Nye analyseteknikker (DNA) för kontroll av mikroorganismer Charlotta Engdahl Axelsson - PowerPoint PPT Presentation

Nye analyseteknikker (DNA) för kontroll av mikroorganismer
Download
1 / 20

  • 154 Views
  • Uploaded on
  • Presentation posted in: General

Nye analyseteknikker (DNA) för kontroll av mikroorganismer Charlotta Engdahl Axelsson Forsknings- och utvecklingschef mikrobiologi Lantmännen Analycen AB. Varumärken. Analycens lab. Laboratorier Finland: Tampere Norge: Moss Danmark: Frederica Polen: Warszawa

I am the owner, or an agent authorized to act on behalf of the owner, of the copyrighted work described.

Download Presentation

Nye analyseteknikker (DNA) för kontroll av mikroorganismer Charlotta Engdahl Axelsson

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation

Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author.While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server.


- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E N D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Presentation Transcript


Nye analyseteknikker dna f r kontroll av mikroorganismer charlotta engdahl axelsson

Nye analyseteknikker (DNA) för kontroll av mikroorganismer

Charlotta Engdahl Axelsson

Forsknings- och utvecklingschef mikrobiologi

Lantmännen Analycen AB


Varum rken

Varumärken


Analycens lab

Analycens lab

  • Laboratorier

    • Finland: Tampere

    • Norge: Moss

    • Danmark: Frederica

    • Polen: Warszawa

    • Sverige: Lidköping, Kristianstad, Örebro, Skara, Uppsala


Dna analys ny teknik

DNA analys -ny teknik

  • In vitro DNA amplifiering (PCR) 1983


Brett anv ndningsomr de analycen idag

Brett användningsområde (Analycen idag)

  • Patogena mikroorganismer (näringsmedel, vatten, växter)

  • Allergena födoämnen

  • Djurslagsbestämning

  • GMO


Patogena mikroorganismer

Patogena mikroorganismer

  • Salmonella

  • Shigella

  • Campylobacter

  • EHEC

  • Växtpatogena svampar

  • m.fl.


Nye analyseteknikker dna f r kontroll av mikroorganismer charlotta engdahl axelsson

DNA

  • Arvsmassa DNA/RNA

  • DNA baser (nukleotider)

  • DNA bibliotek


Tv syften

Två syften

  • A) Detektion av mikroorganismer, arter, gener

  • B) Individidentifiering, smittspårning


Nye analyseteknikker dna f r kontroll av mikroorganismer charlotta engdahl axelsson

PCR

  • Uppförökning av DNA

  • Avgränsas av s.k. primers (måste vara specifika)

  • Probe som kontroll av specificitet och för detektion


Pcr f rdelar

PCR -fördelar

  • Relevanta egenskaper mäts

  • Svårodlade mikroorganismer detekteras

  • Snabbheten

  • Specificiteten

  • Objektiv


Pcr att t nka p

PCR – att tänka på

  • Inte alltid kompatibel med traditionell analys

  • Döda/levande bakterier

  • Hög detektionsnivå > 1000 bakterier/ml

  • Provupparbetning


Lagstiftning standardisering

Lagstiftning/standardisering

  • DNA ok för livsmedelskontroll (gäller validerade metoder enl ISO 16140)

  • Standarder för EHEC och virus på gång (Norovirus och Heptit A)

  • Samarbete livsmedel-vatten standardisering

  • EHEC, Salmonella aktuellt för vatten

  • EU ref lab för parasiter (Cryptosporidium, Giardia)


Nye analyseteknikker dna f r kontroll av mikroorganismer charlotta engdahl axelsson

En utskrift från DagensNyheters nätupplaga, DN.se.

  • Publicerad 15 aug 2007 13:53

    Smitta på förskola i Sundbyberg

    Sundbyberg.Ett barn har smittats och ytterligare 12 barn och en ur personalen har visat tecken på att ha smittats av en infektion på en förskola i Sundbyberg.

    - Vi har konstaterat att ett barn har fått en cryptosporidiuminfektion, som är en parasit, säger Ingegerd Hökeberg, biträdande smittskyddsläkare vid smittskyddsenheten i Stockholms läns landsting


Erfarenheter av legionella analyser

Erfarenheter av Legionella analyser


Nye analyseteknikker dna f r kontroll av mikroorganismer charlotta engdahl axelsson

Protocol

Filtration of 1L water

Lysis of Bacteria, extraction and DNA purification

Real-time PCR detection and/ or quantification

Screening : specific sequences detection / controls

Quantification : specific sequences detection / Standards

5 h to result

Legionella spp

L. pneumophila


Erfarenheter pcr och legionella

Erfarenheter PCR och Legionella

  • PCR bra för detektion

  • Korrelation med PCR –odling dålig

  • Gränser baseras på odling


Framtid

Framtid

  • Fortsatt utveckling av DNA tekniken

  • Odling och isolering fortsatt viktigt

  • DNA standarder för vattenburna patogener


Nye analyseteknikker dna f r kontroll av mikroorganismer charlotta engdahl axelsson

TACK!


  • Login