토양 미생물 과 생화학

1. 토양 미생물과 생화학

2. Index 토양 미생물 군집의 유전적 다양성 생각해봅시당 토양 토양 미생물 군집의 생화학 대사 다양성

3. 1 토양

4. 토양이란? 생물의 생육에 필요한 영양원을 자연적으로 제공하는 광물 혹은 유기물질이며 이들과 연결되어 있는 생명체의 생화학적인 대사에 의해 영속적으로 변화되는 과정을 거치고 있는 생명의 모체

5. Contents 토양미생물이란? 토양 미생물은 생태계의 물질순환과 식물의 생육에 영향을 미치며 토양 내에 축적된 유기물을 분해하거나 생산하는 역할을 한다. 특히 탄소, 질소, 인, 황과 같은 물질 순환에 중요하게 관여하기 때문에 산림생태계를 구성하는 매우 중요한 요소이며 일차분해자로서의생태적 지위를 통해 다양한 영양원의 분해 및 순환에 깊이 관여하여 식생의 생장과 토양의 비옥도에 지대한 영향을 끼친다. -> 겁나게 쓸모있다.

6. 2 토양 미생물 군집의 생화학 대사 다양성

7. Contents 최근 연구 방향 최근 미생물 군집의 다양성 분석은 유전적 다양성과 생리생화학적 대사 다양성의 양면으로 연구의 방향이 나아가고 있다.

8. Contents 미생물의 생화학적 분석 미생물 군집의 생리생화학적 다양성 분석은 크게 지방산 분석을 통한 군집 내 종조성의 구조적 변화분석과 유일탄소원의이용능 정도를 분석지표로 사용한 미생물 군집의 대사적 다양성 분석으로 나눌 수 있다.

9. Contents 미생물의 생화학적 분석 GN2 microplate 96개의 well 안에는 95개의 기질이 들어있다. 각 기질의 well에는 2,3,5-triphenyltetrazolium chloride(TTC) 가 있는데, 접종된 미생물들이 탄소원을 이용해 산화시키면 TTC는 불용성의 Triphenylformuzan(TPF)로 환원되고, 이는 보라색의 색을 띈다.

10. 3 토양 미생물 군집의 유전적 다양성

11. Contents 미생물의 유전적 다양성 분석 미생물 군집의 유전적 다양성은 그들이 갖고 있는 DNA의 이질성으로부터 결정할 수 있다. -DNA의 염기서열 차이에 따른 2차구조의 변화 또는 이중나선의 구조적 변화를 분석하는 SSCP와 DGGE의 패턴 분석 -최근에는 DGGE에 의한 16S rDNA패턴을 이용한 미생물 군집의 유전적 다양성분석이 미생물 생태학 연구에 광범위하게 적용되고 있다.

12. Contents 미생물의 유전적 다양성 분석 DGGE는 Denaturing Gradeint Gel Electrophoresis 분석을 의미한다. 동일한 유전자 DNA 나타나는 염기서열의 차이, 즉 mutation 과 polymorphism 등을 알아보는데 사용된다.

13. Contents 미생물의 유전적 다양성 분석 토양 미생물 DNA로부터 계통분류학적으로 고유한 특성을 가진 16S rDNA를 이용한다. 특히 이 DNA중에서 가장 다양하게 나타나고 일반적으로 연구되는 V3부분을 이용해 연구를 진행한다.

14. Contents 미생물의 유전적 다양성 분석 1. 16S rDNA를 PCR을 통해 증폭시킨다. 2. 증폭된 걸 주형으로 nest PCR을 실시한다. 3. 이렇게 정제된 것을 DGGE를 통해 유전적 다양성을 분석한다.

15. 제가 모르겠으니 패스 Q& A

16. 생각해봅시당 수 많은 미생물들의 생화학적 특성을 검사할 수 있는 다른 방법 토양 미생물의 활용

17. Thank you