slide1
Download
Skip this Video
Download Presentation
Nye analyseteknikker (DNA) för kontroll av mikroorganismer Charlotta Engdahl Axelsson

Loading in 2 Seconds...

play fullscreen
1 / 20

Nye analyseteknikker (DNA) för kontroll av mikroorganismer Charlotta Engdahl Axelsson - PowerPoint PPT Presentation


  • 179 Views
  • Uploaded on

Nye analyseteknikker (DNA) för kontroll av mikroorganismer Charlotta Engdahl Axelsson Forsknings- och utvecklingschef mikrobiologi Lantmännen Analycen AB. Varumärken. Analycens lab. Laboratorier Finland: Tampere Norge: Moss Danmark: Frederica Polen: Warszawa

loader
I am the owner, or an agent authorized to act on behalf of the owner, of the copyrighted work described.
capcha
Download Presentation

PowerPoint Slideshow about ' Nye analyseteknikker (DNA) för kontroll av mikroorganismer Charlotta Engdahl Axelsson' - damon


An Image/Link below is provided (as is) to download presentation

Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author.While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server.


- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E N D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Presentation Transcript
slide1

Nye analyseteknikker (DNA) för kontroll av mikroorganismer

Charlotta Engdahl Axelsson

Forsknings- och utvecklingschef mikrobiologi

Lantmännen Analycen AB

analycens lab
Analycens lab
  • Laboratorier
    • Finland: Tampere
    • Norge: Moss
    • Danmark: Frederica
    • Polen: Warszawa
    • Sverige: Lidköping, Kristianstad, Örebro, Skara, Uppsala
dna analys ny teknik
DNA analys -ny teknik
  • In vitro DNA amplifiering (PCR) 1983
brett anv ndningsomr de analycen idag
Brett användningsområde (Analycen idag)
  • Patogena mikroorganismer (näringsmedel, vatten, växter)
  • Allergena födoämnen
  • Djurslagsbestämning
  • GMO
patogena mikroorganismer
Patogena mikroorganismer
  • Salmonella
  • Shigella
  • Campylobacter
  • EHEC
  • Växtpatogena svampar
  • m.fl.
slide8
DNA
  • Arvsmassa DNA/RNA
  • DNA baser (nukleotider)
  • DNA bibliotek
tv syften
Två syften
  • A) Detektion av mikroorganismer, arter, gener
  • B) Individidentifiering, smittspårning
slide10
PCR
  • Uppförökning av DNA
  • Avgränsas av s.k. primers (måste vara specifika)
  • Probe som kontroll av specificitet och för detektion
pcr f rdelar
PCR -fördelar
  • Relevanta egenskaper mäts
  • Svårodlade mikroorganismer detekteras
  • Snabbheten
  • Specificiteten
  • Objektiv
pcr att t nka p
PCR – att tänka på
  • Inte alltid kompatibel med traditionell analys
  • Döda/levande bakterier
  • Hög detektionsnivå > 1000 bakterier/ml
  • Provupparbetning
lagstiftning standardisering
Lagstiftning/standardisering
  • DNA ok för livsmedelskontroll (gäller validerade metoder enl ISO 16140)
  • Standarder för EHEC och virus på gång (Norovirus och Heptit A)
  • Samarbete livsmedel-vatten standardisering
  • EHEC, Salmonella aktuellt för vatten
  • EU ref lab för parasiter (Cryptosporidium, Giardia)
slide14

En utskrift från DagensNyheters nätupplaga, DN.se.

  • Publicerad 15 aug 2007 13:53

Smitta på förskola i Sundbyberg

Sundbyberg.Ett barn har smittats och ytterligare 12 barn och en ur personalen har visat tecken på att ha smittats av en infektion på en förskola i Sundbyberg.

- Vi har konstaterat att ett barn har fått en cryptosporidiuminfektion, som är en parasit, säger Ingegerd Hökeberg, biträdande smittskyddsläkare vid smittskyddsenheten i Stockholms läns landsting

slide16

Protocol

Filtration of 1L water

Lysis of Bacteria, extraction and DNA purification

Real-time PCR detection and/ or quantification

Screening : specific sequences detection / controls

Quantification : specific sequences detection / Standards

5 h to result

Legionella spp

L. pneumophila

erfarenheter pcr och legionella
Erfarenheter PCR och Legionella
  • PCR bra för detektion
  • Korrelation med PCR –odling dålig
  • Gränser baseras på odling
framtid
Framtid
  • Fortsatt utveckling av DNA tekniken
  • Odling och isolering fortsatt viktigt
  • DNA standarder för vattenburna patogener
ad