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第十二章 遗传工程. 第一节 遗传工程概述 遗传工程广义:细胞工程、染色体工程 细胞器工程、基因工程 酶工程、发酵工程 狭义:基因工程 基因工程概述 基因工程是 20 世纪 70 年代初随着 DNA 重组技术的发展应运而生的一门新技术。. → 1982 年经美国食品及药物管理局批准 ,采用基因工程方法在细菌中表达生 产的人的胰岛素进入市场,成为基因 工程产品直接造福于人类的首例 → 1985 年转基因植物获得成功 → 1996 年克隆羊诞生。
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第一节 遗传工程概述 遗传工程广义:细胞工程、染色体工程 细胞器工程、基因工程 酶工程、发酵工程 狭义:基因工程 基因工程概述 基因工程是20世纪70年代初随着DNA重组技术的发展应运而生的一门新技术。
→1982年经美国食品及药物管理局批准 ,采用基因工程方法在细菌中表达生 产的人的胰岛素进入市场,成为基因 工程产品直接造福于人类的首例 →1985年转基因植物获得成功 →1996年克隆羊诞生。 →现在,人类已利用这一技术改造和创 建新的生命形态、生产药品、疫苗、 牛奶和食品,诊断和治疗遗传疾病。
基因工程的基本步骤: 1.目的基因的分离或合成 2.将目的基因与载体DNA连接,构建重组DNA分 子-表达载体 3.将重组DNA分子导入受体细胞,并获得具有外 源基因的个体 4.转基因生物的检测与鉴定 5.转基因生物的安全性评价
第二节 基因的分离 基因分离(克隆)包括3个步骤: 1. 目标DNA片段(基因)的分离 2. 目标基因克隆到载体上 3. 载体导入宿主细胞并在其中大量 复制
一、工具酶 1、限制性内切核酸酶 限制酶:作用于特定(异)核苷酸序列 的磷酸二脂酶 Ⅰ型酶:仅EcoB和EcoK两种,催化限制 性切割和修饰核苷酸2种功能 Ⅱ型酶:遗传工程中应用最广泛 Ⅲ型酶:具有特异的识别位点,识别位 点是非对称的
Ⅱ型限制性酶的基本特性: ① 有特异识别和切割的序列部位 ② DNA分子上两个单链断裂的部位通 常不是直接相对的 ③ 断裂所形成的DNA片段常具有碱基 互补的单链尾巴(粘性末端) ④ 内切酶的切割和修饰功能由两个 不同的酶催化所完成,即内切酶 活性和甲基化作用活性是分开的
回纹序列 限制性内切酶EcoRI的酶切位点及酶切产物连接
图12-1通过用相同的限制性内切酶切割 形成一个重组DNA分子
平齐末端 限制性内切酶SmaI的识别及酶切位点
2、DNA连接酶 DNA连接酶是重组DNA分子构建必不可少的工具酶,能催化DNA中相邻的3’ –OH和5’ – 磷酸基末端之间形成磷酸二酯键并把两段DNA连接起来
3、反转录酶 反转录酶是一类以RNA为模板来指导DNA合成的DNA聚合酶,故又称依赖于RNA的DNA聚合酶 通常用反转录酶构建cDNA文库(cDNA library)
4、聚合酶链式反应(PCR) PCR是体外快速扩增DNA的方法,由美国的Mullis(1986)发明, 1993年诺贝尔化学奖 PCR可对特定DNA片段进行扩增,且可用痕量DNA作模板,对DNA纯度要求也不高,可在几小时内使目的基因片段扩增到数百万个拷贝 PCR反应在一种混合液中进行,该混合液包括四种主要成分:两个引物(一般为20 bp)、模板DNA、热稳定的DNA聚合酶(Taq酶,在95℃甚至更高的温度下活性稳定)和四种脱氧核苷酸。PCR反应在PCR仪上自动进行
PCR反应从启动到结束称为一个循环,每个循环包括三个步骤:PCR反应从启动到结束称为一个循环,每个循环包括三个步骤: 1)变性:95℃,DNA 双链分离成单链 2)退火(复性):55℃ 左右,引物与单链的 模板DNA序列互补结合 3)延伸:72℃左右, Taq酶通过在引物 的3’-OH端增加碱基的 办法使引物延伸
