1 / 22

Vyšetření fMRI popis experimentu

Vyšetření fMRI popis experimentu. Dobrovolník II. 6.2.2001 17:00. Popis experimentu. 2.

victor-key
Download Presentation

Vyšetření fMRI popis experimentu

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Vyšetření fMRIpopis experimentu Dobrovolník II. 6.2.2001 17:00

  2. Popis experimentu 2 • Dobrovolník začne ihned po začátku měření pohybovat prsty pravé ruky tak, že se jimi střídavě dotýká palce pravé ruky. Nejprve malíček pak prsteníček, prostředníček, ukazováček a zase zpátky, pořád dokola v pravidelném rytmu. • Tuto akci provádí po 20s, poté je 20s v klidu, pak 20s aktivity, ... • Během 20s aktivity i 20s klidu provedeme 6 sérií 16ti snímků hlavy v místě motorického kortexu. Doba snímání celé série 16ti snímků byla v našem experimentu asi 1.1s. • Blíže viz obrázek na další straně

  3. Popis experimentu 3

  4. Umístění snímků 4

  5. Funkční snímky 5 Echoplanární technika (EPI) Tyto snímky jsou T2* vážené Použité parametry: TR = 1500ms TE = 37ms flip angle = 90ms FoV = 192mm Velikost pixelu: 3x3mm2 Tloušťka vrstvy = 3mm Matice 64x64 pixelů

  6. Anatomické snímky 6 Jsou umístěny v přesně stejné pozici jako funkční Jsou T1 vážené: FoV = 192mm Velikost pixelu: 0.43x0.43mm2 Tloušťka vrstvy = 3mm Matice 512x512 pixelů

  7. Předzpracování FUNKČNÍCH snímků pomocí programů MRIcro a SPM

  8. Předzpracování funkčních snímků 8 • MRIcro: • Konverze z formátu DICOM do formátu Analyze, který používá SPM - naše snímky byli umístěny v tzv. „mosaice“ (16 snímků v jednom obrázku) • SPM: • Registrace - posun a rotace všech sérií (objemů) do stejného místa jako první objem. • Normalizace - nelineární transformace objemu mozku do Talairachova prostoru • Vyhlazení - odstranění prudkých změn intenzity v obraze

  9. Registrace 9

  10. Předzpracování funkčních snímků 10 Po: registraci, normalizaci a vyhlazení Původní funkční snímek

  11. Předzpracování ANATOMICKÝCHsnímků pomocí programůMRIcro a SPM

  12. Předzpracování anatomických snímků 12 • MRIcro: • Konverze z formátu DICOM do formátu Analyze, který používá SPM - anatomické snímku již nejsou v mosaice • SPM: • Registrace a normalizace - proběhne podle parametrů vypočítaných při registraci a normalizaci fčních snímků. • Segmentace - oddělení mozkomíšního moku, šedé kůry a bílé hmoty do samostatných objemů • Nalezení „povrchu“ šedé kůry

  13. Segmentace 13 Anatomický snímek Šedá kůra mozková Mozkomíšní mok Bílá hmota

  14. Rekonstrukce šedé kůry mozkové 14

  15. Statistické vyhodnocení funkce mozku pomocí programu SPM

  16. Statistické vyhodnocení 16 • SPM: • Specifikace modelu experimentu - závisí na statistické metodě: • My jsme pro vyhodnocení použili tzv.: General Linear Model • Vyhodnocení dat podle specifikovaného modelu • Vizualizace výsledků

  17. Popis experimentu 17

  18. Vizualizace výsledků 18 Maximum Intensity Projection Tailarachův prostor

  19. Vizualizace výsledků 19 Sagitální, koronální a transverzální řez mozkem s doplněnou funkční informací

  20. Vizualizace výsledků 20 Aktivace zobrazená na šedé kůře mozkové

  21. Vizualizace výsledků 21 Aktivace na šedé kůře: Jiný způsob vizualizace - je zde vidět jak anatomická, tak funkční informace

  22. Reference 22 Veškeré informace o problematice „Statistical Parametric Mapping“u nelzenete zde: [SPM99] Members & collaborators of the Wellcome Department of Cognitive Neurology: Statistical Parametric Mapping, 2001. Dokument dostupný na URL http://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/ (únor 2001). [MRIcro] Rorden Chris: MRIcro, free Medical Imaging Software, University of Nottingham, 2000, Dokument dostupný na URL http://www.psychology.nottingham.ac.uk/staff/cr1/mricro.html (únor 2001). Zde naleznete informace o konverzi DICOM obrázků do formátu Analyze a jejich předzpracování:

More Related