epidemiologia della tubercolosi in toscana
Download
Skip this Video
Download Presentation
Epidemiologia della tubercolosi in Toscana

Loading in 2 Seconds...

play fullscreen
1 / 25

Epidemiologia della tubercolosi in Toscana - PowerPoint PPT Presentation


  • 102 Views
  • Uploaded on

Epidemiologia della tubercolosi in Toscana. Il questionario. La rete dei laboratori. Laboratori di I livello Invio dei campioni al rispettivo laboratorio di II livello per l’esecuzione della coltura Laboratori di II livello Conservazione di tutti i ceppi di M. tuberculosis complex

loader
I am the owner, or an agent authorized to act on behalf of the owner, of the copyrighted work described.
capcha
Download Presentation

PowerPoint Slideshow about ' Epidemiologia della tubercolosi in Toscana' - aria


An Image/Link below is provided (as is) to download presentation

Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author.While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server.


- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E N D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Presentation Transcript
la rete dei laboratori
La rete dei laboratori
  • Laboratori di I livello
    • Invio dei campioni al rispettivo laboratorio di II livello per l’esecuzione della coltura
  • Laboratori di II livello
    • Conservazione di tutti i ceppi di M. tuberculosis complex
    • Raccolta delle notizie epidemiologiche
    • Invio di ceppi e schede al Laboratorio di III livello
  • Laboratorio di III livello
    • Esecuzione o completamento dell’identificazione
    • Eventuale esecuzione dell’antibiogramma
    • Conservazione dei ceppi
    • Elaborazione dei dati epidemiologici
    • Studio dei ceppi a livello molecolare (Univ. Pisa)
gli aderenti
Gli aderenti
  • Tutte le Aziende dell’area fiorentina
  • Microbiologia Ospedale di Arezzo
  • Microbiologia Ospedale di Grosseto
  • Microbiologia Ospedale di Lucca
  • Microbiologia Università di Pisa
  • Malattie Infettive Ospedale di Pistoia
  • Malattie Infettive Ospedale di Prato
  • Microbiologia Università di Siena
  • Microbiologia Ospedale di Empoli
slide13

http//:www.ao-careggi.toscana.it/microbiologia/CRRM/ITAL/epi.htmhttp//:www.ao-careggi.toscana.it/microbiologia/CRRM/ITAL/epi.htm

epidemiologia molecolare
Epidemiologia molecolare
  • Ricerca di marcatori, all’interno del genoma del microorganismo, dotati di specificità di ceppo
  • Permette di ricostruire i flussi epidemici
  • Permette di raggruppare i ceppi in grandi “famiglie” che riflettono il cammino dell’evoluzione
rflp anno 2002
RFLP: anno 2002
  • Ceppi raccolti: 245
  • Pattern RFLP: 215
  • Cluster
    • di 2 ceppi: 19
    • di 3 ceppi: 3
    • di 4 ceppi: 1
  • Nessun focolaio epidemico
  • Tre contaminazioni di laboratorio
il locus dr

DR

DR

DR

DR

DR

DR

DR

DR

DR

DR

DR

DR

1 5 10 15 20 25 30 35 40

2

2

5

5

6

6

1

1

4

4

BCG

DR

2

2

3

3

5

5

6

6

1

1

4

4

H37Rv

DR

spaziatore

Il locus DR
  • Da 9 a 50 sequenze ripetute di 36 bp (DR) inframmezzate da sequenze non ripetute di 35-41 bp (spaziatori)
spoligotyping
Spoligotyping

BCG

H37Rv

X

5 10 15 20 25 30 35 40

i ceppi beijing
I ceppi Beijing
  • I ceppi della famiglia Beijing hanno soltanto gli spaziatori 35-43
  • Individuati 7 ceppi Beijing pari al 3%

5 10 15 20 25 30 35 40

H37Rv

Beijing

i ceppi beijing1

804

836

763

952

669

884

974

1 5 10 15 20 25 30 35 40

I ceppi Beijing
i ceppi beijing toscani

Isolato

No.

Paziente

Età

Sesso

HIV

Tubercolosi

Farmaco-resistenza

STR

INH

RIF

ETH

PZA

669

Cinese

Polmonare

S

S

S

S

S

-

40/M

763

Cinese

Polmonare

S

S

S

S

S

-

42/M

804

Cinese

Polmonare

n.t.

S

S

S

S

-

23/F

836

Cinese

Polmonare

n.t.

S

S

S

S

-

34/M

884

Italiano

Extrapolmonare

n.t.

S

S

S

S

+

39/F

952

Italiano

Polmonare

n.t.

R

S

S

S

-

28/F

974

Cinese

Polmonare

n.t.

S

S

S

S

-

27/F

I ceppi Beijing toscani
rflp e spoligotyping
RFLP e spoligotyping
  • RFLP: interessa l’intero cromosoma
    • Alto potere discriminante
    • Impossibile l’impiego dell’amplificazione
  • Spoligotyping: interessa una porzione limitata de genoma
    • Ceppi diversi possono avere identico spoligotipo
    • Possibilità di ricorso all’amplificazione
  • Possibile compromesso: esecuzione dello spoligotyping su tutti i ceppi e approfondimento mediante RFLP su quelli risultati identici o “interessanti”
raccomandazioni finali
Raccomandazioni finali
  • Centralizzazione dell’esame colturale nei Laboratori di II livello
  • Coinvolgimento dei Laboratori che non hanno ancora aderito allo studio epidemiologico
  • Esecuzione dell’antibiogramma su tutti i nuovi isolati
ad