Nye analyseteknikker (DNA) för kontroll av mikroorganismer
Sponsored Links
This presentation is the property of its rightful owner.
1 / 20

Nye analyseteknikker (DNA) för kontroll av mikroorganismer Charlotta Engdahl Axelsson PowerPoint PPT Presentation


  • 139 Views
  • Uploaded on
  • Presentation posted in: General

Nye analyseteknikker (DNA) för kontroll av mikroorganismer Charlotta Engdahl Axelsson Forsknings- och utvecklingschef mikrobiologi Lantmännen Analycen AB. Varumärken. Analycens lab. Laboratorier Finland: Tampere Norge: Moss Danmark: Frederica Polen: Warszawa

Download Presentation

Nye analyseteknikker (DNA) för kontroll av mikroorganismer Charlotta Engdahl Axelsson

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation

Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author.While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server.


- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E N D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Presentation Transcript


Nye analyseteknikker (DNA) för kontroll av mikroorganismer

Charlotta Engdahl Axelsson

Forsknings- och utvecklingschef mikrobiologi

Lantmännen Analycen AB


Varumärken


Analycens lab

  • Laboratorier

    • Finland: Tampere

    • Norge: Moss

    • Danmark: Frederica

    • Polen: Warszawa

    • Sverige: Lidköping, Kristianstad, Örebro, Skara, Uppsala


DNA analys -ny teknik

  • In vitro DNA amplifiering (PCR) 1983


Brett användningsområde (Analycen idag)

  • Patogena mikroorganismer (näringsmedel, vatten, växter)

  • Allergena födoämnen

  • Djurslagsbestämning

  • GMO


Patogena mikroorganismer

  • Salmonella

  • Shigella

  • Campylobacter

  • EHEC

  • Växtpatogena svampar

  • m.fl.


DNA

  • Arvsmassa DNA/RNA

  • DNA baser (nukleotider)

  • DNA bibliotek


Två syften

  • A) Detektion av mikroorganismer, arter, gener

  • B) Individidentifiering, smittspårning


PCR

  • Uppförökning av DNA

  • Avgränsas av s.k. primers (måste vara specifika)

  • Probe som kontroll av specificitet och för detektion


PCR -fördelar

  • Relevanta egenskaper mäts

  • Svårodlade mikroorganismer detekteras

  • Snabbheten

  • Specificiteten

  • Objektiv


PCR – att tänka på

  • Inte alltid kompatibel med traditionell analys

  • Döda/levande bakterier

  • Hög detektionsnivå > 1000 bakterier/ml

  • Provupparbetning


Lagstiftning/standardisering

  • DNA ok för livsmedelskontroll (gäller validerade metoder enl ISO 16140)

  • Standarder för EHEC och virus på gång (Norovirus och Heptit A)

  • Samarbete livsmedel-vatten standardisering

  • EHEC, Salmonella aktuellt för vatten

  • EU ref lab för parasiter (Cryptosporidium, Giardia)


En utskrift från DagensNyheters nätupplaga, DN.se.

  • Publicerad 15 aug 2007 13:53

    Smitta på förskola i Sundbyberg

    Sundbyberg.Ett barn har smittats och ytterligare 12 barn och en ur personalen har visat tecken på att ha smittats av en infektion på en förskola i Sundbyberg.

    - Vi har konstaterat att ett barn har fått en cryptosporidiuminfektion, som är en parasit, säger Ingegerd Hökeberg, biträdande smittskyddsläkare vid smittskyddsenheten i Stockholms läns landsting


Erfarenheter av Legionella analyser


Protocol

Filtration of 1L water

Lysis of Bacteria, extraction and DNA purification

Real-time PCR detection and/ or quantification

Screening : specific sequences detection / controls

Quantification : specific sequences detection / Standards

5 h to result

Legionella spp

L. pneumophila


Erfarenheter PCR och Legionella

  • PCR bra för detektion

  • Korrelation med PCR –odling dålig

  • Gränser baseras på odling


Framtid

  • Fortsatt utveckling av DNA tekniken

  • Odling och isolering fortsatt viktigt

  • DNA standarder för vattenburna patogener


TACK!


  • Login