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基礎醫學大樓 R1448. 顯微影像核心 Imaging Core. 黃呈彦. 服務項目 : 儀器設備 離線軟體 敎用以及諮詢 委託操作. 申請及使用資格. 開放時間. 收費標準. 罰則. 螢光顯微鏡 fluorescence Microscopy(Zeiss). Imager A1(A1). Axioplan-2 (A2). Reflector: DAPI , FITC , TRITC. Reflector: DAPI , FITC , TRITC.

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r1448

基礎醫學大樓R1448

顯微影像核心ImagingCore

黃呈彦

slide2

服務項目:儀器設備

離線軟體

敎用以及諮詢

委託操作

申請及使用資格

開放時間

收費標準

罰則

slide3

螢光顯微鏡

fluorescenceMicroscopy(Zeiss)

ImagerA1(A1)

Axioplan-2(A2)

Reflector:DAPI,FITC,TRITC

Reflector:DAPI,FITC,TRITC

Lens:10X,20X,40X100X(oil)

Lens:10X,20X,40X,100X(oil)

Software:PictureFrame

Software:AxioVision

slide4

數位影像整合系統(MicroBrightField)

Reflector:GFP,RFP

Lens:4X,10X,20X,40X(oil),60X(oil),100X(oil)

Software:SI-color,SI-mono,Neurolucida

slide5

活細胞影像系統(LiveImaging)

Leica

ASTEC

LED:GFP

Reflector:DAPI,FITC,TRITC

Lens:10X,20X,40X

Lens:10X

Software:MetaMorph

Software:CCM

slide6

雷射共軛焦顯微鏡

ConfocalMicroscopy(Leica)

SP5

SP2

Laser:405,Ar,HeNe,GreNe

Laser:Ar,HeNe,GreNe

Lens:10X,20X(oil),40X(oil),63X(oil),100X(oil)

Lens:10X,20X,63X(oil)

Software:LASAFLite

Software:LASAFLite

slide7

SP2

SP5

DsRedER

DsRedER+DAPI

DIC

Transmission

slide8

全內反射螢光顯微鏡TIRF+live(Zeiss)

Laser:405,488,561,635

Lens:10X,20X,40X(oil),63X(oil),100X(oil)

Software:AxioVision4.8

Fluorescence

TIRF

slide9

離線軟體(Software)

MetaMorph7.7

AxioVision4.8

ImageProPlus6.0

Volocity(5.5):3Dimagequantitationand4Dtracing

LasAFLiterelease

AxioVision4.8release

slide10

Volocity(PerkinElmer)

Visulization&Restoration:

AllowerstheusertoimportZstacksofflourescentlylabeled2Dimagesacquiredusingaconfocalorwidefieldmicroscopeandcreateaninteractive3Drendering.

PerkinElmer

slide11

Quantitation:

3Dcolocalization,ratioandFRETimagesanalyses.

4D(3Dtimelapse)tracing.

slide12

儀器敎用以及諮詢

教育訓練課程

教學影片出借:

ConfocalSP5

Liveimaging(ASTEC&Leica)

操作手冊

儀器與軟體使用教學與諮詢

slide13

申請及使用資格

儀器開放對象為醫學院與附設醫院各系所及相關研究單位。

親自操作儀器:

參加 教育訓練

R1405 紙本預約

R1448 使用儀器

R1405 交繳費單

夜間使用:

日間使用五次以上且無不良紀錄者

使用儀器時需刷卡進出

R1448 管理員認證

委託操作:

洽R1448管理員預約

研發分處第一共研網頁

http://www.mc.ntu.edu.tw/staff/ard/

slide14

開放時間

日間開放時段:

AM8:30~PM17:00

夜間開放時段:

PM16:30~PM10:30

slide15

收費標準(以1小時為計價單位)

