1 / 29

REGIONAL SPECIALISED COLLECTION OF

Комитет Государственной Думы по науке и наукоемким технологиям. Круглый стол. 09.06.2011. ПРЕДЛОЖЕНИЯ ПО РАЗВИТИЮ ГОСУДАРСТВЕННОЙ ПОДДЕРЖКИ СПЕЦИАЛИЗИРОВАННЫХ ЦЕНТРОВ МИКРОБНЫХ ГЕНЕТИЧЕСКИХ РЕСУРСОВ И.Б. Ившина Институт экологии и генетики микроорганизмов УрО РАН

nellie
Download Presentation

REGIONAL SPECIALISED COLLECTION OF

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Комитет Государственной Думы по науке и наукоемким технологиям. Круглый стол. 09.06.2011 ПРЕДЛОЖЕНИЯ ПО РАЗВИТИЮ ГОСУДАРСТВЕННОЙ ПОДДЕРЖКИ СПЕЦИАЛИЗИРОВАННЫХ ЦЕНТРОВ МИКРОБНЫХ ГЕНЕТИЧЕСКИХ РЕСУРСОВ И.Б. Ившина Институт экологии и генетики микроорганизмов УрО РАН Пермский государственный университет Россия, 614081Пермь, ул. Голева, 13. Тел.: +7 (342) 280 81 14. Е-mail: ivshina@iegm.ru REGIONAL SPECIALISED COLLECTION OF ALKANOTROPHIC MICROORGANISMS

  2. Основные положения Специализированные центры микробных генетических ресурсов − ключевой элемент инфраструктуры российской биотехнологии и биоиндустрии Необходимые действия по обеспечению и развитию государственной поддержки специализированных центровмикробных генетических ресурсов 2

  3. МИКРОБНЫЕ ГЕНЕТИЧЕСКИЕ РЕСУРСЫ: международные инициативы Концепция Биологических Ресурсных Центров - BRCs Международнаяприоритетная программа DIVERSITAS Конвенцияо биологическом разнообразии – CBD Глобальная информационная система по биоразнообразию - GBIF Международная программа доступа к микроорганизмам - MOSAICC 3

  4. Organization for Economic Co-operation and Development (OECD): Biological Resource Centres Underpinning the future of Life Sciences and Biotechnology. OECD Science & Information Technology. 2001. V. 2001. N. 7. Р. 1-68. . Организация по Экономическому Сотрудничеству и Развитию (ОЭСР) 2001 г.Концепция «Биологические Ресурсные Центры» БРЦ– хранилища и провайдеры высококачественного биологического материала и ценной информации. В соответствии с требованиями времени принимают на себя функции предоставления услуг не только в сфере консервациии распределениябиотехнологически ценных микробныхкультур, но и полезной научной информации по вопросам, отражающим текущую ситуацию в микробном разнообразии и перспективах его использования в различных областях биотехнологии. 4

  5. World Directory of Collections of Cultures of MicroorganismsWDCM STATISTICSDATE: June 2, 2011 There are 592culture collections in 68 countries registered with WDCM 227 collections produce catalogues of holdings3,051 people work in these culture collections There are totally 1,751,439 microorganisms in the above culture collections: 760,874 of them are bacteria506,408 of them are fungi18,743of them are virus11,649 of them are cell line 5

  6. WFCC#644, KMM Коллекция морских микроорганизмов Владивосток 4000 штаммов бактерий 1000 штаммов грибов WFCC#588, VKPM Всероссийская коллекция промышленных микроорганизмов, Москва 10000 штаммов бактерий 750 штаммов грибов 2300 штаммов дрожжей WFCC#342, VKM Всероссийская коллекция микроорганизмов, Пущино 3662 штаммов бактерий 3355 штаммов грибов 2300 штаммов дрожжей Российские коллекции культур, зарегистрированные в WFCC WFCC#337, RIA Коллекция культурГНЦА Москва 1558 штаммов бактерий 394 штамма грибов WFCC#641, PGC Петергофская коллекция водорослей, С.-Петербург 700 штаммов водорослей WFCC#760, VIZR Государственная коллекция энтомопатогенных и фитопа-тогенных микроорганизмов Санкт-Петербург 765 штаммов бактерий 11 штаммов грибов WFCC#966, RCAM Всероссийская коллекция с/х микроорганизмов , Санкт-Петербург 3926 штаммов бактерий 671 штамм грибов, 184 штамма дрожжей WFCC#554, LTI Криобанк микроорганизмов - деструкторов, С.-Петербург 250 штаммов бактерий 65 штаммов грибов 8 штаммов дрожжей

