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Molecular Characterization of Plant Transcription Factors: MADS-box, NAC, and bZIP Families

This study explores the intricate roles of key transcription factor families in plants, specifically focusing on MADS-box, NAC, and bZIP proteins. These families are critical for various developmental and stress response processes. Using high-throughput sequencing data, we analyze gene expression patterns and identify novel interactions among these factors. Our findings enhance the understanding of plant regulatory mechanisms, offering insights into genetic pathways that govern growth and stress resilience in plants.

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Molecular Characterization of Plant Transcription Factors: MADS-box, NAC, and bZIP Families

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Presentation Transcript

  1. MADS box GDEF1 MYB_1 YABBY_2 MADS-box_GDEF1 YABBY2 myb1 myb1 YABBY_2 YABBY_2 0,3 0,3 0,6 0,6 0 0 66 66 90 90 114 114 120 120 122 123 -0,1 - 0,1 0,2 0,2 -0,2 - 0,2 0,4 0,4 0,1 0,1 -0,3 - 0,3 -0,4 - 0,4 0 0 0,2 0,2 66 66 90 90 114 114 120 120 123 123 -0,5 - 0,5 -0,1 - 0,1 -0,6 - 0,6 0 0 66 66 90 90 114 114 120 120 122 123 -0,2 - 0,2 -0,7 - 0,7 TDR4 NAC AP2 TDR4 NAC_domain NAC_domain AP2 AP2 TDR_4 0,2 0,2 0,2 0,2 0,2 0,2 0,1 0,1 0,1 0,1 0,1 0,1 0 0 0 0 0 0 66 66 90 90 114 114 120 120 123 123 66 66 90 90 114 114 120 120 123 123 66 66 90 90 114 114 120 120 122 123 -0,1 - 0,1 -0,1 - 0,1 -0,1 - 0,1 -0,2 - 0,2 -0,2 - 0,2 -0,2 - 0,2 -0,3 - 0,3 -0,3 - 0,3 -0,3 - 0,3 -0,4 - 0,4 -0,4 - 0,4 -0,4 - 0,4 -0,5 - 0,5 -0,5 - 0,5 -0,5 - 0,5 WIZZ squamosa jasmonic acid 1 squamosa WIZZ jasmonic acid 1 WIZZ squamosa jasmonic acid 1 0,2 0,2 0,2 0,2 0,2 0,2 0,1 0,1 0,1 0,1 0,1 0,1 0 0 0 0 66 66 90 90 114 114 120 120 123 123 66 66 90 90 114 114 120 120 122 123 -0,1 - 0,1 -0,1 - 0,1 0 0 66 66 90 90 114 114 120 120 123 123 -0,2 - 0,2 -0,2 - 0,2 -0,3 - 0,3 -0,3 - 0,3 -0,1 - 0,1 -0,4 - 0,4 -0,4 - 0,4 -0,5 - 0,5 -0,5 - 0,5 -0,2 - 0,2 bHLH bZIP bell-like bZIP bHLH bell-like bHLH bZIP bell - like 0,6 0,6 0,1 0,1 0,4 0,4 0,3 0,3 0 0 0,4 0,4 66 66 90 90 114 114 120 120 123 123 0,2 0,2 -0,1 - 0,1 0,1 0,1 0,2 0,2 0 0 -0,2 - 0,2 66 66 90 90 114 114 120 120 123 123 -0,1 - 0,1 0 0 -0,3 - 0,3 66 66 90 90 114 114 120 120 123 123 -0,2 - 0,2 -0,2 - 0,2 -0,4 - 0,4 -0,3 - 0,3 homeodomain WRKY WIZZ wizz homeodomain WRKY homeodomain WRKY wizz 0,2 0,2 0,4 0,4 0,25 0,25 0,2 0,2 0,3 0,3 0,1 0,1 0,15 0,15 0,2 0,2 0,1 0,1 0 0 66 66 90 90 114 114 120 120 123 123 0,05 0,05 0,1 0,1 -0,1 - 0,1 0 0 66 66 90 90 114 114 120 120 123 123 0 0 -0,05 - 0,05 66 66 90 90 114 114 120 120 123 123 -0,2 - 0,2 -0,1 - 0,1 -0,1 - 0,1 -0,15 - 0,15 -0,3 - 0,3 -0,2 - 0,2 -0,2 - 0,2 -0,4 - 0,4 -0,3 - 0,3 -0,25 - 0,25 homeodomain homeobox AP2 homeobox homeodomain AP2 homeodomain homeobox AP2 0,2 0,2 0,4 0,4 0,2 0,2 0,1 0,1 0,1 0,1 0,3 0,3 0 0 0 0 0,2 0,2 66 66 90 90 114 114 120 120 123 123 66 66 90 90 114 114 120 120 123 123 -0,1 - 0,1 -0,1 - 0,1 0,1 0,1 -0,2 - 0,2 -0,2 - 0,2 0 0 -0,3 - 0,3 66 66 90 90 114 114 120 120 123 123 -0,3 - 0,3 -0,1 - 0,1 -0,4 - 0,4 -0,4 - 0,4 -0,2 - 0,2 -0,5 - 0,5

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