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实验 16 大肠杆菌的重组子遗传分析 ( 4 学时) 一、实验目的 了解大肠杆菌的杂交技术,并掌握大肠杆菌的重组子遗传分析。. 二、基本原理
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实验16 大肠杆菌的重组子遗传分析 (4学时) 一、实验目的 了解大肠杆菌的杂交技术,并掌握大肠杆菌的重组子遗传分析。
二、基本原理 大肠杆菌的杂交与致育因子F有关。有F因子的细菌称为F十,没有F因子的细菌称为F-。一般F-菌株之间不能进行杂交。F因子有两种状态—游离状态和整合状态(F因子插人到染色体的一定位置上,所以F因子是附加体),前者称F+菌株,后者称为高频重组或Hfr。F+和Hfr都能与F-菌株进行杂交,但重组频率不同。在大肠杆菌的接合中,F+和Hfr是供体菌,而F-是受体菌。在F+与F-杂交中,F因子由F+供体转移到F-受体,大部份受体变为F+。在Hfr与F-杂交中,Hfr供体的染色体由原点开始转移进人受体菌,但F因子在最后,一般不能转移进入受体,所以受体仍为F-细菌。
杂交实验有各种不同方法,这里介绍的是直接混合培养和液体培养。直接混合培养法操作简单,适用于确定二个菌株间能否杂交或测定重组频率的高低;而液体培养适宜于细菌的基因定位。杂交实验有各种不同方法,这里介绍的是直接混合培养和液体培养。直接混合培养法操作简单,适用于确定二个菌株间能否杂交或测定重组频率的高低;而液体培养适宜于细菌的基因定位。 在大肠杆菌的Hfr与F-杂交实验中,为了避免供体细菌的生长,必须对供体细菌进行反选择。所以供体要用不同于受体(F-)的营养缺陷型菌株,或对某种抗菌素敏感的菌株,以作反选择的性状。
根据遗传学的研究,知道大肠杆菌的染色体是环状的、封闭的单倍基因组。在Hfr×F-中,Hfr的染色体由原点开始向F-转移,Hfr细菌的基因按一定的顺序依次地出现在F-受体中。所以离原点较近的基因先进入F-受体,重组频率高,出现的重组子多;而离原点远的基因,进入F-细胞迟,重组频率低,出现的重组子少。因此Hfr菌的基因在重组子中呈梯度出现,提供了基因定位的可能性。根据遗传学的研究,知道大肠杆菌的染色体是环状的、封闭的单倍基因组。在Hfr×F-中,Hfr的染色体由原点开始向F-转移,Hfr细菌的基因按一定的顺序依次地出现在F-受体中。所以离原点较近的基因先进入F-受体,重组频率高,出现的重组子多;而离原点远的基因,进入F-细胞迟,重组频率低,出现的重组子少。因此Hfr菌的基因在重组子中呈梯度出现,提供了基因定位的可能性。
大肠杆菌的重组频率较低,即使是高频重组,其重组频率也在10-3-10-4。为了在一个较大的杂交群体中发现为数较少的重组子,就要应用选择性培养基。亲本细胞在选择性培养基上不能生长,只有重组子能生长,因此在选择性培养基上长的菌落即为重组子。大肠杆菌的重组频率较低,即使是高频重组,其重组频率也在10-3-10-4。为了在一个较大的杂交群体中发现为数较少的重组子,就要应用选择性培养基。亲本细胞在选择性培养基上不能生长,只有重组子能生长,因此在选择性培养基上长的菌落即为重组子。 • 然后再分析一定数量的重组子中各非选择性标志的分离。在我们的实验中,选用各种糖发酵基因作为非选择性标志,根据各非选择性标记的重组百分数,确定这些糖发酵基因在染色体上的位置。
本试验的适宜条件是在新鲜的肉汤培养液中,以4×108/毫升的F一细菌和2×10-7/毫升的Hfr混合,其比例是一个Hfr菌对20个F-菌,37℃ 通气接触90分钟。然后稀释取样,以使每皿得到适量的重组子作为原始培养皿,再用影印培养法分析非选择性标志的分离。
二、实验材料 • 大肠杆菌(Escherichia colt K12) 的四个菌株: • K12 pro(λ)F+;W1485 his ilv F+;W1177 thr leu thi xyl gal ara mtl mal lac strr(λ)F-;HfrC met try。
三、器皿及试剂 • 1.用具: 培养皿(9厘米),灭菌三角瓶(150毫升),灭菌吸管(1, 5,10毫升),灭菌离心管,灭菌空试管,圆木柱,丝绒。 • 2. 培养基: • (1) 基本培养基Vogel 50×):MgS04.7H2O 10克,柠檬酸100克,NaNH4HPO4·4H,0 175克,K2HPO4 500克(K2HPO4.3H2O 644克),蒸馏水约1,000毫升(配好后放入冰箱保存备用)。