無委託操作。

管理員教學: 每人100/hr

無委託操作。

管理員教學: 每人200/hr

委託操作:200/hr(設定時間)。

管理員教學: 每人200/hr

slide16

委託操作:200/hr

管理員教學: 每人200/hr

管理員教學: 每人500/hr

預約之後因故未使用,並且未於登記使用日前24小時取消預約者,須付50%費用。

slide17

罰則

一、若於預約時段開始15分鐘內未使用,則喪失該時段優先使用權,並視同違約一次,達三次違約者,停止其預約登記權利一個月。

二、有下列情形者計違規一次:

(1 ) 未經教育訓練就自行使用儀器。

(2 ) 以自己名義登記給他人使用。

(3 ) 自行加裝電腦軟硬體或更動系統設定。

(4 ) 違反操作規定第柒項之任一項。

三、違規者第一次口頭警告,第二次取消使用儀器一個月,第三次永久取消儀器使用權。

四、若因自行操作不當造成儀器損壞,則提報研發分處會議議處,使用者即刻停權,並由該實驗室負責人負全部維修與賠償責任,並支付所有費用。

五、其他規定未盡完全者,悉依臺大醫學院研究發展分處第一共同研究室與本校其他相關規定辦理。

slide18

管理員

實機操作與軟體教用,軟硬體設備維護,樣品製備諮詢,夜間與TIRF使用認證,TIRF預約登記

R1448黃呈彦 博士 (88930)

cyh0729@ntu.edu.tw

共軛焦顯微鏡,螢光顯微鏡,數位整合顯微鏡之預約登記,收取繳費單與開立收據,TIRF繳費

R1405李學良 技士 (88505)

活細胞影像系統預約登記,收取繳費單與開立收據

R1405陳佳圓助教(88501)

slide19

致謝第一共研影像核心

We thank the staff of the imaging core at the First Core Labs, National Taiwan University College of Medicine, for technical assistance.

outline
Outline
  • 提供索取生物材料
  • 提供相關技術支援服務
  • 人類疾病模式生物中心服務窗口
slide22

生醫資源中心目前所收集之生物材料種類簡介:

一、各種基因功能分析之質體、載體:(~470個)

(1) 可於細菌、昆蟲及哺乳動物細胞中表現之質體

(2) 可於細胞膜、細胞核、粒腺體…等特定位置標定之質體

(3) 可表現CFP、GFP、YFP、RFP…等質體

(4) 各種基因功能分析之質體

(5) 可表現各種siRNA、miRNA之質體

(6) Adenoviral、lentiviral及retroviral vectors

(7) 酵母菌相關之各種質體

二、細胞株:

(1) 各種適用於轉染及表現特殊蛋白質之細胞株

(2) 哺乳動物之肝癌、乳癌、腸癌、淋巴癌…等細胞株

(3) 血液及神經相關細胞

三、微生物:E.coli competent cell(DH5a and BL21(DE3) ),Staphylococcus及Streptococcus之標準菌株

slide23

四、Yeast two-hybrid cDNA library (pACT2):

(1) human fetal kidney

(2) human fetal liver

(3) Mouse kidney

(4) Mouse liver

(5) Mouse testis

五、抗體:各種自公司購得及7種由院內老師實驗室自製之抗體

88283
資料庫內容將不對外公開, 若您曾提供生物材料至本中心,可來信要求瀏覽資料庫內容陳美麟 小姐,分機 88283
slide25

技術支援服務項目

提供實驗技術教學錄影帶

組織細胞初步培養

篩選基因穩定表現細胞株

純化質體

質體建構

純化蛋白質

酵母菌雙向雜交篩選

建構基因資料庫

mini- /midi- kit

CsCl banding

BL21 (DE3)

Baculovirus

cDNA library

Genomic DNA library

slide28

申請生物材料:

申請人將欲索取之材料的編號告知資料管理員(陳美麟小姐,分機 88283 或 meilinchen0809@gmail.com)。

slide29

申請技術支援服務:

