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http://esilbac1.esi.umontreal.ca/~lajoimat. Introduction à la bio-informatique Mathieu Lajoie 1er août 2008 Département de Biochimie Université de Montréal. Biologie: Science du vivant. Informatique: Science du traitement automatique et rationnel de l'information*.
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Introduction à la bio-informatique Mathieu Lajoie 1er août 2008 Département de Biochimie Université de Montréal
Biologie: Science du vivant. Informatique: Science du traitement automatique et rationnel de l'information*. *« L'informatique n'est pas plus la science des ordinateurs que l'astronomie n'est celle des télescopes » - Edsger Dijkstra
Menu du Jour Entrée Protéines, ADN et Gènes (dans leur Cellule) Plat de résistance La bio-informatique en action Dessert La recherche et les études en bio-informatique Apportez vos question...
La cellule Membrane Protéine ADN ARNm Noyau
Les protéines sont à la base de la vie Kératine, collagène, hémoglobine, insuline, rhodopsine ...
Les protéines sont des chaines d'acides aminés repliées sur elles-mêmes
L'ADN contient l'information pour fabriquer les protéines AT GC TA TA CG CG AT
AT GC TA C C A T G T G A TA CG A G G T T C C A CG AT On peut lire l'ADN...
Le Génome Humain Chromosome 1 A ATGGATAGCATCGATCGATGAAAAAAAAAAAAAAGCAAGTATCATCCTTAGATAGTTCT ATAAGAAGCTAGAGGAGACCTTAACACATGAACAGAAAGAAGGACGACGACGACGAC CTTCCTATTTCTGAAGACTATAAAGCTTCTGAAAGGTTGAGGGGTAACATCTCTCTTTCCTGTTCAAGTTAAGACCTTTGGTCCTTATATGAAGGAAAAGATTTAATAGCTCAAGCACAGACGGGAACAGGAAAGAAAGACATTCTATTTTGCGCCCTTTGATTGAAAGACTCCAAAGAGATCAAGAAACAGTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTGAGACAGAATCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCGCCCGGGTTCACACCATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCACCCCCGACTATTTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACCCAGCTCTGATTGGATCTTTCTAAACTGTGCCATGTTGTGCTTGATGAAGTGGATCAAATGTTAGAGTTAGGTTTTGCTGAACAAGTTGAAGATATTATTCATGAATTCTACAAAACTGATTCTGAAGACAGTCCTCAGACTTTACTTTTTTCTGCAGCTCGCCCACAGTGGGTATGCAAAGTTGCAAAAAAATGAGTGAAATCCAGATACGAACAGATTGATGTTTTTGGAAAAATGACTCAAAAGGCTGCAGCTTCTGTGGAACATTTGGCCATCCGGTGTCATTGGTTCAGAGGCCAGCAGTTACTGGAGATGTCCTTCAAGTCTACAGTGGGTCTGAAGGGACGGCTATTATTTTCTGTGAGACCCAGAGGAGTGTAACTGAAATAGCCATGAATCCACACATAAAACAGAATGCCCAGTGTTTACATGGGGACATTGCACAGTCACAAAGAGAATTTACACTAAAAGACTTCAGAGAAGGTAGTTTTAAAGTTTTGGTGCAACCAACGTGGCTGCCTGTGGTTTGGACATTCCTGAAGTTGACCTGGTGATTCATGGTTCTCCTCCTAGGATGTTGAGTCTATATCCATCGTTCTGGACGCACAGGTAGAGCTGGACAGACAGGGATTTGTATATGTTTTTATCAACCAAGAGAAAGAGGTCAACTAAGATATGTGGAACAAAAAGTAGGAATTACTTTTAAATGTGTAGGTATTCCTTCTACAATGGATTTAGTTAAATCTAAAAGCACGGATGCCATAAGGTCTCTGGCTTCTGTTTCTTATGCTGCTGTTGATTTTTTCCAACCATCAGCTCAGATACTGACAGAAGAGAAAGGGGCAGTGGATGCATTGGCTGG page 1
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Le Génome Humain Chromosome 1 A ATATGAAAAAAAAAAAGCAAGTATCATCCTTAGATAGTTCTACTCATGAATCAAGTG ATAAGAAGCTAGAGGAGACCTTAACACATGAACAGAAAGAAGGAACCTTCTCCAAT CTTCCTATTTCTGAAGACTATAAAGCTTCTGAAAGGTTGAGGGGTAACATCTCTCTTTCCTGTTCAAGTTAAGACCTTTGGTCCTTATATGAAGGAAAAGATTTAATAGCTCAAGCACAGACGGGAACAGGAAAGAAAGACATTCTATTTTGCGCCCTTTGATTGAAAGACTCCAAAGAGATCAAGAAACAGTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTGAGACAGAATCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCGCCCGGGTTCACACCATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCACCCCCGACTATTTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACCCAGCTCTGATTGGATCTTTCTAAACTGTGCCATGTTGTGCTTGATGAAGTGGATCAAATGTTAGAGTTAGGTTTTGCTGAACAAGTTGAAGATATTATTCATGAATTCTACAAAACTGATTCTGAAGACAGTCCTCAGACTTTACTTTTTTCTGCAGCTCGCCCACAGTGGGTATGCAAAGTTGCAAAAAAATGAGTGAAATCCAGATACGAACAGATTGATGTTTTTGGAAAAATGACTCAAAAGGCTGCAGCTTCTGTGGAACATTTGGCCATCCGGTGTCATTGGTCTCAGAGGCCAGCAGTTACTGGAGATGTCCTTCAAGTCTACAGTGGGTCTGAAGGGACGGCTATTATTTTCTGTGAGACCCAGAGGAGTGTAACTGAAATAGCCATGAATCCACACATAAAACAGAATGCCCAGTGTTTACATGGGGACATTGCACAGTCACAAAGAGAATTTACACTAAAAGACTTCAGAGAAGGTAGTTTTAAAGTTTTGGTGCAACCAACGTGGCTGCCTGTGGTTTGGACATTCCTGAAGTTGACCTGGTGATTCATGGTTCTCCTCCTAGGATGTTGAGTCTATATCCATCGTTCTGGACGCACAGGTAGAGCTGGACAGACAGGGATTTGTATATGTTTTTATCAACCAAGAGAAAGAGGTCAACTAAGATATGTGGAACAAAAAGTAGGAATTACTTTTAAATGTGTAGGTATTCCTTCTACAATGGATTTAGTTAAATCTAAAAGCACGGATGCCATAAGGTCTCTGGCTTCTGTTTCTTATGCTGCTGTTGATTTTTTCCAACCATCAGCTCAGATACTGACAGAAGAGAAAGGGGCAGTGGATGCATTGGCTGGT gène page 1
Structure et fonctionnementd'un gène ACGATCTGGATCGCTAGCTTCGGCTCGATTATGGATAGA... ADN
Structure et fonctionnementd'un gène ACGATCTGGATCGCTAGCTTCGGCTCGATTATGGATAGA... ADN
Structure et fonctionnementd'un gène CGC TAG CUU TAU CUC CGC TAU TAG ARNm ACGATCTGGATCGCTAGCTTCGGCTCGATTATGGATAGA... ADN
Structure et fonctionnementd'un gène Protéine CGC TAG CUU TAU CUC CGC TAU TAG ARNm ACGATCTGGATCGCTAGCTTCGGCTCGATTATGGATAGA... ADN
Structure et fonctionnementd'un gène ACGATCTGGATCGCTAGCTTCGGCTCGATTATGGATAGA... ADN
Une première application de la bio-informatique: l'assemblage des génomes
AGTTAAGACCTTTGGTCCTTATATGAAGGAAAAGATTTAATAGCTCAAGCACAGACGGGAACAGGAAAGAAAGACATTCTATTTTGCGCCCTTTGATTGAAAGACTCCAAAGAGATCAAGAAACAGTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTGAGACAGAATCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCGCCCGGGTTCACACCATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCACCCCCGACTATTTTTTTCCTGTTCAAGTTAAGACCTTTGGTCCTTATAT AGTTAAGACCTTTGGTCCTTATATGAAGGAAAAGATTTAATAGCTCAAGCACAGACGGGAACAGGAAAGAAAGACATTCTATTTTGCGCCCTTTGATTGAAAGACTCCAAAGAGATCAAGAAACAGTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTGAGACAGAATCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCGCCCGGGTTCACACCATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCACCCCCGACTATTTTTTTCCTGTTCAAGTTAAGACCTTTGGTCCTTATAT AGTTAAGACCTTTGGTCCTTATATGAAGGAAAAGATTTAATAGCTCAAGCACAGACGGGAACAGGAAAGAAAGACATTCTATTTTGCGCCCTTTGATTGAAAGACTCCAAAGAGATCAAGAAACAGTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTGAGACAGAATCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCGCCCGGGTTCACACCATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCACCCCCGACTATTTTTTTCCTGTTCAAGTTAAGACCTTTGGTCCTTATAT AGTTAAGACCTTTGGTCCTTATATGAAGGAAAAGATTTAATAGCTCAAGCACAGACGGGAACAGGAAAGAAAGACATTCTATTTTGCGCCCTTTGATTGAAAGACTCCAAAGAGATCAAGAAACAGTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTGAGACAGAATCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCGCCCGGGTTCACACCATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCACCCCCGACTATTTTTTTCCTGTTCAAGTTAAGACCTTTGGTCCTTATAT AGTTAAGACCTTTGGTCCTTATATGAAGGAAAAGATTTAATAGCTCAAGCACAGACGGGAACAGGAAAGAAAGACATTCTATTTTGCGCCCTTTGATTGAAAGACTCCAAAGAGATCAAGAAACAGTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTGAGACAGAATCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCGCCCGGGTTCACACCATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCACCCCCGACTATTTTTTTCCTGTTCAAGTTAAGACCTTTGGTCCTTATAT
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Activité 1 Visualisation des molécules biologiques
Organisation des données biologiques
Étudier l'évolution des espèces et de leur génome
T C C T A G G A A G G T T C C A Comment évolue l'ADN ? C C A G T G
KABOUMMMM !!!!! Fiou !
mutation T A Apparition de nouvelles espèces(spéciation) ... ACT... ... ACA ... ... ACT...
~450 millions d’années ~90 millions ~80 millions ~50 millions ~6 millions
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