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数据来源： DDBJ 统计截止日期： 2000 年 10 月 23 日

说明. 数据来源： DDBJ 统计截止日期： 2000 年 10 月 23 日. 香港没有全部统计在内； 如果提交者没有写 “ CHINA ” ，则无法统计，但这种估计这种情况极少，只发现一条记录写了 “ PROC ” 。. 概况 ( 非 EST 部分 ). 序列总数： 6522 序列总长度： 37492880 平均序列长度： 5748 最长： 266941( 台湾 ) 209216( 上海 ). 序列数 --- 地区分布. 台湾. 云南. 18%. 8%. 广东. 5%. 其他. 上海. 16%. 25%.

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数据来源： DDBJ 统计截止日期： 2000 年 10 月 23 日

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Presentation Transcript

  1. 说明 数据来源：DDBJ 统计截止日期：2000年10月23日 • 香港没有全部统计在内； • 如果提交者没有写“CHINA”，则无法统计，但这种估计这种情况极少，只发现一条记录写了“PROC”。

  2. 概况(非EST部分) 序列总数： 6522 序列总长度：37492880 平均序列长度： 5748 最长： 266941(台湾) 209216(上海)

  3. 序列数---地区分布 台湾 云南 18% 8% 广东 5% 其他 上海 16% 25% 北京 28%

  4. 序列长度---地区分布 云南 1% 台湾 45% 广东 1% 其他 3% 北京 15% 上海 35%

  5. 最长的序列 AF213884S2 266941 bp human. Homo sapiens mannosidase, beta A, lysosomal (MANBA) gene, and ubiquitin-conjugating enzyme E2D 3 (UBE2D3) genes, complete cds. Chang,H.-M. and Tsai,S.-F. Submitted (09-DEC-1999) Institute of Genetics, National Yang-Ming University, 155 Li-Rong St. Section 2, Peitou, Taipei, Taiwan 11221, Republic of China AF190464 209216 bp human. Homo sapiens hepatocytic transcription factor (B1F) gene, alternatively spliced products, complete cds, complete sequence. Lin,W., Fu,G., Dong,H. and Huang,G.M. Submitted (26-SEP-1999) Chinese Human Genome Center at Shanghai, 351 Guoshoujing Road, Zhangjiang Hi-Tech Park, Shanghai 201203, People's Republic of China Wang,Y., Zhang,C. and Cai,Y. Submitted (26-SEP-1999) Research Group of Hepatitis Viruses, Shanghai Institute of Biochemistry, Chinese Academy of Science, 320 Yueyang Road, Shanghai 200031, People's Republic of China AF165124 195909 bp human. Homo sapiens chromosome 5q31.1-q33.1 clone BAC djn082c10 containing GABRG2 gene, complete sequence. Jiang,S., Yu,J., He,L. and Yang,H. Submitted (02-JUL-1999) Human Genome Center, Institute of Genetics, Chinese Academy of Sciences, Datun Road, Beijing 100101, People's Republic of China

  6. 最长的序列

  7. 16000 14000 12000 10000 8000 6000 4000 2000 0 台湾 香港 安徽 上海 江西 北京 湖南 辽宁 浙江 四川 河北 湖北 海南 福建 重庆 天津 广东 甘肃 河南 陕西 云南 江苏 山东 广西 吉林 青海 黑龙江 序列平均长度---地区分布

  8. 序列长度---正态分布 0－1K 1K－10K 10－300K

  9. 序列数---年代分布 3500 3000 2500 2000 1500 1000 500 0 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 00

  10. 序列长度---年代分布 40,000,000 35,000,000 30,000,000 25,000,000 20,000,000 15,000,000 10,000,000 5,000,000 0 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 00

  11. 最早提交者 DMLAMB2 4482 bp RNA INV 29-APR-1991 Drosophila mRNA for laminin B2 chain. Submitted (03-JUN-1988) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. Chi H.C., Institute of Molecular Biology, Academia Sinica, Nankang, Taipei 11529, Republic of China POVVHA 1458 bp DNA VRL 26-MAY-1995 Vaccinia virus gene for viral hemagglutinin. Submitted (30-JUN-1989) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. D.Y.Jin, Institute of Virology, Chinese Academy of Preventive Medicine, 100 Yingxin Street, Beijing 1000 52, Peoples Republic of China KPNIFJG 720 bp DNA BCT 11-MAY-1992 K.pneumoniae nifJ gene promoter and partial sequence of nifJ gene. Submitted (28-AUG-1989) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. S.C. Shen, Y. Wu, G. Yu and J. Zhu, SHANGHAI INSTITUTE OF PLANT PHYSIOLOGY, ACCADEMICA SINICA, 300 FONGLIN ROAD, SHANGHAI 200032, P.R. CHINA BSPGIB 1866 bp DNA BCT 20-APR-1995 Bacillus stearothermophilus pgiB gene for phosphoglucose isomerase isoenzyme B (EC 5.3.1.9). Submitted (25-SEP-1989) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. Tao W., Institute of Genetics , Fudan University , Shanghai, People's Republic of China ZMACCR11 4150 bp DNA PLN 02-OCT-1990 Maize DNA for cryptic Ac-11 sequence. Submitted (22-FEB-1990) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. Chen J., Institute of Molecular Biology, Academia Sinica Taiwan, Republic of China

  12. 序列数---分类 3% 3% 4% 4% 30% 5% 6% 8% 22% 14% HUM PLN VRL VRT BCT INV MAM PRI HTG ROD SYN STS GSS UNA PHG

  13. 序列长度---分类 16% 6% 3% 1% 2% 1% 70% 1% HUM PLN VRL VRT BCT INV MAM PRI HTG ROD SYN STS GSS UNA PHG

  14. 概况(EST部分) 总数 ： 103026 总长度：53363155 其中：南方中心于2000年9月提交EST序列 100218条，总长度：52358070 bp 分别占97.27%和98.12%。 其平均长度为 522 bp

  15. 除南方中心的103026条EST外： 平均长度：358 bp

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