-fos

  • Fosforylacja zazwyczaj zmniejsza możliwości wiązania C/EBP do DNA

Rodzina białek C/EBP


Rodzina bia ek c ebp w zarysie

Szlak MAPK

Rodzina białek C/EBP


Rodzina bia ek c ebp w zarysie

Interakcje białko – białko

  • C/EBPα najsilniejszy aktywator transkrypcji

  • tworzenie heterodimerów przez białka z rodziny C/EBP

  • heterodimery z białkami bZIP i non-bZIP:- interakcja C/EBPβ z jednostką p50 NF-κB, AP1, Rb, wirusowym białkiem X,

  • heterodimery często posiadają inną specyficzność wiązania

Rodzina białek C/EBP


Rodzina bia ek c ebp w zarysie

Schorzenia

  • C/EBPα – ostra białaczka szpikowa (delecja 263 – 269)

  • C/EBPε – specyficzne upośledzenie granulocytów (delecja 2 eksonu)

Rodzina białek C/EBP


Rodzina bia ek c ebp w zarysie

Podsumowanie

  • 6 białek z rodziny C/EBP

  • motyw suwaka leucynowego

  • największa ekspresja w: adipocytach, hepatocytach, kom. mieloidalnych, kom nerwowych...

  • regulacja odczynu zapalnego

  • wiele szlaków aktywacji

  • kilka izoform jednego czynnika

  • upośledzenie powoduje zaburzenia i ciężkie choroby

Rodzina białek C/EBP


Rodzina bia ek c ebp w zarysie

Bibliografia

Vidal N. O. A. i wsp. J. Endocrinol. (1997) 155, 433-441

Chin-Jing Chang i wsp. Mol.Cell.Biol. 1990 p. 6642-6653

Protein Data Bank - www.rcsb.org/pdb

Online Mendelian Inheritance in Man –www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=OMIM

Rodzina białek C/EBP


  • Login