填寫申請書,用電子信件方式寄送到生醫資源中心信箱(email: ltjang@ntu.edu.tw),收件人:詹琍婷。

slide32

台大醫學院第一共同研究室 人類疾病模式生物中心The Center for Human Disease Modeling

人類疾病的酵母菌模式核心實驗室

YeastCore Facility for Human Disease Model

諮詢:鄧述諄博士(微生物所)、李芳仁博士(分子醫學所)

林育誼博士(生物化學暨分子生物學所)

呂金盈醫師(台大醫院檢驗醫學部)

人類疾病的線蟲動物模式核心實驗室C. elegans Core Facility for Human Disease Model諮詢:潘俊良醫師(分子醫學所),詹世鵬博士(微生物所)

人類疾病的果蠅模式核心實驗室

DrosophilaCore Facility for Human Disease Model

諮詢:李秀香博士(分子醫學所)、吳君泰醫師(分子醫學所)

人類疾病的小鼠動物模式核心實驗室

MouseCore Facility for Human Disease Model

諮詢:黃祥博醫師(醫研部)

陳佑宗博士(臨床基因所)

游益興博士、林淑華博士(醫技所)

slide33

服務內容:

人類疾病的酵母菌模式核心實驗室

諮詢及評估。

基因改造。

酵母菌雙向雜交測試。

特殊實驗須面議。

人類疾病的線蟲動物模式核心實驗室

協助線蟲操作之基礎訓練。

協助自國際機構(C. elegans Genetics Center/USA, National BioResource Project/Japan)取得基因變異或基因剔除之線蟲品系。

指導或協助進行線蟲變異表現型之性狀分析。

協助取得線蟲之核糖核酸干擾(RNAi)載體。

指導或協助進行線蟲之核糖核酸干擾實驗。

人類疾病的果蠅模式核心實驗室

果蠅訊息傳遞路徑搜尋工具組幫忙尋找基因功能。

人類疾病的小鼠動物模式核心實驗室

協助完成基因剔除(KO)小鼠。

協助完成基因置入(KI)小鼠。

協助完成表現人類突變基因的小鼠。

協助將自國際機構(KOMP, EUCOMM, NORCOMM etc.)取得的基因剔除 ES 細胞株製成小鼠。

協助完成條件式組織特異基因剔除小鼠(Conditional KO)。

提供雙螢光工具鼠(Dr. 陳佑宗)。

組織細胞分離及初代培養(Dr.游益興)。

slide34

目前路徑搜尋工具組由49個是非題組成

  • Histone (2)
  • CG8445, H2A Dub
  • Poly-Bromo
  • Signaling (11)
  • Notch
  • Hedgehog
  • Wnt
  • EGFR
  • JAK/Stat (Upd)
  • PI3K (CA)
  • mTOR
  • Hippo
  • robo
  • Cell death (4)
  • p53
  • Foxo-p
  • Grim
  • dIAP
  • Protein degradation (4)
  • Proteasome DTS mutant
  • Uba1 RNAi transgenic fly
  • Autophagy (atg1, atg7 RNAi)
  • Microtubule (2)
  • Tau
  • Lis1
  • Cell motility (8)
  • Cdc42 (DN, CA)
  • Rho (DN, CA)
  • Rac (DN, CA)
  • Pak (CA)
  • Myosin light chain
  • Kinases (14)
  • CKI (DN, RNAi)
  • GSK3 (DN, CA)
  • PKA (DN, CA)
  • S6K (Kinase death, CA)
  • Mst
  • LIM domain kinase
  • Vesicle trafficking (2)
  • DN-Rab5
  • DN-dymanin
  • Cell cycle (2)
  • Dp
  • PCNA

1個疾病基因,49個是非題從開始做到完成要

1個助理,每天約1小時,4個月,4000NT

slide36

申請模式生物技術服務:

填寫申請書,用電子信件方式寄送到生醫資源中心信箱(email: ltjang@ntu.edu.tw),收件人:詹琍婷博士。分機:88931