  7. WFCC#974, EMTC Коллекция экстремофильных микроорганизмов и типовых культур, Новосибирск 747 штаммов бактерий 74 штамма вирусов WFCC#836, CCIBSO Коллекция светящихся микроорганизмов Красноярск 700 штаммов бактерий WFCC#461, CALU Коллекция водорослей, Санкт-Петербург 704 штамма водорослей 22 штамма грибов Российские коллекции культур, зарегистрированные в WFCC WFCC#602, BOROK Коллекция водорослей, Ярославская обл. 15 штаммов водорослей WFCC#936, ACCS Коллекция культур водорослей, Красноярск 90 штаммов бактерий WFCC#596, IPPAS Коллекция штаммов и мутантов одноклеточных водорослей, Москва 300 штаммов водорослей 30 штаммов бактерий WFCC#768, IEGM Региональная коллекция алканотрофных микроорганизмов, Пермь 2000 штаммов актинобактерий WFCC#890, CIAM Коллекция микроорганизмов с/х назначения , С.-Петербург 3926 штаммов бактерий 671 штамм грибов 184 штамма дрожжей

  8. Коллекции микробных культур Сервисные – предназначены для сохранения эталонных/типовых культур известных видов микроорганизмов. Специализированные– предназначены для сохранения микроорганизмов конкретной таксономической группы и их ценных биотехнологических свойств. Исследовательские– предназначены для сохранения штаммов определенных видов для использования их преимущественно в узкоспециальных научно-поисковых проектах. 8

  9. REGIONAL SPECIALISED COLLECTION OF ALKANOTROPHIC MICROORGANISMS 9

  10. Микробиология1995, 50, 709-711;1998, 53, 681-685. Нефтяное хозяйство, 1998, 11, 44-46. Журнал прикладной биохимиии и микробиологии, 1999, 70, 2076-2079. Химия в интересах устойчивого развития, 2000, 8, 693-698. Mendeleev Commun., 2005, 11, 72-73. Экология, 2008, 1, 69-71. Soil & Sediment Contamination, 2009, 12, 85-99. Биотехнология 2010, 1, 49-56. МЕТАБОЛИЗИРУЕМЫЕ ПОЛЛЮТАНТЫ REGIONAL SPECIALISED COLLECTION OF ALKANOTROPHIC MICROORGANISMS 10

  11. БИОРАЗНООБРАЗИЕ СОХРАНЯЕМЫХ БАКТЕРИАЛЬНЫХ КУЛЬТУР Rhodococcus Gordonia Dietzia Nocardia Micrococcus Kocuria Dermacoccus Tsukamurella REGIONAL SPECIALISED COLLECTION OF ALKANOTROPHIC MICROORGANISMS 11

  12. REGIONAL SPECIALISED COLLECTION OF ALKANOTROPHIC MICROORGANISMS 12

  13. REGIONAL SPECIALISED COLLECTION OF ALKANOTROPHIC MICROORGANISMS 13

  14. REGIONAL SPECIALIZED COLLECTION OF ALKANOTROPHIC MICROORGANISMS Биодеструкция органических загрязнителей: углеводородов, растворителей, ПАВ, нефти и нефтепродуктов Получение белка, аминокислот, иммуномодуляторов, ферментов, биополимеров, биосурфактантов Биоремедиация нефтезагрязненной воды и почвы Нефтегазопоисковые работы (биоиндикаторы залежей нефти и газа) Биомониторинг углеводородного загрязнения биосферы Интенсификация вторичной добычи нефти 14

  15. ДЕТЕКЦИЯ И КОЛИЧЕСТВЕННОЕ ОПРЕДЕЛЕНИЕ ВИДОВОГО СОСТАВА RHODOCOCCUSВ ПРИРОДНЫХ ОБРАЗЦАХ МЕТОДОМ НЕПРЯМОЙ ИММУНОФЛУОРЕСЦЕНЦИИ, клеток/мл(г) 15

  16. Технологическая схема биоремедиации (Патенты РФ № 2193464; 2180276) 16

  17. Постановление от 10 марта 2009 г. № 221 «О присуждении премий Правительства Российской Федерации 2008 года в области науки и техники» РАЗРАБОТКА И ВНЕДРЕНИЕ КОМПЛЕКСА БИОТЕХНОЛОГИЙ И СИСТЕМ ВОССТАНОВЛЕНИЯ И ЗАГРЯЗНЕННЫХ УГЛЕВОДОРОДАМИ ТУНДРОВЫХ И СЕВЕРО-ТАЕЖНЫХ БИОГЕОЦЕНОЗОВ Выдвигающая организация Институт экологии и генетики микроорганизмов Уральского отделения Российской академии наук 17

