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BEAUCOUP de gènes et PEU d’épistasie

BEAUCOUP de gènes et PEU d’épistasie. Modèle additif multi-locus. Les expériences de réponse à long terme à la sélection. « Illinois Long Term Selection Corn Experiment » Dudley & lambert, 1992. Le polymorphisme permettant une réponse soutenue à la sélection est:.

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BEAUCOUP de gènes et PEU d’épistasie

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Presentation Transcript

  1. BEAUCOUP de gènes et PEU d’épistasie Modèle additif multi-locus

  2. Les expériences de réponse à long terme à la sélection « Illinois Long Term Selection Corn Experiment »Dudley & lambert, 1992.

  3. Le polymorphisme permettant une réponse soutenue à la sélection est: • Infini (modèle infinitésimal) • Caché (linkage) • Régénéré régulièrement (mutations)

  4. Les modèles de réponse à long terme à la sélection Fisher, 1930 Hill, 1982 Weber and Diggins, 1990 Lynch and Walsh, 200x Modèle infinitésimal populations infinies + mutations Réponse à la sélection Yoo, 1980 + dérive génétique Robertson, 1960 Bulmer, 1971 Chevalet, 1988 + linkage Générations (D’après les données de Yoo, 1980)

  5. Le polymorphisme est caché (linkage) • Comment est structuré le polymorphisme sélectionné le long du génome ? • Réserve de polymorphisme dans des segments à forte densité de gènes ? • à court terme / dans une population ? • à long terme ? • Thèse Emmanuelle Della-Chiesa

  6. X2 sélection X1 Effet Bulmer (1971) X2 P=seuil P=X1+X2 Cov(X1,X2)<0 X1 P= G + E = iXi + E Var(G) = i Var(Xi) + ij Cov(Xi , Xj) Var(G)= Vg + C (C<0) La variance disponible pour la sélection est réduite

  7. Déséquilibre de liaison entre paires de locus « moins fortement » négatif entre locus éloignés « fortement » négatif entre locus proches

  8. Effet Hill-Robertson (1966) Dérive génétique+ Liaison+ Sélection des allèles favorables Augmentation de la probabilité de fixation des allèles défavorables

  9. La recombinaison restaure la variance « cachée » • recombinaison • mutation? Hospital & Chevalet, Genetical Research, 1996.

  10. t=0 t=0 • Distances entre locus • Répartition aléatoire du polymorphisme • Répartition observée sous sélection t=50 t=50 AVEC MUTATION SANS MUTATION t=200 t=200 Indice d’agrégation au cours du temps

  11. Structuration du polymorphisme sélectionné • A court terme, agrégation transitoire du polymorphisme dans une population • Importance en sélection artificielle (SAM) • Faible impact sur le maintien du polymorphisme avec mutation-sélection • Fixations successives de mutations +/- indépendantes • Effets sur la divergence entre populations ?

  12. Croisement Détection QTL Lignée H’ population Lignée H sélection Croisement Détection QTL Lignée L Impact de l’histoire sélective des populations sur l’architecture apparente des caractères quantitatifs Divergence entre lignées HH’:

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