二、载体 • 1、重组DNA技术 • 重组DNA:指利用不同生物来源的DNA分子拼接的杂种DNA • 分子,是自然界中不存在的DNA分子 • 重组DNA技术是基因克隆的关键技术,其主要步骤为: • 1) 从细胞或组织获得DNA并纯化 • 2) 用限制酶切割DNA • 3) 将获得的限制片段连接到载体上,形成重组DNA分子 • 4) 重组DNA导入宿主细胞,在宿主细胞内复制,产生大 • 量相同拷贝的重组DNA分子--克隆 • 5) 克隆的DNA分子可以从宿主细胞中回收,纯化 • 6) 克隆的DNA可以转录和翻译,其产品可以被分离出来 • 用于研究或商业开发。
2、载体 载体:将外源基因送入受体细胞的工具 载体类型:细菌质粒、噬菌体或病毒、细菌/酵母菌人工染色体BAC、YAC等 载体特点: ① 在宿主细胞中能独立复制,即本身为复制子 ,有独立的复制起始位点 ② 有限制酶切位点,允许外源基因插入且插入 后随载体DNA分子一同进行复制或扩增 ③ 有选择标记,便于选择含重组DNA分子的寄主 细胞 ④ 分子量小,多拷贝,易于操作 ⑤ 具有安全性等
(1)细菌质粒:广泛应用于基因工程 图12-6 质粒PUC18的结构及多克隆位点
Ti质粒及其衍生载体 Ti质粒包括五个区域,1. LB与RB之间的T-DNA,这段序列整合到植物基因组中; 2. 质粒转移区(PT); 3. 冠瘿碱代谢区; 4. 复制原点; 5. 毒性区。
→T-DNA区域内的所有基因与转移无关,所以将致瘤基因全部缺失即卸甲(disarmed)后,将细菌抗生素的抗性基因或其它序列插入到这个区域,形成的T-DNA仍可将RB至LB内的序列转移并整合到植物基因组。→T-DNA区域内的所有基因与转移无关,所以将致瘤基因全部缺失即卸甲(disarmed)后,将细菌抗生素的抗性基因或其它序列插入到这个区域,形成的T-DNA仍可将RB至LB内的序列转移并整合到植物基因组。 →Vir区的毒性基因是T-DNA转移所必需的,毒性基因可以顺式及反式两种方式控制T-DNA转移。
Ti质粒是约150-200kb的环状DNA分子,很难直接使用,故需对其加以改造,构建出Ti质粒的衍生载体系统,广泛用作植物基因工程中的载体:Ti质粒是约150-200kb的环状DNA分子,很难直接使用,故需对其加以改造,构建出Ti质粒的衍生载体系统,广泛用作植物基因工程中的载体: (1)双元载体(binary vectors) 如pBin19载体,具有原核生物的卡那霉素抗性基因(AphⅠ)作为细菌选择标记,真核生物的卡那霉素抗性基因(nos-NptⅡ)作为植物的选择标记,pUC19的多克隆位点及α-互补显色标记 (2)共整合载体(integrated vectors)
(2)噬菌体载体 1、噬菌体; 2、噬菌体DNA; 3、噬菌体DNA中间 基因簇; 4、将连接物体外包装后感染细菌,制备基因库(用于基因库构建)
(3)克隆大片段DNA的载体 粘粒载体 克隆外源 片段的长 度在15~ 45kb之间
细菌人工染色体(BAC) 上述的几种载体都不能携带大于50kb的外源DNA片段, 而很多真核生 物基因长度在 50kb以上。细 菌人工染色体 载体就是为 克隆更大的外 源DNA片段而设 计构建的 图12-9 细菌人工染色体载体pBAC 108L 及其多克隆位点。可插入达300kb 左右的DNA片段
酵母人工染色体(YAC) YAC载体可以插入 大片段的DNA (1-2Mb),成为 人类基因组计划( HGP)的一种重要 工具
三、基因分离方法 一个基因就是编码一条多肽链的一个DNA片段,包括启动子、终止子及内含子。 利用DNA重组技术,可从一个含有10万个基因的大基因组中,准确地分离出特异的单个目的基因。分离与鉴定基因是DNA重组中的关键步骤之一。
