UFR Sciences de la Vie Master Biologie Santé, 2 ème année.

1. 1 UFR Sciences de la Vie Master Biologie Santé, 2ème année. UE Agents transmissibles et non conventionnels (M2-S3-31) Durée de l’épreuve: 2 heures 1ère session 2006 Les documents ne sont pas autorisés. La notation tiendra compte de la présentation des réponses. Analyse d’articles 1er article: Int J Systematic and Evolutionary Microbiology 2004;54:337-347) Lexique Alder: aulne; cherry: cerise; elm: orme; Flavescence Dorée= jaunisse de la vigne; hemp: chanvre; jujube: jujube; peach: pêche; rubus: ronce; spartium: genêt; periwinkle: pervenche; creeper plant: plante grimpante

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3. 3 Note: pour simplifier la présentation des résultats, seules les digestions représentatives obtenues avec les enzymes Sau3AI, BfaI et RsaI sont présentées sur cette figure. 16SrV

4. 4 2ème article: Plant Pathology 2004;53:90-95 Note: les PCR sont réalisées avec comme cible l’ADNr 16S, en utilisant les mêmes amorces que celles utilisées dans le 1er article pour obtenir les produits PCR analysés après digestion sur la Figure 1.

5. 5 • QUESTIONS: • Dans ces deux articles, les auteurs ont utilisé une méthode basée sur une PCR gigogne (nested PCR) pour la détection des phytoplasmes. • . Faites un schéma annoté pour indiquer le principe de cette méthode (2 points) • . Indiquer la raison la plus plausible qui justifie l’utilisation de cette méthode dans ce cas (1 point) • . Comment pourriez vous vérifier votre hypothèse expérimentalement (3 points) • 2) Dans le premier article, les auteurs ont construit des arbres phylogénétiques (Figures 3 et 4) • . Veuillez indiquer sous la forme d’un schéma général annoté les principales étapes qui ont permis cette construction. (3 points) • 3) Quels sont les arguments scientifiques qui pourraient conduire soit à classer tous les phytoplasmes du groupe 16SrV dans une même espèce bactérienne soit à définir une espèce propre pour le phytoplasme de la jaunisse de l’orme (EY)? Argumenter votre réponse dans chacun des cas (5 points) • 4) Imaginer vous d’autres résultats expérimentaux qui pourraient renforcer l’idée que le phytoplasme de la jaunisse de l’orme appartienne à une espèce distincte de celle des autres phytoplasmes du groupe 16SrV? (2 points) • Sous la forme de quelques phrases courtes, veuillez indiquer quelles sont les principales conclusions à tirer des résultats de l’article 2 (Tableaux 1, 2 et 5). (2 points) • Sous la forme d’un schéma annoté, veuillez rappeler les différentes étapes du mode de transmission des phytoplasmes par leur insecte vecteur (2 points)