系统发育树相关问题
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系统发育树相关问题. 曾繁旭. 目录. 结论 1 结论 2 结论 3 结论 4. 结论 1. 从 PEM 自身来看,它们有着共同的始祖 ( 图 1-9 ) 各个酶的 PEM ( Polyene macrolide antibiotics )内部的 identities 均高于 54%. 结论 2. 虽然 PEM 可能有共同的始祖,但是各个产生菌菌株中 PEM 合成基因组的进化是独立的。

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Presentation Transcript

目录

  • 结论1

  • 结论2

  • 结论3

  • 结论4


结论1

  • 从PEM自身来看,它们有着共同的始祖(图1-9)

  • 各个酶的PEM(Polyene macrolide antibiotics)内部的identities均高于54%


结论2

  • 虽然PEM可能有共同的始祖,但是各个产生菌菌株中PEM合成基因组的进化是独立的。

  • P450中部分PEM(nystatin, amphotericin, pimaricin)含有两个P450分别修饰两个不同位点的化学结构,但FR-008, rimocidin, candicidin中只有一个P450。图4-5


  • ABC转运蛋白具有四个系统发育学分类。一般认为PEM的ABC转运蛋白是以二聚体形式发挥功能。

  • PEM中Nystain,Amphotericin,Pimaricin为一组,而FR-008 和 candicidin为一组。(图6-9)


  • 以上皆说明Nystain,Amphotericin,Pimaricin可能在进化上具有较近的关系,而Fr-008独自具有一条进化路径。


结论3

  • Nystain 和Amphotericin 可能具有同Pseudonocardia autotrophica 和Pseudonocardia sp. P1 共同的进化来源。

  • Pimaricin 和Streptomyces chattanoogensis可能具有共同的进化来源,而rimocidin 也有可能处于这个进化分枝。

  • FR-008 则可能与candicidin 同 Streptomyces albus J1074 具有共同进化来源。(图1-9)


  • Pseudonocardia autotrophica的基因组中基因的分布和nystatin 基因组中对应基因的分布几乎一致。

  • Pseudonocardia autotrophica 与nystatin 和amphotericin 对应后修饰酶的基因的identities的范围在69%-90%。

  • Streptomyces chattanoogensis和Pimaricin 的基因组中对应基因分布几乎一致。

  • 它们两者对应基因identities为90%左右。


结论4

  • 各个后修饰酶的进化来源是不一致的

  • 涉及到糖基部分的三个酶糖基脱水酶,氨基转移酶,糖基转移酶可能是水平基因转移的结果。





对于糖基转移酶,其系统发育树中也含有大量其它门类的生物。但是来自原核生物的除1 糖基脱水酶的系统发育树


对于糖基转移酶,其系统发育树中也含有大量其它门类的生物。但是来自原核生物的除2 氨基转移酶系统发育树


对于糖基转移酶,其系统发育树中也含有大量其它门类的生物。但是来自原核生物的除3 糖基转移酶系统发育树


对于糖基转移酶,其系统发育树中也含有大量其它门类的生物。但是来自原核生物的除4 P450NysL部分的系统发育树


对于糖基转移酶,其系统发育树中也含有大量其它门类的生物。但是来自原核生物的除5 P450NysN部分系统发育树


对于糖基转移酶,其系统发育树中也含有大量其它门类的生物。但是来自原核生物的除6 ABC转运蛋白PimB部分


对于糖基转移酶,其系统发育树中也含有大量其它门类的生物。但是来自原核生物的除7 ABC转运蛋白PimA部分


对于糖基转移酶,其系统发育树中也含有大量其它门类的生物。但是来自原核生物的除8 ABC转运蛋白FscTI部分


对于糖基转移酶,其系统发育树中也含有大量其它门类的生物。但是来自原核生物的除9 ABC转运蛋白FscTII部分


Thank You!对于糖基转移酶,其系统发育树中也含有大量其它门类的生物。但是来自原核生物的除


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