1 / 14

Počítačová chemie

T-exkurze podzim 2011. Počítačová chemie. …. Moje nejoblíbenější předměty ve škole (navštěvuji gymnázium) jsou chemie, informatika a matematika. Byla jsem nadšená, když jsem zjistila, že existuje relativně nový obor – chemoinformatika , protože kloubí moje dva velmi oblíbené předměty.

sloan
Download Presentation

Počítačová chemie

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. T-exkurze podzim 2011 Počítačová chemie

  2. … • Moje nejoblíbenější předměty ve škole (navštěvuji gymnázium) jsou chemie, informatika a matematika. • Byla jsem nadšená, když jsem zjistila, že existuje relativně nový obor – chemoinformatika, protože kloubí moje dva velmi oblíbené předměty.

  3. Co mě vedlo k přihlášení se do t-exkurze, téma Počítačová chemie? • Chtěla jsem se dozvědět, co vůbec znamená spojení chemie a počítačů v praxi, poněvadž moje dosavadní poznatky nebyly dostačující. • Věděla jsem, že je to nějaké ,,tvoření molekul proteinů za účelem objevování léků“, ale nic víc ne.

  4. Co jsem se v t-exkurzi naučila? • Že základním stavebním kamenem proteinů jsou AMINOKYSELINY (vyskytuje se jich 20). • Že proteiny jsou BIOMOLEKULY spolu s nukleovými kyselinami, lipidy a sacharidy. • Že z BIOMOLEKUL jsou vystaveny VŠECHNY ŽIVÉ ORGANISMY.

  5. Jaká je struktura biomolekul?

  6. Aminokyseliny jsou navzájem propojeny PEPTIDOVÝMI VAZBAMI- tímto spojením vznikají POLYMERY.

  7. Primární struktura aminokyselin je držena pohromadě pouze KOVALENTNÍMI VAZBAMI.

  8. Sekundární struktura aminokyselin = primární struktury uspořádané do pravidelně se opakujícího motivu tvořícího buď ŠROUBOVICI (alfa-helix) a nebo STRUKTURU TZV. BETA SKLÁDANÉHO LISTU (beta-sheet). Interakce je VODÍKOVÁ.

  9. Terciální struktura = libovolné opakování alfa-helixů nebo beta-listů. Hlavní interakce je VODÍKOVÝ MŮSTEK a orientace hydrofilních a hydrofobních postranních řetězců aminokyselin.

  10. Existuje i kvartérní struktura, která je tvořena vzájemnou interakcí proteinových řetězců. Tvoří OLIGOMERNÍ STRUKTURY.

  11. A co dál? • Dozvěděla jsem se, kde a jak stáhnout program na prohlížení různých proteinů. • Program se jmenuje VDM. • Funguje tak, že si na stránce s databází proteinů (www.pdb.org) stáhnete strukturu vámi vybraného proteinu (na dalším sledu je alanin) a ,,hrajete si s ním“.

  12. Jak vypadá VDM?

  13. Další prožitky a poznatky už říct nemůžu, protože jsem se kvůli nemoci nemohla zúčastnit praktické části. • I přes to jsem se však o tomto tématu dozvěděla zase o něco více a jsem za to velice ráda.

  14. Na závěr… • T-exkurze mi přijde jako výborný nápad, protože dovoluje studentům, kteří ,,chtějí něco víc“, se opravdu něco víc dozvědět. • Anna Popková, Gymnázium Boskovice

More Related