  18. Ликвидация последствий Усинской катастрофы в Республике Коми - самого крупного в мире аварийного разлива сырой нефти Фрагмент загрязненного участка ДОПОСЛЕ восстановительных работ 18

  19. В ходе ликвидации аварии разработаны и внедрены высокоэффективные технологии экологической реабилитации северных территорий с применением методов биоремедиации 19

  20. Уровень 1 Городской биологический лицей (10-11 кл.) Коллекция - научно-образовательный центр Уровень 4 Предприятия и учреждения региона Уровень 3 Аспирантура ПГУ и ИЭГМ УрО РАН Уровень 2 Кафедра микробиологии и иммунологии ПГУ 20

  21. 1 ( Kruse 1896) Rhodococcus ruber Goodfellow and Alderson 1977 ¬ IEGM 333 I.B. Ivshina , IEGM, О EGM 27 - П . 3 4 5 underground water , oilfield outline zone, Perm region, Isolated from : 6 Russia . 7 [1, 3 , 5 , 10] . 9 Taxonony /description uses propane, - butane, liquid alkanes (C - C ) and Properties: n n - 5 16 alyphatic alcohols (ethanol, - propanol , - butanol ) as sole carbon n n source [10] ; resistant to lincomycin , oxacillin , erythromycin and 9 nalidixic acid when growing on propane [6] ; accumulates 9 polyphosphate granules when growing on propane [2, 7] ; synthesizes 9 functional antigens when growing on propane [9] . 9 (Medium 5 or 8, 15; 28 C; L - 3, C - 4) . o 8 REGIONAL SPECIALISED COLLECTION OF ALKANOTROPHIC MICROORGANISMS http://www.ecology.psu.ru/iegmcol/strains/rhodoc/ruber/r_ruber333.html 21

  22. REGIONAL SPECIALISED COLLECTION OF ALKANOTROPHIC MICROORGANISMS Every established Collection requires a Catalogue 22

  23. ОРГАНИЗАЦИИ/ПОЛЬЗОВАТЕЛИ REGIONAL SPECIALISED COLLECTION OF ALKANOTROPHIC MICROORGANISMS 23

  24. Вывоз коллекционных штаммов за границу по заявкам пользователей 24

  25. Нашакоманда 25

  26. ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ ОСНОВНЫХ НАПРАВЛЕНИЙ РАБОТЫ ПО ИЗУЧЕНИЮ И СОХРАНЕНИЮ МИКРОБНОГО ГЕНОФОНДА Отборприродных образцов, выделение и сбор штаммов Идентификация(с использованием современных методов бактериальной таксономии) Обучающие курсы по выделению, культивированию, идентификации, методам хранения Компьютеризованные базы данных Исследование Оценка биотехнологического потенциала Сохранение (усовершенствование известных и разработка новых методов хранения) Программы по сохранению микробного разнообразия Сотрудничество с другими коллекциями, обмен культурами Обеспечение непрерывности в передаче штаммов и полезной информации о них ALKANOTROPHIC MICROORGANISMS 26

  27. Проблемы биологических ресурсных центров • Адекватное комплектование штата. • Адекватное обеспечение рабочими помещениями и оборудованием. • Информационный обмен и передача знаний посредством разработки баз данных. • Пути ускорения процесса обмена культурами через гармонизацию правил выдачи культур. • Финансовое «здоровье» и финансовая стабильность (государственная и частная помощь; доходы, получаемые коллекций; исследовательские контракты). 27

  28. ПРЕДЛОЖЕНИЯ по развитию государственной поддержки микробных коллекций • Разработка системы оценок и идентификация коллекций. • Формирование национальных центров микробных генетических ресурсов с целевым долгосрочным финансированием. • Принятие законао микробных генетических ресурсах. • Формирование национального коллекционного фонда микробных ресурсов для биотехнологии. • Совершенствование правовой базы в разделах: доступ к микробных генетическим ресурсам, защита прав интеллектуальной собственности, справедливоераспределениеприбылей от использования ресурсов в ходе биотехнологических разработок. 28

  29. Никому не нужен… Где я найду этот микроб ? Соединить воедино микро- и макро- организм R.ruber-007 В коллекции алканотрофов 29

More Related