(2)平板用基本培养基:Vogel 50×2毫升,葡萄糖2克,琼脂2克,蒸馏水98毫升,pH7.0,高压灭菌8磅30分钟。 • (3)液体完全培养基(肉汤培养基):牛肉膏0.5克,蛋白陈1克,NaCl 0.5克,蒸馏水100毫升,pH 7.2,高压灭菌15磅15分钟。 • (4)固体基本培养基:Vogel 50× 2毫升,葡萄糖2克,琼脂2克,蒸馏水98毫升,pH7.0,高压灭菌8磅30分钟。 • (5)半固体培养基:琼脂0.7-1克,蒸馏水100毫升,pH7.0,高压灭菌15磅15分钟。
(6) EMB培养基(eosin methylene blue伊红美蓝):糖1克,多陈0.8克,NaCl 0.5克,K2HPO40.2克,伊红0.04克,美蓝0.0065克,琼脂2克,蒸馏水100毫升,pH7.2, 高压灭菌8磅20分钟。 • (7)NaN3培养基:牛肉膏0.5克,蛋白陈1克,NaCl 0.5克,NaN3 0.002M,琼脂2克,蒸馏水100毫升,pH7.2,高压灭菌15磅15分钟。 • 3.生理盐水: • NaCl 0.85克,蒸馏水100毫升,高压灭菌15磅15分钟。
四、实验步骤 (一)杂交 • 1.菌液制备: • (1)实验前14-16小时,从冰箱保存的斜面菌种,挑少量菌于盛有5毫升完全液体培养基的三角烧瓶中;每一个菌株接种一瓶,共接种4瓶,置37℃培养过夜。 • (2)取出培养过夜的细菌,在W1177一瓶菌液中加人5毫升新鲜的完全培养液,充分摇匀,等量分成2瓶;其余3瓶菌液分别用灭菌的5毫升吸管,各吸出2.5毫升菌液,然后再各加人2.5毫升新鲜的完全培养液,充分摇匀,各菌于37℃ 继续培养3-5小时。
(3)自温箱取出三角烧瓶,分别倒人离心管,菌株W1177 倒二支离心管,其余菌株各倒入一支离心管,离心沉淀,3,500转/分,离心10分钟。 • (4)倒去上清液,加入无菌水,打匀沉淀,离心洗涤3次,再加无菌水到原体积。 • 2.杂交— 混合培养: • (1)取12支灭菌试管,每支吸入3毫升经融化的半固体培养基,并保温在45℃(保温温度不宜高,北方气温低,可降低半固体中的琼脂量)。
(2) 12支试管分成三个杂交组合,即W1177 ×K12pro; W1177 × W1485; W1177 ×HfrC。每个组合各4支试管,其中2支对照,2支混合菌液。 (3)对照组试管各吸F+或Hfr供体菌菌液1毫升,其余按杂交组合各吸供体菌和受体菌菌液0.5毫升,充分混匀。 (4)将各试管中含菌的半固体倒在有Vogel培养基底层的平板上,摇匀待凝,放37℃培养,48小时后观察(图9-1)o
(二)重组子遗传分析 • 1.菌液制备: • (1)实验前14-16小时从冰箱保存的斜面菌种挑少量菌,接种于盛有,毫升液体完全培养基的三角烧瓶中,置37℃ 培养过夜。 • (2)第二天取出菌液,分别先吸出2.5毫升菌液,再各加人2.5毫升新鲜的液体培养基,充分摇匀,继续培养3-5小时。 • (3)自温箱取出三角瓶,分别倒入灭菌离心管, 3500转/分离心10分钟。
(4)倒去上清液,打匀沉淀,各加入新鲜的完全液体培养基到原体积。(4)倒去上清液,打匀沉淀,各加入新鲜的完全液体培养基到原体积。 • (5)从W1177与HfrC各取4.5毫升和0.5毫升菌液,放入一个灭菌的经37℃ 预热的三角瓶中,充分摇匀。 • 2.液体培养: • (1)实验开始前,调节两只水浴锅,温度分别为37℃和45℃,并保持恒温。 • (2)将盛混合菌液的三角瓶置于37℃ 水浴中,保温90分钟。 • (3)融化半固体培养基,并取4支灭菌空试管,每支吸入3毫升半固体培养基,于45℃ 水浴保温。
(4)液体培养90分钟后,取出三角瓶,用1毫升吸管吸取0.1毫升混合菌液,放入1支半固体培养基,摇匀,倒入已加Vogel底层的培养皿中,摇匀,凝固后,37℃培养48小时 。 • (5)取HfrC菌离心沉淀,倒去上清液,再离心洗涤三次,打匀沉淀,加入灭菌生理盐水到原体积,用1毫升吸管吸取0.1毫升HfrC菌液,放入半固体培养基,摇匀,倒人已加Vogel底层的培养皿中,摇匀。凝固后,37℃培养48小时,观察是否长菌落。作为对照。重复两皿。
3.重组子的遗传分析 • (1)取2只灭菌的培养皿,倒入Vogel培养基,待凝固后用接种针挑取重组子菌落,依次接种到有Vogel培养基的培养皿上(每皿80个菌落),37℃培养24小时,作影印培养的原始培养皿。 • (2)融化EMB培养基(包括6种糖原)和NaN3培养基,每种培养基倒2只培养皿,共14只培养皿。 • (3)取灭菌的丝绒一块,固定在圆柱形木块上,将原始培养皿倒置覆盖在丝绒上,用笔轻敲皿底。一块丝绒复制2只相同培养基的培养皿。当影印不同培养基的培养皿时,应另换一块灭菌的丝绒,重复操作,直至全部影印完毕。经影印的培养皿,放在37℃培养24小时,观察各种性状出现的比例(图10-1)。
2. 重组子的遗传分析: 3. 根据重组百分数,写出这些基因在染色体上的顺序。