1、基于文库的基因分离方法 基因文库(library):是一组DNA和cDNA序列克隆的集合体。从基因库中分离基因,首先要构建基因文库 (1)构建基因文库 基因组文库:使用与切割质粒相同的限制性内切酶,将供体生物体的基因组DNA切成许多片段,然后将其连接到载体上构成的一个重组DNA群体 cDNA文库:以mRNA为模板,在反转录酶作用下,合成cDNA,将其与适当载体连接并转化到宿主细胞内进行扩增构建成的基因库。克隆特定基因
(2)筛选基因库 大多数方法是利用一段核苷酸序列(DNA,cDNA或寡核苷酸)作探针(probe),用放射性同位素或非放射性同位素标记探针,也可用抗体作探针,筛选基因库 如:筛选λ噬菌体构建的库常利用菌落杂交法:将经重组噬菌体(来自基因库)感染的宿主细菌细胞与培养基混合后,倒在培养皿中,培养过夜,形成噬菌斑
(3)阳性克隆的分析与鉴定 从基因库中筛选出的阳性克隆,还需进一步分析、鉴定,才能得到目的基因 生物信息分析 功能预测 、功能鉴定
2、T-DNA标签克隆基因 利用T-DNA插入突变 创造突变体,获取目 标基因或克隆 T-DNA 载体构建 转化植物(T1,T-DNA杂合子)收获T2种子 筛选T2,获突变子,应为3:1分离 确定T-DNA与突变型共分离的个体 产生纯合后代 克隆T-DNA两侧的植物DNA 利用侧翼DNA序列作探针从cDNA文库中钓取基因 基因功能的验证(遗传互补测验,分离的 野生基因转化突变体,回复功能) 图12-12 T-DNA标签克隆基因的基本原理
3、基于PCR的基因克隆 PCR可在数小时内使目的基因片段扩增到数百万个拷贝,可代替一些经载体克隆基因的方法。其原理是根据待扩增基因的序列合成引物,使两个引物序列之间的基因序列获得大量扩增,产生大量的基因拷贝用于研究 4、基因的人工合成 对于已知核苷酸序列、分子量较小的基因可以通过化学合成法制备基因。一般先一段一段地合成,然后将这些小片段连接起来。人工合成基因可以由DNA自动合成仪来完成
第三节 外源基因的导入 一、农杆菌介导的遗传转化 1、根癌农杆菌(Ti质粒)
2、发根农杆菌(Ri质粒) 发根农杆菌侵染后植物细胞产生许多不定根,这种不定根生长迅速,不断分枝成毛状,故称之为毛状根(发状根) Ri质粒的结构与Ti质粒的结构很相似,可以分为T区、vir区、ori区和其它区域等几个部分。 T区与Ti质粒的T-DNA十分相似,包括①T区的左右边界序列;②TL-DNA区;③TR-DNA区。
3. 筛选获得的抗性愈伤 1. 共培养 2. 在选择培养基上筛选 5. 胚萌发成苗 6. 转基因植株移栽大田 F 4. 抗性愈伤分化成胚状体 图12-15 棉花转基因植株生产过程
二 、农杆菌介导的遗传转化 基因枪法\生物弹法\微粒枪法\微粒轰击法 依赖高速的金属微粒将外源基因导入活细胞的一种转化技术。基因枪法是继农杆菌介导法之后又一应用较广的遗传转化技术。其优点是该方法无宿主限制,可以对任何基因型材料进行转化研究
第四节 转基因生物的检测与鉴定 PCR Southern blot Northern blot Western blot 性状 (表型)鉴定
M 1 23 4 5 67 8 9 PCR Southern blot
第五节 基因工程的应用 一、基因工程的应用 1、转基因植物 抗除草剂、抗虫、抗病、 抗逆的优良品系或品种, 很多已经大面积种植推 广。 2002年5000万公顷: 大豆、玉米、棉花、 水稻、马铃薯、番茄、 小麦等
3、基因工程工业 生产胰岛素等 在细菌中产生胰岛素的方法
4、遗传疾病诊断 RFLP法(镰刀性贫血病)
5、基因治疗 利用基因工程技术,将特异基因导入并整合到具有遗传缺陷的患者的基因组中,以治疗遗传疾病 基因治疗的载体和重组DNA分子
6、DNA芯片 DNA芯片(DNA chips)是将核酸分子杂交的原理和方法,与半导体技术结合而发展形成的一门新技术
二、安全问题 1、转基因植物成为杂草 2、导致新的病虫害,威胁生物 多样性 3、食品安全性